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酰基转移酶(显示信息)
酶委员会(EC)每个酶都有一个四位数的EC编号,前三位数定义了催化的反应,第四位数是唯一的标识符(序列号)。每种酶都有一个系统名称,唯一地定义了所催化的反应。为了导航EC的层次结构,我们显示所有母公司EC条款按照与当前期限的最短距离排序的当前EC利息期限。也,仅直接子EC术语列出了当前EC术语的。
蛋白质结构分类(SCOP)SCOP将进化相关领域划分为超级家族水平和家庭级别。因此,我们为这三个概念中的每一个在两个域级别上生成了以域为中心的EC注释。
结构域酶委员会本体论(SDEO)作为以领域为中心的本体,SDEO仅指那些注释SCOP领域信息量最大的EC术语。
SCOP域的EC注释有关详细信息,请访问文档:SCOP域的EC注释其中,我们提供了几个相关文件(数据可用性)用于下载,包括注释文件(即。,域2EC.txt)和相应的本体(即。,SDEO.txt文件).
超域酶委员会本体(SPEO)作为扩展,SPEO包括那些EC术语,这些术语信息最丰富,可以在超级家族级别。
超域的EC注释有关详细信息,请访问文档:超域的EC注释其中,我们提供了几个相关文件(数据可用性)用于下载,包括注释文件(即。,SP2EC文本)以及本体(即。,SPEO.txt文件). 为了便于浏览,下面列出了那些超域(单域、双域、三域、四域)。
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根:EC层次结构(来自IntEnz版本70)
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超级家族(显示详细信息)
本EC术语注释的超家族域(不在SDEO中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些
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家庭(显示详细信息)
注释到此的族域(不在SDEO中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些
在系统发育树上为超级家族和/或家庭本EC术语注释的域
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将树绘制为:
| | 下载Newick格式树:
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(显示帮助)
树木依据树向量
使用蛋白质结构域和超结构域生成存在/缺失矩阵超级家族中的所有基因组。这个RAxML公司该软件用于生成一个单一的大型树状拓扑,使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果单独生产了树木。然而,该数据是从单个一棵大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。
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超域(包括单个超家族)(显示详细信息)
(显示详细信息)
本EC术语注释的超域(SPEO级别:信息量适中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
N到C端子顺序的超域(双工) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
47005,52777 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
52777,52777 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
81296,54001 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
52210,51735 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
69593,47473 69593 -3-磷酸甘油(1)-酰基转移酶 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
53901,53901 53901 -类硫醇 53901 -类硫醇 | 0 | 直接 |
51569,89000 51569 -醛缩酶 89000 -后HMGL域类 | 0 | 直接 |
53448,51161 53448 -核苷酸二磷酸糖转移酶 51161 -Trimeric LpxA-like酶 | 0 | 直接 |
51735,47336 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 47336 -类ACP | 0 | 直接 |
57850,57933 57850 -环/U形盒 57933 -TAZ域 | 0 | 直接 |
51230,47005 51230 -单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 | 0 | 直接 |
46785,57903 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0 | 直接 |
52540,75138 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 75138 -HprK N端域样 | 0 | 直接 |
51230,52777 51230 -单杂交图案 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
52540,55729 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
102114,55729 102114 -自由基SAM酶 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
89000,110921 89000 -后HMGL域类 110921 -2-异丙基苹果酸合成酶LeuA,变构(二聚)结构域 | 0 | 直接 |
54637,52151 54637 -硫酯酶/硫醇酯脱水异构酶 52151 -FabD/溶血磷脂酶样 | 0 | 直接 |
55729,47370 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 47370 -溴代甲烷 | 0 | 直接 |
57850,57850 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
55729,55729 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
51735,48256 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 48256个-柠檬酸合成酶 | 0 | 直接 |
52151,55048 52151 -FabD/溶血磷脂酶样 55048 -丙二酰-CoA-ACP转酰酶的可能ACP-结合域 | 0 | 直接 |
69593,56801 69593 -3-磷酸甘油(1)-酰基转移酶 56801 -乙酰-CoA合成酶样 | 0 | 直接 |
53633,55729 53633 -氨基甲酸激酶样 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
49309,49309 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
47459,55785 47459 -HLH,螺旋-环-螺旋DNA-结合域 55785 -类PYP传感器域(PAS域) | 0 | 直接 |
51569,54909 51569 -醛缩酶 54909 -二聚体α+β桶 | 0 | 直接 |
55729,46589 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 46589 -tRNA结合臂 | 0 | 直接 |
54160,55729 54160 -类色度域 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
51735,51735 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
51230,51230 51230 -单杂交图案 51230 -单杂交图案 | 0 | 直接 |
75138,53659 75138 -HprK N端域样 53659 -异柠檬酸/苹果酸异丙酯脱氢酶类 | 0 | 直接 |
55112,55112 55112 -甲酰甲烷呋喃:四氢甲烷蝶呤甲酰转移酶 55112 -甲酰甲烷呋喃:四氢甲烷蝶呤甲酰转移酶 | 0 | 直接 |
53901,55718 53901 -类硫醇 55718 -类SCP | 0 | 直接 |
46589,55729 46589 -tRNA结合臂 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
54001,49309 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
47336,53474 47336 -类ACP 53474 -α/β水解酶类 | 0.00000000009644 | 直接 |
47336,52777 47336 -类ACP 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0.0002122 | 直接 |
55785,55785 55785 -类PYP传感器域(PAS域) 55785 -类PYP传感器域(PAS域) | 0.007373 | 继承自:组蛋白乙酰转移酶||氨基以外的转移基团 |
