摘要
伪氨基酸组分被广泛用于将各种长度的复杂蛋白质序列转换为固定长度的数字特征向量，同时保留大量的序列顺序信息。然而，到目前为止，唯一可供公众使用的软件是web服务器PseAAC(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/PseAAC)，在处理大规模数据集时有一些限制。在这里，我们提出了一个新的跨平台独立软件程序，称为PseAAC-Builder(网址：http://www.pseb.sf.net)，可用于以更高效、更灵活的方式生成周氏伪氨基酸成分的各种模式。预计PseAAC-Builder可能成为研究各种蛋白质属性的有用工具。
版权所有©2012 Elsevier Inc.保留所有权利。
PubMed免责声明
类似文章
-
PseAAC：一个灵活的网络服务器，用于生成各种蛋白质伪氨基酸组成。
沈HB、周KC。
沈海波等。
分析生物化学。2008年2月15日；373（2）：386-8。doi:10.1016/j.ab.2007.10.12。Epub 2007年10月13日。
分析生物化学。2008
PMID：17976365
-
PseAAC-General：为大规模蛋白质数据集快速构建Chou伪氨基酸组成的各种通用形式模式。
杜萍，顾思，焦毅。
Du P等人。
国际分子科学杂志。2014年2月26日；15(3):3495-506. doi:10.3390/ijms15033495。
国际分子科学杂志。2014
PMID：24577312
免费PMC文章。
-
GPCR-2L：通过杂交两种不同模式的伪氨基酸组成预测G蛋白偶联受体及其类型。
肖X，王P，周KC。
Xiao X等人。
分子生物晶体。2011年3月；7(3):911-9. doi:10.1039/c0mb00170h。Epub 2010年12月23日。
分子生物晶体。2011
PMID：21180772
-
pLoc_bal-mVirus：通过Chou的通用PseAAC和IHTS处理预测多标签病毒蛋白质的亚细胞定位，以平衡训练数据集。
Xiao X、Cheng X、Chen G、Mao Q、Chou KC。
Xiao X等人。
药物化学。2019;15(5):496-509. doi:10.2174/1573406415666181217114710。
药物化学。2019
PMID：30556503
-
简评生成各类生物序列周氏伪因子表示的软件工具。
赵伟，王莉，张天祥，赵振恩，杜甫甫。
赵伟等。
蛋白肽Lett。2018;25(9):822-829. doi:10.2174/0929866525666186180511124。
蛋白肽Lett。2018
PMID：30182829
审查。
引用人
-
混合设计方法对添加米粉馒头营养特性和感官评定的影响。
田斯，魏毅，陈志。
田S等。
前螺母。2022年11月11日；9:989090. doi:10.3389/fnut.2022.989090。2022年电子采集。
前螺母。2022
PMID：36438756
免费PMC文章。
-
利用CIS调节元件模式识别DNA增强子区域的机器学习技术。
Butt AH、Alkhalifah T、Alturise F、Khan YD。
Butt AH等人。
科学报告2022年9月7日；12(1):15183. doi:10.1038/s41598-022-19099-3。
科学报告2022。
PMID：36071071
免费PMC文章。
-
FEPS：一种从蛋白质序列中提取特征的工具。
Ismail H、White C、Al-Barakati H、Newman RH、Kc DB。
Ismail H等人。
方法分子生物学。2022年；2499:65-104. doi:10.1007/978-1-0716-2317-6_3。
方法分子生物学。2022
PMID：35696075
-
帮助肿瘤学家：一种高效的基于机器学习的抗癌肽分类方法。
Alsanea M、Dukyil AS、Afnan、Riaz B、Alebeisat F、Islam M、Habib S。
Alsanea M等人。
传感器（巴塞尔）。2022年5月25日；22(11):4005. doi:10.3390/s22114005。
传感器（巴塞尔）。2022
PMID：35684624
免费PMC文章。
-
iSUMOK-PseAAC：使用统计矩和Chou的PseAAC-预测赖氨酸sumoylation位点。
Khan YD、Khan NS、Naseer S、Butt AH。
Khan YD等人。
同行杂志，2021年8月4日；9:e11581。doi:10.7717/peerj.11581。eCollection 2021年。
同行杂志.2021。
PMID：34430072
免费PMC文章。
引用
