（IUCr）结晶学报第D节第58卷第8部分，2002年8月

《水晶学报》。(2002).D类58,1255-1261
doi:10.1107/S0907444902008430

无金属MIRAS相位：apo-S100A3的结构

P.R.E.Mittl先生,G.弗里茨,D.F.萨金特,T.J.里士满,C.W.海兹曼和M.G.Grütter先生

无金属S100A3，一种富含半胱氨酸的钙²⁺-和锌²⁺-结合蛋白已经在严格排除氧气和不存在二价金属离子的情况下通过蒸汽扩散结晶。该结构通过使用碘化钾和氙衍生物的MIRAS相位确定。

PDB参考:apo-S100A3，1kso，r1ksosf

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X射线诱导的Br处核酸脱溴K（K）吸收边缘和MAD相位的含义

E.恩尼法尔,P.卡彭蒂尔,J.-L.费雷尔,P.沃尔特和大仲马

使用溴化衍生物的多波长反常分散被认为是解决化学合成核酸结构的一种常见且方便的技术。这里显示，相对适度的X射线剂量可以诱导足够的脱溴，以防止结构测定。

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尿嘧啶DNA糖基化酶（UDG）的结构域闭合和作用：含有大肠杆菌酶和UDG已知结构的比较研究

K.赛克里希南,M.Bidya Sagar先生,R.拉维桑卡,S.罗伊,K.Purnapatre公司,P.汉达,U.瓦什尼和M.维贾扬

涉及此处报告的结构和类似已知结构的比较研究表明，UDG分子的迁移率由构成分子的两个域的刚体运动和域内的柔韧性组成。DNA结合导致结构域闭合，而和蛋白质抑制剂结合则不会。

PDB参考:UDG、1lqj、r1lqjsf;UDG–Ugi，形式I，1lqg，r1lqgsf;UDG–Ugi，形式II，1lqm，r1lqmsf

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直接方法在蛋白质晶体相延伸中的应用

F.江

提出了一种新的直接方法，该方法使用了最初引入的符号概率来打破相位模糊，其中已知的相位信息可以用作相位细化中的约束相位。这种新的配方已用于蛋白质晶体相延伸，并证明是有效的。

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快速旋转匹配

J.A.科瓦茨和W.Wriggers公司

提出了一种计算效率高的公式，大大加快了生物分子匹配问题中的旋转搜索。这是通过一组新的参数实现的，这些参数允许对所有三个旋转自由度进行傅里叶变换。

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的结构D类-甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物的络合

Y.Shen先生,S.宋和Z.林

辅酶类似物ADP-核糖和SNAD与GAPDH的络合结构⁺已通过分子替换确定。国民账户体系⁺–GAPDH揭示了结晶状态下的显著分子不对称性。

PDB参考:国民账户体系⁺–GAPDH、1ihx、r1ihxsf;ADPR–GAPDH，1ihy，r1hysf

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V45E和V45Y突变体的结构及多种细胞色素的结构比较b条₅突变体

J.-H.甘,J.Wu先生,Z.-Q.王,Y.-H.王,Z.-X.黄和Z.-X.夏

细胞色素的结构b条₅突变体V45E和V45Y显示突变体中Glu45和Tyr45的大侧链指向溶剂而不是血红素，导致血红素囊的疏水性降低。V45Y突变体中卟啉环的旋转和轴向配体His39的构象变化表明，血红素的微环境因突变而受到干扰。

PDB参考:V45E、1lqx、r1lqxsf;V45Y、1lr6、r1lr6sf

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原子分辨率数据揭示了核糖核酸酶Sa结构的灵活性

谢夫契克,V.S.兰津,Z.道特和K.S.威尔逊

在低温下收集的1.0°间距同步加速器数据中的重组RNase Sa的结构显示，主链在含有活性位点残基的两个环中的两种交替构象。在根据1.2º分辨率的室温数据进行优化的结构中，未观察到该特征。