57903,57903 57903 -FYVE/PHD锌指 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0.03575 | 继承自:组蛋白乙酰转移酶||氨基以外的转移基团 |
51735,50129 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 50129 -格鲁斯风格 | 0.2929 | 继承自:β-酮酰基载体蛋白合成酶I |
56059,52210 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 | 0.7303 | 继承自:ATP柠檬酸合成酶||转移时酰基转化为烷基 |
50129,51735 50129 -格鲁斯风格 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0.8757 | 继承自:脂肪酸合成酶||[酰基载体蛋白]S-丙二酰转移酶||[酰基载体蛋白]S-乙酰转移酶||β-酮酰基-酰基-载体蛋白合成酶I |
50249,55681 50249 -核酸结合蛋白 55681 -II类aaRS和生物素合成酶 | 1 | 继承自:赖氨酸转移酶||氨酰转移酶类 |
52467,52518 52467 -类DHS NAD/FAD结合域 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) | 1 | 继承自:硫乙醛乙酰转移酶 |
52518,52467 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) 52467 -类DHS NAD/FAD结合域 | 1 | 继承自:硫乙醛乙酰转移酶 |
N到C端子顺序的超域(双工) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
47005,52777 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
52777,52777 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
81296,54001 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
52210,51735 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
69593,47473 69593 -3-磷酸甘油(1)-酰基转移酶 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
53901,53901 53901 -类硫醇 53901 -类硫醇 | 0 | 直接 |
51569,89000 51569 -醛缩酶 89000 -后HMGL域类 | 0 | 直接 |
53448,51161 53448 -核苷酸二磷酸糖转移酶 51161 -Trimeric LpxA-like酶 | 0 | 直接 |
51735,47336 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 47336 -类ACP | 0 | 直接 |
57850,57933 57850 -环/U形盒 57933 -TAZ域 | 0 | 直接 |
51230,47005 51230 -单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 | 0 | 直接 |
46785,57903 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0 | 直接 |
52540,75138 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 75138 -HprK N端域样 | 0 | 直接 |
51230,52777 51230 -单杂交图案 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
52540,55729 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
102114,55729 102114 -自由基SAM酶 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
89000,110921 8.9万-后HMGL域类 110921 -2-异丙基苹果酸合成酶LeuA,变构(二聚)结构域 | 0 | 直接 |
54637,52151 54637 -硫酯酶/硫醇酯脱水异构酶 52151 -FabD/溶血磷脂酶样 | 0 | 直接 |
55729,47370 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 47370 -溴代甲烷 | 0 | 直接 |
57850,57850 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
55729,55729 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
51735,48256 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 48256个-柠檬酸合成酶 | 0 | 直接 |
52151,55048 52151 -FabD/溶血磷脂酶样 55048 -丙二酰-CoA-ACP转酰酶的可能ACP-结合域 | 0 | 直接 |
69593,56801 69593 -3-磷酸甘油(1)-酰基转移酶 56801 -乙酰-CoA合成酶样 | 0 | 直接 |
53633,55729 53633 -氨基甲酸激酶样 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
49309,49309 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
47459,55785 47459 -HLH,螺旋-环-螺旋DNA-结合域 55785 -类PYP传感器域(PAS域) | 0 | 直接 |
51569,54909 51569 -醛缩酶 54909 -二聚体α+β桶 | 0 | 直接 |
55729,46589 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 46589 -tRNA结合臂 | 0 | 直接 |
54160,55729 54160 -类色度域 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
51735,51735 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
51230,51230 51230 -单杂交图案 51230 -单杂交图案 | 0 | 直接 |
75138,53659 75138 -HprK N端域样 53659 -异柠檬酸/苹果酸异丙酯脱氢酶类 | 0 | 直接 |
55112,55112 55112 -甲酰甲烷呋喃:四氢甲烷蝶呤甲酰转移酶 55112 -甲酰甲烷呋喃:四氢甲烷蝶呤甲酰转移酶 | 0 | 直接 |
53901,55718 53901 -类硫醇 55718个-类SCP | 0 | 直接 |
46589,55729 46589 -tRNA结合臂 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
54001,49309 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
47336,53474 47336 -类ACP 53474 -α/β水解酶类 | 0.00000000009644 | 直接 |
47336,52777 47336 -类ACP 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0.0002122 | 直接 |
55785,55785 55785 -类PYP传感器域(PAS域) 55785 -类PYP传感器域(PAS域) | 0.007373 | 继承的 |
57903,57903 57903 -FYVE/PHD锌指 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0.03575 | 继承的 |
51735,50129 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 50129 -格鲁斯风格 | 0.2929 | 继承的 |
56059,52210 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 | 0.7303 | 继承的 |
50129,51735 50129 -格鲁斯风格 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0.8757 | 继承的 |
50249,55681 50249 -核酸结合蛋白 55681 -II类aaRS和生物素合成酶 | 1 | 继承的 |
52467,52518 52467 -类DHS NAD/FAD结合域 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) | 1 | 继承的 |
52518,52467 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) 52467 -类DHS NAD/FAD结合域 | 1 | 继承的 |
(显示详细信息)
本EC术语注释的超域(SPEO级别:信息量适中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
N到C端子顺序的超域(三重) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
