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数据2Dynamics

swMATH ID: 25272
软件作者: Raue A、Steiert B、Schelker M、Kreutz C、Maiwald T、Hass H等
描述: Data2Dynamics:为动力系统中的参数估计量身定制的建模环境。利用常微分方程对动力系统建模是系统生物学领域的一种流行方法。该方法中最关键的两个步骤是为大型数据集和复杂实验条件构建生化反应网络的动力学模型,并为模型拟合执行高效可靠的参数估计。我们为MATLAB提供了一个建模环境,它开创了这些挑战。计算中数值昂贵的部分,如微分方程和相关灵敏度系统的求解,被并行化并自动编译成高效的C代码。各种参数估计算法以及用于不确定性分析的频率和贝叶斯方法已经实现,并在一系列应用中得到了应用,最终形成了出版物。可用性和实现:Data2Dynamics建模环境基于MATLAB,开源,可在http://www.data2dynamics.org。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26142188
源代码:  https://github.com/Data2Dynamics/d2d
相关软件: 阿米戈;科帕西;香蒜酱;PEtab公司;日晷;MEIGO公司;R(右);皮佩斯托;jInv公司;;蟒蛇;朱莉娅;PyBioNet适配;BioPreDyn试验台;Qlopt公司;Matlab公司;NL2SOL型;hIPPY库;AMICI公司;ScrumPy(滚动复制)
引用于: 11文件

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