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.2005年5月6日;348(3):575-88.
doi:10.1016/j.jmb.2005.02.038。

人类、果蝇和线虫TDP43:核酸结合特性和剪接调控功能

附属公司

人类、果蝇和线虫TDP43:核酸结合特性和剪接调控功能

尤纳·M·阿亚拉等。 分子生物学杂志. .

摘要

TAR DNA结合蛋白(TDP43)是一种高度保守的异质核核糖核蛋白,通过与3'剪接位点上游UG-rich多态性区域的特异性结合,下调外显子9囊性纤维化跨膜电导调节器(CFTR)的剪接。尽管出现了关于该蛋白的核定位和剪接调控活性的新信息,但TDP43在细胞中的作用仍然难以捉摸。为了研究人类TDP43及其同源物的功能,我们克隆并表征了黑腹果蝇和秀丽隐杆线虫的蛋白质。人类、苍蝇和蠕虫的蛋白质在核酸结合特异性方面表现出惊人的相似性。我们发现两个不同位置的残基在TDP43家族成员中表现出很强的保守性,与目标序列的紧密识别有关。我们的TDP43与(UG)(m)序列复合物的三维模型预测,这些残基会使氨基酸侧链与碱接触。此外,我们的结果表明,果蝇TDP43在调控外显子剪接方面与人类TDP43相当。另一方面,线虫TDP43对外显子识别没有影响。秀丽线虫的TDP43缺乏在其他两个同源物的羧基末端发现的富含甘氨酸的结构域。没有C末端结构域的人类和苍蝇TDP43突变体同样不能影响剪接。我们的研究表明,富含甘氨酸的结构域对人和蝇TDP43的剪接调控至关重要。

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