55729,46589,55729 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 46589 -tRNA结合臂 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
51735,51735,47336 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 47336 -类ACP | 0 | 直接 |
57850,57850,57933 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 57933 -TAZ域 | 0 | 直接 |
46785,57903,57903 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 57903 -FYVE/PHD锌指 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0 | 直接 |
51230,51230,47005 51230 -单杂交图案 51230 -单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 | 0 | 直接 |
51569,89000,110921 51569 -醛缩酶 89000 -后HMGL域类 110921 -2-异丙基苹果酸合成酶LeuA,变构(二聚)结构域 | 0 | 直接 |
51230,47005,52777 51230 -单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
47459,55785,55785 47459 -HLH,螺旋-环-螺旋DNA-结合域 55785 -类PYP传感器域(PAS域) 55785 -类PYP传感器域(PAS域) | 0 | 直接 |
51735,50129,51735 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 50129 -格鲁斯风格 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
53901,53901,55718 53901 -类硫醇 53901 -类硫醇 55718 -类SCP | 0 | 直接 |
50129,51735,51735 50129 -格鲁斯风格 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
52540,75138,53659 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 75138 -HprK N端域样 53659 -异柠檬酸/苹果酸异丙酯脱氢酶类 | 0 | 直接 |
52210,51735,48256 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 48256个-柠檬酸合成酶 | 0 | 直接 |
54001,49309,49309 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
81296,54001,49309 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
56059,52210,51735 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
51735,47336,53474 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 47336 -类ACP 53474 -α/β水解酶类 | 0 | 直接 |
47336,52777,52777 47336 -类ACP 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0.0002122 | 直接 |
52518,52467,52518 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) 52467个-类DHS NAD/FAD结合域 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) | 1 | 继承自:硫乙醛乙酰转移酶 |
N到C端子顺序的超域(三重) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
55729,46589,55729 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) 46589 -tRNA结合臂 55729 -酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat) | 0 | 直接 |
51735,51735,47336 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 47336 -类ACP | 0 | 直接 |
57850,57850,57933 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 57933 -TAZ域 | 0 | 直接 |
46785,57903,57903 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 57903 -FYVE/PHD锌指 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0 | 直接 |
51230,51230,47005 51230 -单杂交图案 51230 -单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 | 0 | 直接 |
51569,89000,110921 51569 -醛缩酶 89000 -后HMGL域类 110921 -2-异丙基苹果酸合成酶LeuA,变构(二聚)结构域 | 0 | 直接 |
51230,47005,52777 51230 -单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
47459,55785,55785 47459 -HLH,螺旋-环-螺旋DNA-结合域 55785 -类PYP传感器域(PAS域) 55785 -类PYP传感器域(PAS域) | 0 | 直接 |
51735,50129,51735 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 50129 -格鲁斯风格 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
53901,53901,55718 53901 -类硫醇 53901 -类硫醇 55718 -类SCP | 0 | 直接 |
50129,51735,51735 50129 -格鲁斯风格 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
52540,75138,53659 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 75138 -HprK N端域样 53659 -异柠檬酸/苹果酸异丙酯脱氢酶类 | 0 | 直接 |
52210,51735,48256 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 48256 -柠檬酸合成酶 | 0 | 直接 |
54001,49309,49309 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
81296,54001,49309 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0 | 直接 |
56059,52210,51735 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样 52210 -琥珀酰辅酶A合成酶结构域 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 | 0 | 直接 |
51735,47336,53474 51735 -NAD(P)-结合Rossmann-fold域 47336 -类ACP 53474 -α/β水解酶类 | 0 | 直接 |
47336,52777,52777 47336 -类ACP 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0.0002122 | 直接 |
52518,52467,52518 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) 52467个-类DHS NAD/FAD结合域 52518 -二磷酸硫胺素结合褶皱(THDP-结合) | 1 | 继承的 |
在系统发育树上为单个超域由该EC术语注释
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将树绘制为:
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树木依据树向量
使用蛋白质结构域和超结构域生成存在/缺失矩阵超级家族中的所有基因组。这个RAxML公司该软件用于生成一个单一的大型树状拓扑,使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果单独生产了树木。然而,该数据是从单个一棵大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。
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