PDB参考:核糖核酸酶Sa，1lni，1lnisf

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对某些植物有毒的蛋白质β-肉桂素的结构

M.L.罗德里格斯,M.阿彻,P.马特尔,A.雅克,A.克拉瓦多和M.A.Carrondo先生

植物病原真菌分泌的诱导素β-肉桂素的X射线结构肉桂已通过分子置换法测定，并精确到1.8º分辨率。

PDB参考:β-肉桂素，1ljp，r1ljpsf

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肌酸酰胺水解酶的结构放线杆菌

B.帕德马纳班,A.帕勒和M.Horikoshi先生

肌酸酰胺水解酶的晶体结构放线杆菌已通过分子置换法进行测定，并精确到2.7Å的分辨率。

PDB参考:肌酸酶，1kp0，r1kp0sf

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钠的可溶结构域的提纯、结晶和初步X射线分析⁺-泵送细胞色素博喹啉氧化酶透明颤菌属

K.-J.金,Y.金,K.-W.公园,D.A.韦伯斯特和A.J.霍华德

24 kDa CyoA可溶性结构域透明颤菌属细胞色素博喹啉氧化酶是从2的溶液中结晶出来的M（M）硫酸铵和5%异丙醇。晶体属于太空群P（P）4_三32与一=122.2μl，每个不对称单元含有一个CyoA亚基。

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三角晶型的结晶和初步X射线衍射分析酿酒酵母乙醇脱氢酶I：晶体中锌离子存在的证据

K.-J.金和A.J.霍华德

酿酒酵母乙醇脱氢酶Ⅰ在空间群中结晶P（P）三₁21或P（P）三₂21，衍射分辨率为3.0º。晶体的荧光扫描在9671.6 eV处产生峰值，表明存在锌²⁺晶体中的离子。

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大蒜中的蒜氨酸裂解酶(大蒜)：结晶和初步X射线表征

L.J.W.西蒙,A.拉宾科夫,T.米隆,D.米勒曼,M.威尔切克和F.弗罗洛

从大蒜鳞茎中分离出蒜氨酸酶并结晶。晶体属于太空群P（P）2₁，带有单位-细胞参数一= 70.191,b条= 127.006,c（c）= 108.085 Å, β = 93.384°.

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好氧高温古菌谷氨酸脱氢酶的结晶和初步X射线衍射分析，薰衣草第1页

M.W.Bhuiya先生,H.Tsuge公司,H.樱叶,K.Yoneda公司,N.卡图努马和T.Ohsima公司

好氧高温古细菌产生的谷氨酸脱氢酶，A.秘鲁K1已结晶。衍射数据集以3.0º的分辨率收集。

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TRAF3的TRAF结构域的结晶和初步X射线分析

C.-Z.镍,K.威尔士,J.郑,M.哈弗特,J.C.里德和K.R.伊利

已确定结晶条件，以制备TNF受体相关因子TRAF3的TRAF结构域的高质量晶体，适用于该因子单独或与TNF受体相互作用区域的肽复合物的结构研究。

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限制性内切酶的一种新晶型生态衍射到2.8Å分辨率的RII

E.X.周,M.路透社,E.J.米汉和L.Chen先生

一种新的晶体形式生态RII是一种IIe型限制性内切酶。新单斜晶形的晶体衍射分辨率为2.8º。

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鼠李糖乳聚糖裂解酶晶体的逐步优化尖曲霉

R.卡迪维拉吉,P.哈里斯,J.-C.N.鲍尔森,S.Kauppinen公司和S.Larsen公司

结晶条件的逐步优化、X射线衍射表征和重原子衍生鼠李糖乳聚糖裂解酶的空间群变化刺突A.acuretus已报告。

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咔唑1,9a-加氧酶末端加氧酶组分的结晶及初步晶体学分析树脂假单胞菌应变CA10

