阿卜杜勒·加瓦德(H.I.Abdel-Gawad)。;M·坦塔维。;奥斯曼,M.S。 DNA对其损伤的可能影响的动态。 (英语) Zbl 1334.35356号 数学。方法应用。科学。 39,第2期,168-176(2016). 摘要:在本文中,我们研究了DNA双链模型描述的具有横向和纵向运动的DNA动力学。该模型允许孤立波、孤子波、周期波或啁啾波解。证明了最允许的物理解是孤子或啁啾波解。利用Sturm-Liouville问题和拓扑不变性对所有这些解进行了稳定性分析。我们发现孤子波和啁啾波是不稳定的,因此可能会出现无界振幅。根据这些模型,DNA膜或碱基的损伤可能在小干扰下发生。此外,当考虑到不均匀性或介质耗散时,所建议的模型将是必不可少的。 引用于17文件 理学硕士: 92年第35季度 与生物、化学和其他自然科学相关的PDE 92D20型 蛋白质序列,DNA序列 35C07型 行波解决方案 35C08型 孤子解决方案 35B35型 PDE环境下的稳定性 34B24型 Sturm-Liouville理论 关键词:DNA的动态;行波解;统一方法;解的稳定性 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{H.I.Abdel-Gawad}等人,《数学》。方法应用。科学。39,第2号,168--176(2016;Zbl 1334.35356) 全文: 内政部 参考文献: [1] Peyrard,DNA变性非线性模型的统计力学,《物理评论快报》62(23)pp 2755–(1989)·doi:10.1103/PhysRevLett.62.2755 [2] Cuenda,《DNA的离散Peyrard-Bishop模型:定态解和稳定性》,《混沌:非线性科学跨学科期刊》16(2)pp 023123–(2006)·Zbl 1146.37314号 ·doi:10.1063/1.2194468 [3] Sulaiman,带阻尼和外力的Peyrard-Bishop模型中DNA呼吸动力学,《物理D:非线性现象》241(19),第1640页–(2012)·Zbl 1253.92005年 ·doi:10.1016/j.physd.2012.00.011 [4] Yakushevich,DNA是一个非线性动力学系统吗?在这个系统中可能存在孤立的构象波?,生物科学杂志26(3)pp 305–(2001)·doi:10.1007/BF02703739 [5] Dauxois,Entropy-driven DNA变性,Physical Review E 47(1)pp R44–(1993)·doi:10.1103/PhysRevE.47.R44 [6] Dauxois,DNA变性非线性模型的动力学和热力学,《物理评论》E 47(1)第684页–(1993)·Zbl 0783.92015号 ·doi:10.1103/PhysRevE.47.684 [7] Swanson,太赫兹辐射对DNA反应的建模,《物理评论》E 83(4)第040901页–(2011)·doi:10.1103/PhysRevE.83.040901 [8] 张,DNA片段之间的极化子传输:湮灭和创造,《化学物理快报》471(1)第163页–(2009)·doi:10.1016/j.cplett.2009.02.009 [9] Bergues-Pupo,《DNA与交替场相互作用建模》,《物理评论》E 87(2)第022703页–(2013)·doi:10.1103/PhysRevE.87.022703 [10] Bergues-Pupo,《外场影响下DNA的解压缩》,《物理学A:统计力学及其应用》396页,99–(2014)·doi:10.1016/j.physa.2013.10.050 [11] 佩拉德,DNA双螺旋的波动,欧洲物理杂志专题147(1),第173页–(2007)·doi:10.1140/epjst/e2007-00208-6 [12] Tabi,DNA动力学扭开放模型的调制不稳定性和精确孤子解,《物理快报》a 373(29),第2476页–(2009)·Zbl 1231.92033号 [13] Alka,DNA的非线性动力学-Riccati广义孤立波解,《物理学快报》A 375(3),第480页–(2011)·兹比尔1241.35205 ·doi:10.1016/j.physleta.2010.11.017 [14] 雅库舍维奇,DNA的非线性物理(2006) [15] Yakushevich,非均匀多核苷酸链中激活扭折非线性动力学研究的新方法,国际非线性力学杂志43(10),第1074页–(2008)·doi:10.1016/j.ijnonlinme.2008.05.003 [16] Gaeta,具有改进的层内电位的DNA动力学类雅库舍维奇模型中的孤子,非线性数学物理杂志14(1),第57–(2007)页·Zbl 1165.35439号 ·doi:10.2991/jnmp.2007.14.1.6 [17] Derks,DNA动力学与RNA聚合酶相互作用的最小模型,《物理D:非线性现象》240(22),第1805页–(2011)·Zbl 1227.92021号 ·doi:10.1016/j.physd.2011.08.05 [18] Daniel,完全不均匀DNA链中的非线性分子激发,《物理快报》a 372(31)pp 5144–(2008)·Zbl 1221.92038号 ·doi:10.1016/j.physleta.2008.05.063 [19] Zdravkovic’,《非线性DNA动力学:非线性与色散》,应用数学与计算225 pp 401–(2013)·Zbl 1334.92320号 ·doi:10.1016/j.amc.2013.09.064 [20] Alatas,具有五阶近似Morse势的Peyrard Bishop Dauxois模型中的半离散DNA呼吸子,混沌,孤立子和分形45(9),第1231页–(2012)·doi:10.1016/j.chaos.2012.06.012 [21] Zdravkovic’,DNA分子中的横向相互作用,生物系统105(1),第10页–(2011)·doi:10.1016/j.biosystems.2011.02.005 [22] Tabi,DNA动力学扭开放模型的调制不稳定性和精确孤子解,《物理快报》a 373(29),第2476页–(2009)·Zbl 1231.92033号 ·doi:10.1016/j.physleta.2009.04.052 [23] Torrellas,双链DNA链的扭曲-径向正常模式分析,《物理学快报》A 376(45)第3407页–(2012)·doi:10.1016/j.physleta.2012.09.036 [24] 阿加瓦尔,包括纵向自由度的非线性DNA模型的呼吸解,《物理a:统计力学及其应用》323页,519–(2003)·Zbl 1036.92014号 ·doi:10.1016/S0378-4371(02)02028-9 [25] Maci'as-Di'az,修正{(alpha)}-Fermi-Pasta-Ulam介质阻尼效应研究中的隐式四步计算方法,非线性科学与数值模拟通信14(7)pp 3200–(2009)·Zbl 1221.82094号 ·doi:10.1016/j.cnsns.2008.12.013 [26] Abdel-Gawad,《关于分析演化方程解稳定性的变分方法》,《京畿道数学杂志》53 pp 661–(2013)·Zbl 1297.65058号 ·doi:10.5666/KMJ.2013.53.4.680 [27] Abdel-Gawad,走向演化方程精确解的统一方法。《有限记忆输运反应扩散方程的应用》,《统计物理杂志》147(3),第506页–(2012)·Zbl 1362.35070号 ·doi:10.1007/s10955-012-0467-0 [28] Abdel-Gawad,用扩展统一方法求解空间相关Korteweg-de-Vries方程的精确解,日本物理学会杂志82(2013)·Zbl 1307.35251号 ·doi:10.7566/JPSJ.82.044004 [29] Dai,具有分布系数的三次五次非线性薛定谔方程的Chirped和无啁啾自相似椭圆余弦波和孤立波解,光学通信283(7)pp 1489–(2010)·doi:10.1016/j.optcom.2009.11.082 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。