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问题：lima1/PureCN

Mutect2在重叠读取中将MBQ降至20
#320开的2023年9月6日通过斯莱恩
正常开放 4
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问题列表

对结果进行重新排序的问题
#368开的2024年5月15日通过马克萨内斯
PSCBS分段失败-->R directory.cache的写入权限错误
#367开的2024年5月6日通过勒曼钦
片段的等位基因拷贝数
#364开的2024年4月13日通过詹尼p76
WARN[2024-03-12 11:57:13]找不到有效的纯度和倍性溶液。结果[[1]]中出现错误：下标越界
#358开的2024年3月12日通过加甘克4911
找不到有效的纯度和倍性解决方案
#355开的2024年3月7日通过加甘克4911
PureCN输出的HRD得分 问题
#352开的2024年2月29日通过什瓦茨曼·伊琳娜
2
使用不同数据库的注释 增强
#350开的2024年2月8日通过詹尼普76
1
当一条染色体上的所有变体被过滤掉时，GATK分割可能会失败。 缺陷 关卡4 与GATK4/Mutect2相关的所有事项
#343开的2024年1月16日通过利马1
支持非二倍体同种异体变异
#342开的2024年1月13日通过利马1
仅使用一个正常样本运行PureCN 缺陷
#341开的2024年1月5日通过斯莱恩
1
运行PureCN时出现重叠间隙错误
#339开的2023年12月19日通过阿卡维亚实验室
6
以防有帮助
#338开的2023年12月15日通过吉多利奥尼
Mutect2在重叠读取中将MBQ降至20 关卡4 与GATK4/Mutect2相关的所有事项
#320开的2023年9月6日通过斯莱恩
4
PureCN分段和VCF不重叠
#316开的2023年8月22日通过巴瓦马托
1
增加纯合子缺失的杂合SNP检测 增强
#273个开的2023年4月6日通过利马1
删除copynumber依赖项 增强
#271开的2023年3月24日通过利马1
CRAM兼容性
#244开的2022年6月27日通过Jwong王684
1
提高低纯度放大呼叫管道的灵敏度 增强
#239开的2022年5月29日通过利马1
2项任务
标记call中的困难基因扩增 增强
#179开的2021年5月16日通过利马1
支持Dx中同源重组缺陷评分。R（右） 增强
#159开的2020年12月19日通过极限1
10
创建细分黑名单的功能 增强
#130个开的2020年7月28日通过利马1
PureCN.pdf文件名 增强
#113开的2019年11月20日通过泰德托尔
1
改进映射偏差估计 增强
#90开的2019年6月11日通过利马1 生物导体3.11释放
@利马1
标准化输出图 增强
#87开的2019年5月21日通过利马1
实现伪切线归一化 增强
#77开的2019年4月5日通过利马1 生物导体3.11释放
专业提示！一个月内未更新的内容：更新日期：<2024-04-21.