J.-W.南,Z.藤本,H.瑞穗,H.亚马内,吉田（T.Yoshida）,H.哈贝,H.诺吉里和T.奥莫里

CarAa，咔唑1,9a-双加氧酶的末端加氧酶组分P.树脂原应变CA10已结晶，衍射数据已收集到3.0º的分辨率。

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Shank1 PDZ结构域的结晶和初步X射线晶体学研究褐家鼠

S.H.公园,Y.J.伊姆,S.-H.Rho公司,J.H.李,S.杨,E.金和S.H.Eom公司

Shank1的PDZ域褐鼠以无肽形式结晶，并与GKAP的C末端八肽形成络合物。天然晶体和复合晶体属于空间群P（P）2₁和P（P）2₁2₁2₁衍射分辨率分别为1.8和3.2°。

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产肌酸酶的结晶及初步晶体学分析恶臭假单胞菌

B.贝斯,K.尼芬和D.朔姆堡

肌酐水解酶肌酸酶首次成功结晶。晶体将X射线衍射到至少2.5Å的分辨率。

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ezrin FERM畴的结晶和初步晶体学分析

W·J·史密斯和R.A.Cerione公司

细胞骨架-质膜连接分子ezrin的FERM结构域已结晶。单斜晶体衍射到2.3°分辨率。

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转录调控因子TraR与其辅因子和特定DNA序列结合的结晶和初步X射线衍射研究

A.瓦尼尼,C.沃尔帕里,C.加乔利,E.穆拉格里亚,R.德弗朗西斯科,P.内德曼和S.Di Marco公司

转录调控因子TraR来自根癌A.tumefaciens已与其激活分子信息素形成复合物结晶N个-3-氧代辛酰基-L（左）-高丝氨酸内酯（AAI）及其靶DNA序列是一个称为TraBox的18碱基对DNA序列。使用seleno的三波长MAD数据集-L（左）-蛋氨酸取代晶体的收集分辨率为3º。

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一种醌氧化还原酶的过度生产、结晶和初步X射线衍射分析嗜热菌HB8型

下村义夫,K.Sumiguchi-Agari公司,R.Masui先生,S.Kuramitsu公司和K.Fukuyama（福山）

醌氧化还原酶来自嗜热杆菌年HB8生产过剩大肠杆菌然后在不存在和存在NADPH的情况下结晶。

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亮氨酸肌动蛋白结合域的纯化、结晶和初步X射线分析

L.Urbániková,L.詹达,A.波波夫,G.威切和谢夫契克

表达、纯化并结晶了一种细胞连接蛋白——plectin的肌动蛋白结合域。利用同步辐射，单斜晶体衍射到2.0°分辨率。

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博尔纳病病毒基质蛋白的结晶及初步X射线分析

I.克劳斯,H.谢夫奇克,M.艾克曼,S.Kiermayer公司,M.T.斯塔布斯和W.加滕

博尔纳病病毒包膜的16kDa基质蛋白在大肠杆菌在太空群中结晶我432，具有晶胞参数一=b条=c（c）= 144.6 Å. 晶体衍射到3.1Å。

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水稻α-半乳糖苷酶的结晶及初步X射线晶体学研究

Z.藤本,O.小林,S.Kaneko公司,M.妈妈,H.小林和H.瑞穗

α-半乳糖苷酶催化低聚半乳糖和半乳多糖水解为α-半乳糖残基。水稻α-半乳糖苷酶(欧·萨提娃L.ssp公司。日本)结晶，X射线数据以1.9º的分辨率收集。

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43 kDa ATP酶结构域的结晶嗜热菌新生霉素复合物中的回转酶B

V.拉穆尔,L.霍尔曼,J.-M.杰利奇,P.乌代特和D.莫拉斯

的43 kDa ATP酶结构域嗜热杆菌回转酶B在大肠杆菌三步纯化法产生了大量高纯度的酶，并在数周内保持稳定。获得了43 kDa结构域与新生霉素（细菌拓扑异构酶的最有效抑制剂之一）复合物的晶体。

