Cutadapt公司 swMATH ID: 17303 软件作者： 马丁·M 描述： Cutadapt从高通量测序读取中删除适配器序列。Cutadapt从高通量测序读取中查找并删除适配器序列、引物、poly-A尾部和其他类型的不需要的序列。通常需要以这种方式清理数据：小RNA测序的读数包含3'测序适配器，因为读数比测序的分子长。Amplicon从引物序列开始读取。Poly-A尾部对从样品中提取RNA很有用，但通常你不希望它们出现在你的读数中。Cutadapt通过以容错的方式查找适配器或底漆序列来帮助完成这些修剪任务。它还可以以各种方式修改和过滤读取。适配器序列可以包含IUPAC通配符。此外，还支持成对读取甚至颜色空间数据。如果您愿意，也可以只对输入数据进行多路复用，而根本不删除适配器序列。Cutadapt附带了一套广泛的自动化测试，并根据麻省理工学院许可证的条款提供。 主页： https://github.com/marcelm/cutadapt网站 源代码： https://github.com/marcelm/cutadapt网站 相关软件： 快速质量控制;BLAT（爆炸）;github;努姆巴;B平滑;BSMAP公司;俾斯麦;甲基编码器;mrsFAST（快速）;蝴蝶结2;VarScan公司;BS导引头;Trimmomatic公司;FASTX公司;Samtools公司;关贸总公司;针织物;烤面包;银河;功能计数 引用于： 3文件 全部的 前5名7位作者引用 1 吉列尔莫·巴图伦 1 肖恩·戴维斯。 1 迈克尔·哈肯伯格 1 数学，埃维 1 JoséL.奥利弗。 1 斯文·拉赫曼 1 詹斯·曾格拉夫 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文