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Cnn1号机组钙调素1[小家鼠（家鼠）]

基因ID:12797，更新日期2024年4月30日

总结

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官方符号
Cnn1号机组由提供MGI公司
官方全名
钙蛋白酶1由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:104979
请参阅相关
乐团：ENSMUSG00000001349 联盟基因组：MGI:104979
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
也称为
中国；CnnI公司
总结
预测启用肌动蛋白结合活性。预计参与血管相关平滑肌细胞增殖的负调控。预计在细胞骨架中活跃。表达于多种结构，包括心血管系统；泌尿生殖系统；肠道；溶血性突起系统腺体；和肺。与人CNN1同源（calponin 1）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
成人膀胱（RPKM 1016.2）、成人结肠（RPKM 481.0）和其他7种组织中的偏表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新款
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基因组背景

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地点：
9 A3；9 8.3立方厘米
外显子计数：
8
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 9 NC_000075.7（22010501..22020517）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 9 NC_000075.6（22099221..22109221）

染色体9-NC_000075.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene predicted gene, 16845 Neighboring gene ECSIT signalling integrator Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E8280 Neighboring gene predicted gene 6581 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2285 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E11403 Neighboring gene microRNA 7084 Neighboring gene ELF1 homolog, elongation factor 1 Neighboring gene acid phosphatase 5, tartrate resistant

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed上的相关文章

  1. 成骨细胞系细胞中H1钙调素的过度表达通过破坏成骨细胞功能和促进破骨细胞的形成导致骨量减少。 苏恩，等骨矿工研究杂志，2013年3月，PMID 23044709，免费PMC文章
  2. 钙调素调节区本质上是非结构化的：利用核磁共振波谱对肌动蛋白-钙调素和钙调素-钙调蛋白界面的新见解。 Pfuhl M公司，等《生物物理学杂志》，2011年4月6日。PMID 21463585，免费PMC文章
  3. 平滑肌钙蛋白的丢失会导致肿瘤宿主微环境中血管成熟受损。 Yamamura H，等癌症科学，2007年5月，PMID 17391313
  4. calponin基因敲除小鼠的肌肉血管扩张增强导致运动期间动脉压力调节受损。 Masuki S，等《生理学杂志》，2003年11月15日。PMID 12963798，免费PMC文章
  5. H1 calponin基因缺陷小鼠的运动活动增加，食物和水摄入量增加，PVN神经元减少。 班奈M，等《兽医医学科学杂志》，2003年1月，PMID 12576725

