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.2010年6月;10(6):389-402。
doi:10.1038/nrc2867。

微RNA网络中的遗传变异:对癌症研究的启示

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审查

微RNA网络中的遗传变异:对癌症研究的启示

布莱德·M·瑞恩等。 Nat Rev癌症. 2010年6月.

勘误表in

  • Nat Rev癌症。2010年7月;10(7):523

摘要

许多研究强调了微RNA在生理过程中的作用,以及它们的放松调控如何导致癌症。最近,有人提出,microRNA基因、其加工机制和靶结合位点中的单核苷酸多态性影响癌症风险、治疗效果和患者预后。在回顾癌症生物学这一新领域时,我们描述了这些研究的方法学方法,并就未来哪些策略信息最丰富提出了建议。

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数字

图1
图1。miRNA网络的说明性概述
RNA聚合酶II(Pol II)产生一个500-3000核苷酸转录物,称为初级微RNA(primary microRNA,miRNA)或pri-miRNA,然后通过包含DROSHA(~60-100核苷酸)的多蛋白复合物剪切形成前miRNA发夹(此处显示简化视图)。这种双链发夹结构通过RAN GTPase和exportin 5(XPO5)从细胞核输出。最后,前miRNA被DICER1切割成两条miRNA链,一条成熟的miRNA序列,长度约为20个核苷酸,以及其短寿命的互补序列,即miR*,有时称为副链或3p链。miRNA双链末端的热力学稳定性和3′末端核苷酸的同一性决定了哪一条链并入RNA诱导沉默复合物(RISC)。在某些情况下,如果铅绞线和乘客绞线具有相似的热力学稳定性,则两股绞线都将加载。将单链miRNA并入RISC,RISC将其靶向靶3′非翻译区mRNA序列,以促进抑制和切割。AA,聚A尾巴;m7G,7-甲基鸟苷帽;ORF,打开阅读框。
图2
图2。pri-miRNA和pre-miRNA序列中SNP的图示
单核苷酸多态性(SNP)可发生在pri-miRNA和pre-miRNA链中,并可能影响miRNA加工和随后成熟的miRNA水平。这种SNP可以导致加工过程的增加或减少。
图3
图3。miRNA种子和调控区SNP的图示
种子序列中成熟microRNAs(miRNAs)的单核苷酸多态性(SNP)可以加强或减少miRNA与其mRNA靶点之间的结合。此外,这种SNP可以创建或破坏目标结合位点mir-146a型*位于3′非翻译区miRNA结合位点的SNP的功能类似于种子区SNP,并调节miRNA-mRNA的相互作用。它们可以创建或破坏miRNA结合位点,并影响随后的mRNA翻译。AA,聚A尾巴;m7G,7-甲基鸟苷帽;ORF,打开阅读框。
图4
图4。miRNA加工机械中SNP的图示
单核苷酸多态性(SNP)也可能发生在加工机械中。尽管仍缺乏生物验证,但这些SNP可能会影响整个microRNA组(miRNA组),可能导致miRNA输出的全面抑制。此外,miRNA加工辅因子(如p53)中的SNP可能会间接影响miRNA的成熟。

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引用人

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    1. Frazer KA等人。第二代人类单倍型图谱,包含310多万个SNP。自然。2007;449:851–861。本文提供了HapMap的良好背景,并提供了数据库最新版本的详细信息。

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    1. 国际HapMap联盟。人类基因组的单倍型图谱。自然。2005;437:1299–1320.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Bartel B.指导siRNA生物发生的microRNA。自然结构。分子生物学。2005;12:569–571这是一篇以完整和描述性的方式涵盖miRNA生物生成的优秀论文。

    1. Bartel博士。微RNA:基因组学、生物发生、机制和功能。单元格。2004;116:281–297.-公共医学

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