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人体结晶及初步晶体学分析L（左）-木糖还原酶

O.埃尔-卡巴尼,R.P.-T.Chung,S.石仓,N.乌萨米,J.中川和A.哈拉

人的正交晶体L（左）-木糖还原酶从缓冲的聚乙二醇溶液中生长并衍射到2.1º分辨率。

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d的结构（TGCGCA）₂293 K：序列和温度影响的比较

S.Thiyagarajan公司,P.Satheesh Kumar先生,S.S.拉詹和N.高萨姆

序列为d的六聚体DNA片段的晶体结构（TGCGCA）₂在293 K下以1.64 Au的分辨率进行了溶解和精炼。本结构与低温下结构和d（CGCGCG）结构的比较₂揭示了序列和温度对Z-DNA六聚体双重结构的影响。

NDB参考:d（TGCGCA）₂、ZD0007

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PDB Goodies公司–基于web的GUI，用于操作蛋白质数据库文件

A.S.Z.侯赛因,五、山蒂,S.S.Sheik公司,J.杰亚坎坦,P.塞尔瓦拉尼和K.塞卡尔

开发了一个基于万维网的图形用户界面，用于操作蛋白质数据库中可用的蛋白质结构。

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2002年8月发行

研究论文

无金属MIRAS相位：apo-S100A3的结构

X射线诱导的Br处核酸脱溴K（K）吸收边缘和MAD相位的含义

尿嘧啶DNA糖基化酶（UDG）的结构域闭合和作用：含有大肠杆菌酶和UDG已知结构的比较研究

直接方法在蛋白质晶体相延伸中的应用

快速旋转匹配

的结构D类-甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物的络合

V45E和V45Y突变体的结构及多种细胞色素的结构比较b条₅突变体

原子分辨率数据揭示了核糖核酸酶Sa结构的灵活性

对某些植物有毒的蛋白质β-肉桂素的结构

肌酸酰胺水解酶的结构放线杆菌

结晶纸

钠的可溶结构域的提纯、结晶和初步X射线分析⁺-泵送细胞色素博喹啉氧化酶透明颤菌属

三角晶型的结晶和初步X射线衍射分析酿酒酵母乙醇脱氢酶I：晶体中锌离子存在的证据

大蒜中的蒜氨酸裂解酶(大蒜)：结晶和初步X射线表征

好氧高温古菌谷氨酸脱氢酶的结晶和初步X射线衍射分析，薰衣草第1页

TRAF3的TRAF结构域的结晶和初步X射线分析

限制性内切酶的一种新晶型生态衍射到2.8Å分辨率的RII

鼠李糖乳聚糖裂解酶晶体的逐步优化尖曲霉

咔唑1,9a-加氧酶末端加氧酶组分的结晶及初步晶体学分析树脂假单胞菌应变CA10

Shank1 PDZ结构域的结晶和初步X射线晶体学研究褐家鼠

产肌酸酶的结晶及初步晶体学分析恶臭假单胞菌

ezrin FERM畴的结晶和初步晶体学分析

转录调控因子TraR与其辅因子和特定DNA序列结合的结晶和初步X射线衍射研究

一种醌氧化还原酶的过度生产、结晶和初步X射线衍射分析嗜热菌HB8型

亮氨酸肌动蛋白结合域的纯化、结晶和初步X射线分析

博尔纳病病毒基质蛋白的结晶及初步X射线分析

水稻α-半乳糖苷酶的结晶及初步X射线晶体学研究

43 kDa ATP酶结构域的结晶嗜热菌新生霉素复合物中的回转酶B

人体结晶及初步晶体学分析L（左）-木糖还原酶

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d的结构（TGCGCA）₂293 K：序列和温度影响的比较

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