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.2006年5月;5(5):1224-31.
doi:10.1021/pr0504891。

稳定同位素和高质量精度仪器对转移性前列腺癌的增强分析

附属公司

稳定同位素和高质量精度仪器对转移性前列腺癌的增强分析

帕特里克·A·埃弗利等。 蛋白组学研究杂志. 2006年5月.

摘要

蛋白质组学的主要目标是在蛋白质表达水平上更好地理解生物功能。随着该领域的成熟,许多技术正在开发中,以帮助在近全球范围内识别、量化和表征蛋白质表达和翻译后修饰。在细胞培养中用氨基酸进行稳定同位素标记是一种显示出广泛生物学应用的技术。虽然我们最近展示了该技术在转移性前列腺癌模型中的应用,但我们现在报告了使用线性离子阱傅里叶变换离子回旋共振质谱仪(LTQ-FT)和新型量化软件进行定量分析的重大改进。这导致近1400个蛋白质的定量,与我们早期的研究相比增加了3倍以上。蛋白质组覆盖率的急剧增加可归因于(1)使用双标记策略,(2)LTQ FT质谱仪提供更高的灵敏度、速度和质量精度,以及(3)更强大的量化软件。最后,通过使用串联目标/诱饵蛋白数据库进行肽搜索,我们现在在估计假阳性率为1%的背景下报告这些数据。

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