数据2Dynamics swMATH ID: 25272 软件作者： Raue A、Steiert B、Schelker M、Kreutz C、Maiwald T、Hass H等 描述： Data2Dynamics：为动力系统中的参数估计量身定制的建模环境。利用常微分方程对动力系统建模是系统生物学领域的一种流行方法。该方法中最关键的两个步骤是为大型数据集和复杂实验条件构建生化反应网络的动力学模型，并为模型拟合执行高效可靠的参数估计。我们为MATLAB提供了一个建模环境，它开创了这些挑战。计算中数值昂贵的部分，如微分方程和相关灵敏度系统的求解，被并行化并自动编译成高效的C代码。各种参数估计算法以及用于不确定性分析的频率和贝叶斯方法已经实现，并在一系列应用中得到了应用，最终形成了出版物。可用性和实现：Data2Dynamics建模环境基于MATLAB，开源，可在http://www.data2dynamics.org。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26142188 源代码： https://github.com/Data2Dynamics/d2d 相关软件： 阿米戈;香蒜酱;PEtab公司;科帕西;日晷;R（右）;皮佩斯托;锑;蟒蛇;MEIGO公司;PyBioNet适配;BioPreDyn试验台;Qlopt公司;Matlab公司;NL2SOL型;AMICI公司;ScrumPy（滚动复制）;莫卡辛;简单SBML;libSBML（库SBML） 引用于： 8出版物 全部的 前5名20位作者引用 2 Ugur G.阿卜杜拉。 2 罗比·波图 1 皮亚·巴赫曼 1 Stefan Alois鲍尔 1 马可·宾德 1 戴安娜·克劳兹尼策 1 法国克莱门特 1 简·哈塞纳尔 1 维安·胡恩·图恩 1 拉尔斯·卡德拉利 1 亚当·马赫迪 1 乔纳斯·彼得斯 1 尼古拉斯·普菲斯特 1 钱，乔治 1 弗里德里克·罗宾 1 吉多·桑吉内蒂 1 莱昂纳德·施密斯特 1 大流士·施韦诺奇 1 丹尼尔·温德尔 1 罗曼·伊维内克 全部的 前5名7篇连载文章中引用 2 数学生物科学 1 计算物理杂志 1 数学生物学杂志 1 美国国家科学院院刊 1 SIAM应用数学杂志 1 理论生物学杂志 1 分子生物学方法 全部的 前5名10个领域引用 5 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 常微分方程（34-XX） 2 数值分析（65-XX） 1 偏微分方程（35-XX） 1 动力系统和遍历理论（37至XX） 1 概率论与随机过程（60-XX） 1 统计学（62-XX） 1 粒子和系统力学（70-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 1 系统论；控制（93至XX） 按年份列出的引文