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.2015年5月30日;16(1):113.
doi:10.1186/s13059-015-0676-3。

ADAMTS(具有凝血酶原反应蛋白基序的去整合素和金属蛋白酶)家族

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ADAMTS(具有凝血酶原反应蛋白基序的去整合素和金属蛋白酶)家族

理查德·凯尔威克等。 基因组生物学. .

摘要

ADAMTS(A Disintegrin and Metalloproteinase with Thrombospondin motives)酶是分泌的多域基质相关锌金属内肽酶,在组织形态发生和病理生理重塑、炎症和血管生物学中具有不同的作用。人类家族包括19个成员,可根据其已知底物进行亚组化,即聚集酶或蛋白聚糖酶(ADAMTS1、4、5、8、9、15和20)、前胶原N-前肽酶(ADAMETS2、3和14)、软骨寡聚基质蛋白剥离酶(ADAM TS7和12)、,von-Willebrand因子蛋白酶(ADAMTS13)和一组孤酶(ADAMTS 6、10、16、17、18和19)。细胞外基质(ECM)的结构和功能的控制是ADAMTS生物学的中心主题,胶原蛋白原纤维组装中的前胶原蛋白N肽酶和ECM蛋白多糖裂解或修饰中的聚集酶的作用就是例证。某些家庭成员的缺陷会导致遗传性遗传疾病,而其他人的异常表达或功能与关节炎、癌症和心血管疾病有关。特别是,ADAMTS4和5已成为关节炎的治疗靶点。来自不同亚组的多种ADAMTS对肿瘤的发生和转移产生积极或消极的影响,已知会发生金属蛋白酶依赖性和非依赖性作用。ADAMTS的基本结构包括金属蛋白酶催化域和羧基末端辅助域,后者决定了蛋白酶及其相互作用伙伴的底物特异性和定位;辅助结构域也可能具有独立的生物学功能。本综述主要关注聚集酶和蛋白聚糖酶,对ADAMTS家族的进化、它们与发育和疾病机制的联系以及未来的关键问题提供了一个视角。

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数字

图1
图1
ADAMTS(一种具有血栓海绵蛋白基序的崩解蛋白和金属蛋白酶)家族。19个ADAMTS家族成员及其主要功能组的基本领域组织。在结构上,ADAMTS成员被广泛组织为蛋白酶结构域和辅助结构域。蛋白酶结构域包括信号、前体、金属蛋白酶和去整合素样结构域。ADAMTS成员之间的最大变异性出现在辅助结构域中,辅助结构域由一个或多个血小板反应蛋白1型序列重复序列(TSR)、富含半胱氨酸的结构域和间隔区组成。一些家庭成员还拥有一个或多个专业领域,作为其辅助领域的一部分,如右边的关键字所列。该图按比例绘制
图2
图2
ADAMTS家族的演变。八个脊椎动物ADAMTS分支的关系示意图,以及促成家族扩张的可能事件(基因重复和逆转录转座子)。这个数字并不是按照进化距离来衡量的。COMP,软骨寡聚蛋白;vWFCP,von-Willebrand-factor-cleaving蛋白酶。b条的系统发生树ADAMTS公司基于JTT矩阵模型的最大似然法推断的基因[144]。从1000个重复中推断出的bootstrap共识树代表了所分析分类群的进化历史[145]。在少于50%的引导复制中,与分区对应的分支被折叠。通过将邻接连接方法应用于使用JTT模型估计的成对距离矩阵,获得启发式搜索的初始树。分析涉及70个氨基酸序列。消除了所有包含缺口和缺失数据的职位。在MEGA6[146]中进行了进化分析。脊椎动物ADAMTS公司基因由数字表示,后跟一个表示物种的单字母代码:例如,1t代表1tADAMTS1公司热带非洲爪蟾; 15小时等于15小时亚当斯15智人; 8米是亚当斯8小家鼠。对于黑腹果蝇(德罗),秀丽隐杆线虫(cel)和肠圆线虫(cio),注释为物种,后跟基因数;例如,cio6就是cio6ADAMTS6公司玻璃海鞘

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引用人

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