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.2009年7月1日；23(13):1494-504.
doi:10.1101/gad.1800909。

长非编码RNA：来自RNA世界的功能惊喜

杰里米·威鲁斯 1, 红在圣宇, 大卫·L·斯佩克特
附属公司
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长非编码RNA：来自RNA世界的功能惊喜

杰里米·威鲁斯等。 基因开发. .

摘要

大多数真核生物基因组都是转录的，产生了一个复杂的转录网络，其中包括数万个长的非编码RNA，几乎没有蛋白质编码能力。尽管绝大多数长非编码RNA尚待彻底鉴定，但其中许多转录物不太可能代表转录“噪音”，因为大量转录物已显示出细胞类型特异性表达、亚细胞亚区定位以及与人类疾病的关联。在这里，我们强调了最近的努力，这些努力已经确定了长非编码RNA的无数分子功能。在某些情况下，似乎仅仅是非编码RNA转录的行为就足以对附近基因的表达产生积极或消极的影响。然而，在许多情况下，长的非编码RNA本身起着关键的调节作用，这些作用以前被认为是为蛋白质保留的，例如调节蛋白质的活性或定位，以及作为亚细胞结构的组织框架。此外，许多长的非编码RNA被处理以产生小RNA，或者反过来调节其他RNA的处理方式。因此，越来越清楚的是，长非编码RNA可以通过多种模式发挥作用，是细胞中的关键调节分子。

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数字

图1。
图1。
ncRNAs作用时间的范例。最近的研究已经确定了非编码RNA作用时间的多种调控模式，其中许多在这里被强调。上游非编码启动子（橙色）的转录可通过抑制RNA聚合酶II募集或诱导染色质重塑，分别负（1）或正（2）影响下游基因（蓝色）的表达。（3） 反义转录物（紫色）能够与重叠义转录物杂交（蓝色），并阻断剪接体对剪接位点的识别，从而产生选择性剪接转录物。（4） 或者，正反义转录物的杂交可以使Dicer产生内源性siRNA。通过与特定的蛋白质伴侣结合，非编码转录物（绿色）可以调节蛋白质（5）的活性，作为允许形成较大RNA-蛋白质复合物（6）的结构成分，或改变蛋白质在细胞中的位置（7）。（8） 长的ncRNAs（粉红色）可以被处理以产生小RNA，例如miRNAs、piRNAs和其他特征不太明显的小转录物类。
图2。
图2。
长的ncRNAs经过处理产生小的RNAs。(一个)许多长时间处理的转录物可以被转录后切割以产生小RNA（Fejes-Toth等人，2009）。然后在许多小RNA的5′端加上一个帽状结构（用红星表示）。此外，被称为PASR的带帽小RNA定位在许多基因的转录起始位点（TSS）附近。(B类)对新生的MALAT1转录物进行处理，产生两个定位于不同亚细胞亚区的ncRNAs。RNase P裂解同时产生成熟MALAT1转录物的3′端和massRNA的5′端（Wilusz等人，2008年）。
图3。
图3。
MENɛ/βncRNAs对副啄木鸟的结构完整性至关重要。如RNA FISH探针与PSPC1的共定位所示，MEN/βncRNA定位于HeLa细胞中的副佩克细胞，PSPC1是副佩克细胞的一种已知蛋白质成分，与EYFP融合。在用补充MENɛ/β的反义寡核苷酸（ASO）处理细胞以耗尽ncRNAs的表达后，副啄木鸟被破坏。相反，对照组ASO对副啄完整性没有影响。棒材，10μm。
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