朱塞佩·盖塔 DNA动力学类雅库舍维奇模型中的孤子具有改进的空气内电位。 (英语) Zbl 1165.35439号 J.非线性数学。物理学。 14,编号1-4,57-81(2007). 小结:雅库舍维奇模型提供了DNA扭转动力学的一个非常简单的图片,但对动力学的某些物理特性的预测却非常正确。在标准的雅库舍维奇模型中,一对碱基之间的相互作用由谐波势建模,当用旋转角描述时,谐波势变成非谐波势;在这里,我们用这种不同类型的改进势能来代替,对碱基之间的氢键介导的相互作用提供了更为物理的描述。我们特别关注孤子解;雅库舍维奇模型预测了用来模拟“转录泡沫”的非线性激发的正确大小,这与改进的势基本上没有变化。相反,孤子动力学的其他特征,特别是孤子场配置的曲率和Peierls-Nabarro势垒发生了显著变化。 引用于6文件 MSC公司: 51年第35季度 孤子方程 92D20型 蛋白质序列,DNA序列 80年第35季度 PDE在物理以外领域的应用(MSC2000) 35B05型 PDE背景下的振荡、解的零点、中值定理等 关键词:雅库舍维奇模型;DNA;孤子解;空中电位;莫尔斯电势;Peierls-Nabarro屏障 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{G.Gaeta},J.非线性数学。物理学。14,编号1--4,57-81(2007;Zbl 1165.35439) 全文: DOI程序 arXiv公司 OA许可证 参考文献: [1] Barbi M,物理学。莱特。A 253第358页–(1999年)·doi:10.1016/S0375-9601(99)00059-6 [2] Barbi M,J.生物。物理学。第97页第24页–(1999年)·doi:10.1023/A:1005139326775 [3] Cadoni M,物理学。E版(2007年) [4] 卡拉丁C,《理解DNA》,学术出版社,伦敦,1992年;,第3版(2004) [5] Dauxois TH,物理学。莱特。A 159第390页–(1991年)·doi:10.1016/0375-9601(91)90367-H [6] Davydov A S,分子系统中的孤子(1981)·Zbl 1063.81686号 [7] 杜布罗文A,《现代几何学》(1984) [8] Englander S W,PNAS USA 77 pp 7222–(1980)·doi:10.1073/pnas.77.12.7222 [9] Gaeta G,物理学。莱特。A 143 pp 227–(1990)·doi:10.1016/0375-9601(90)90744-9 [10] Gaeta G,物理学。莱特。A 168第383页–(1992)·doi:10.1016/0375-9601(92)90523-O [11] Gaeta G,物理学。莱特。A 190第301页–(1994)·doi:10.1016/0375-9601(94)90759-5 [12] Gaeta G,J.生物学。物理学。第24页,第81页–(1999年)·doi:10.1023/A:1005158503806 [13] Gaeta G,物理学。版次E 74 pp 021921–(2006)·doi:10.1103/PhysRevE.74.021921 [14] Gaeta G,Rivista del Nuovo Cimento 17(4)第1页–(1994)·doi:10.1007/BF02724511 [15] Gonzalez J A,物理学。莱特。A 191第409页–(1994)·Zbl 0959.92500号 ·doi:10.1016/0375-9601(94)90795-1 [16] Lavery R,J.物理学:康登斯。第14页R383–(2002)·doi:10.1088/0953-8984/14/202 [17] Peyrard,M,1995年编辑。生物分子中的非线性激发。1994年在Les Houches举行的研讨会会议记录。1995年,柏林斯普林格出版社和《体育杂志》。 [18] Peyrard M,非线性17 pp R1–(2004)·Zbl 1092.82015年 ·doi:10.1088/0951-7715/17/2/R01 [19] Peyrard M,物理学。修订稿。第62页,2755页–(1989)·doi:10.1103/PhysRevLett.62.2755 [20] Saccomandi G,J.Royal Soc.Interface 3第655页–(2006)·doi:10.1098/rsif.2006.0126 [21] Saenger W,《核酸结构原理》(1984)·doi:10.1007/978-1-4612-5190-3 [22] Smith S B,《科学》258,第1122页–(1992年)·doi:10.1126/科学.1439819 [23] Yakushevich L V,物理。莱特。A 136第413页–(1989)·doi:10.1016/0375-9601(89)90425-8 [24] Yakushevich L V,Physica D 79第77页–(1994)·Zbl 0815.92008号 ·doi:10.1016/0167-2789(94)90038-8 [25] 雅库舍维奇L V,DNA的非线性物理,2。编辑(2004)·Zbl 0913.92001号 ·doi:10.1002/3527603700 [26] Yakushevich L V,物理。版本E 66 pp 016614–(2002)·doi:10.1103/PhysRevE.66.016614 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。它的项目与zbMATH标识符启发式匹配,并且可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。