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.2021年2月12:14:1007-1020。
doi:10.2147/OTT。S273823。 eCollection 2021年。

基于串联质谱标记的肝癌分化潜在生物标志物蛋白质组分析

王伟（音译） # 1, 李强 # 2, 葛黄 三, 林炳瑶 1, 东子林 1, 阎马 1, 赵章 4, 陈涛（Tao Chen） 1, 周杰（音译） 1
附属机构

基于串联质谱标记的肝癌分化潜在生物标志物蛋白质组分析

王伟（音译）等。 Onco目标Ther. .

摘要

目的：肝细胞癌（HCC）预后不良，迫切需要发现早期有效的生物标志物。在本研究中，我们应用串联质谱标记（TMT）的蛋白质组学分析来发现潜在的用于肝癌鉴别和分化的蛋白质标记物。

患者和方法：纳入15名患者，高分化（G1，N=5）、中分化（G2，N=5）和低分化（G3，N=五），30对匹配组织（肿瘤组织和来自同一患者的相邻非肿瘤组织）。对所有样品进行TMT标记和LC-MS/MS分析。随后将鉴定的蛋白质分配给GO和KEGG以预测功能。使用免疫组织化学（IHC）对识别的候选蛋白进行验证。

结果：共鉴定出1010个蛋白质。其中，154个差异表达蛋白（DEPs）在肿瘤组织和邻近非肿瘤组织中被发现，其中100个上调，54个下调；在G1和G3组织中发现12个DEPs，9个上调，3个下调；G1和G2组织间存在8个DEPs，5个上调，3个下调；在G2和G3组织中发现11个DEPs，8个上调，3个下调。其中，与G1和G2肿瘤相比，G3肿瘤中ASS1和CPS1显著上调，而UROD和HBB显著下调。与G2和G3肿瘤相比，CYB5A、FKBP11和YBX1三种蛋白在G1肿瘤中显著上调。IHC进一步验证了7个候选生物标志物。

结论：已鉴定出多种与肝癌组织分化相关的DEPs，其中ASS1、CPS1、URPD和HBB蛋白是鉴别低分化肝癌的潜在生物标志物，CYB5A、FKBP11和YBX1是鉴别高分化肝癌的可能生物标志物。我们的发现可能进一步为肝癌的诊断和预后提供新的见解。

关键词：诊断；肝细胞癌；组织分化；预后；蛋白质组分析；串联质量标签。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者声明在这项工作中没有利益冲突。

数字

图1
图1
低分化（G3）、中度（G2）和高分化（G1）肝细胞癌（HCC）差异表达蛋白（DEPs）的火山图和层次聚类。显示DEPs显著褶皱变化分布的火山图(一个)G1和G2(B)G1和G3，以及(C)G2和G3肝癌。红点和绿点分别表示显著上调和下调的蛋白质。(D类)代表21个DEP的层次聚类。红色表示上调，绿色表示下调（图旁的颜色条）。
图2
图2
肝细胞癌（HCC）肿瘤和非肿瘤组织之间以及分化良好（G1）、中度（G2）和分化较差（G3）的HCC之间差异表达蛋白ASS1、CPS1、UROD、HBB、CYB5A、YBX1和FKBP11的丰度比。与G1和G2组织相比，G3组织中ASS1和CPSI上调，而UROD和HBB下调；与G2和G3组织相比，CYB5A、YBX1和FKBP11在G1组织中上调。
图3
图3
肝细胞癌（HCC）和邻近非肿瘤组织之间七种候选蛋白（ASS1、CPS1、UROD、HBB、CYB5A、YBX1和FKBP11）的代表性免疫组织化学染色。比例尺为500μm。
图4
图4
在高分化（G1）、中分化（G2）和低分化（G3）肝细胞癌（HCC）组织中对七种候选蛋白（ASS1、CPS1、UROD、HBB、CYB5A、YBX1和FKBP11）进行代表性免疫组织化学染色。原始比例尺为500μm。
图5
图5
7种DEPs（ASS1、CPS1、UROD、HBB、CYB5A、YBX1和FKBP11）的基因本体富集分析可能用于鉴别低分化和高分化肝癌。
图6
图6
7个DEPs（ASS1、CPS1、UROD、HBB、CYB5A、YBX1和FKBP11）的STRING网络可能用于识别低分化和高分化肝癌。不同的线条颜色代表关联的证据类型。绿色描绘邻里关系；红色：基因融合；粉红色：实验；浅绿色：文本挖掘；蓝色：共现；深蓝色：共同表达；紫色：同源；圆形节点表示不同的蛋白质。交互网络显示在证据视图中。
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赠款和资金

本研究得到了广州市科技计划（No.020-02-03-06-3003-0015）、佛山市科技创新项目（No.FS0AA-KJ218-1301-0035）、暨南大学第一附属医院培育基金（No.20191315）、，广东省中医药管理局（No.20102078）、广东省医学科学基金（No.B2018014）、广州市科技计划（No.20202030200）。