查看PubMed中的所有（96）条引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. Kdm6a-CNN1轴协调创伤诱导脊髓微血管内皮细胞衰老的表观遗传控制，以平衡神经炎症，改善神经修复。
    标题：Kdm6a-CNN1轴协调创伤诱导的脊髓微血管内皮细胞衰老的表观遗传学控制，以平衡神经炎症，改善神经修复。
  2. 与野生型对照组相比，Cnn1（-/-）和Cnn2（-/--）双敲除主动脉平滑肌表现出更快的松弛。
    标题：小鼠中钙粘蛋白1和钙粘蛋白2的双重缺失降低了全身血压，主动脉平滑肌的张力反应减弱。
  3. 在模拟微重力条件下，肌动蛋白细胞骨架解聚通过去磷酸化CNN1阻断成骨细胞Smad抑制BMP2信号传导。
    标题：在模拟微重力条件下，肌动蛋白细胞骨架通过前成骨细胞中的钙调素1介导BMP2-Smad信号。
  4. 这些发现揭示了CNN1通过结合骨形成和骨吸收来维持骨稳态的新功能
    标题：成骨细胞系细胞中H1钙调素的过度表达通过破坏成骨细胞功能和促进破骨细胞形成导致骨量减少。
  5. 数据表明，在小鼠子宫肌层中，PKC-epsilon诱导的h1 calponin磷酸化可能促进分娩时子宫收缩并调节妊娠子宫肌层收缩。
    标题：PKCε对h1 calponin的磷酸化可能有助于促进妊娠和分娩期间小鼠子宫肌层的收缩。
  6. 单个内含子CArG元件是必需的，但不足以在体内正确表达CNN1。CNN1过度表达可对抗动脉损伤诱导的新生内膜形成。
    标题：平滑肌钙粘蛋白：一种对抗新生内膜形成的非常规CArG依赖基因。
  7. 绘制了钙调素这一重要功能区域的结构图，以及它在氨基酸分辨率下与肌动蛋白和钙调素的相互作用。
    标题：钙调素调节区本质上是非结构化的：利用核磁共振波谱对肌动蛋白-钙调素和钙调素-钙调蛋白界面的新见解。
  8. 突变小鼠表现出运动活动增加，食物和水摄入量增加，与下丘脑室旁核（PVN）神经元数量减少有关
    标题：H1钙蛋白基因缺陷小鼠的运动活动增加，食物和水摄入量增加，PVN神经元减少。
  9. 在缺乏SM-B肌球蛋白的情况下，可能需要上调SM-B缺失小鼠的h1-calponin，以维持跨桥循环的降低水平，并在调节平滑肌收缩中发挥重要作用。
    标题：h1-calponin消融对缺乏SM-B肌球蛋白的小鼠膀胱与血管平滑肌收缩特性的影响。
  10. CNh1在SR-3Y1中发挥抑癌作用，主要通过降低体内VEGF表达和血管生成，部分通过降低细胞增殖潜能和细胞运动
    标题：Calponin h1抑制Src诱导的转化3Y1细胞的肿瘤生长，并降低血管生成。
提交： 新GenerRIF 更正

变更

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等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）
  • 目标（2）1条引文
  • 核酸内切酶介导（1）

PubChem的途径

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互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
启用actin绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
使肌动蛋白丝结合 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
启用钙调素结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
过程 证据代码 酒吧
参与肌动蛋白丝组织 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
涉及肌动球蛋白结构组织 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与血管相关平滑肌细胞增殖的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
组件 证据代码 酒吧
肌动蛋白细胞骨架中的活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
定位于细胞骨架 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 公共医学 

一般蛋白质信息

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首选名称
钙调素-1
姓名
碱性钙粘蛋白
钙调素H1，平滑肌

NCBI参考序列（RefSeq）

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独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. 纳米_009922.4→NP_034052.3号钙调素-1

    参见NP_034052.3的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    源序列
    AK035548，BY326336
    共识CDS
    CCDS22921.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题08091
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B2RSH3型，问题8CBQ2
    相关的
    ENSMUSP00000001384.5号，ENSMUST00000001384.6号
    保守领域（3）总结
    COG5199公司
    地点：18→188
    SCP1；钙蛋白[细胞骨架]
    pfam00307型
    地点：29→127
    中国；Calponin同源（CH）结构域
    pfam00402型
    地点：164→187
    钙调蛋白；Calponin家族重复

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000075.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    22010501..22020517
    下载
    GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_011242388.3号→XP_011240690.2号钙调素-1亚型X1

    UniProtKB/TrEMBL公司
    问题8CBQ2
    保守领域（2）总结
    辉瑞00402
    地点：213→237
    钙调蛋白；Calponin家族重复
    cd21282
    地点：76→183
    CH_CNN1；calponin-1和类似蛋白质中的calponin同源结构域

  2. XM_006509969.3号→XP_006510032.1号钙调素-1亚型X2

    参见XP_006510032.1的相同蛋白质及其注释位置

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1L1子2
    相关的
    ENSMUSP00000150665.2，ENSMUST00000216872.2号
    保守领域（2）总结
    COG5199公司
    地点：1→138
    SCP1；钙蛋白[细胞骨架]
    pfam00402型
    地点：154→177
    钙调蛋白；Calponin家族重复
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
问题08091.1 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q08091

基因链接输出

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