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俾斯麦

swMATH ID: 23504
软件作者： Krueger，F。；圣安德鲁斯
描述： 俾斯麦：一种灵活的比对器和甲基化调用器，用于二硫化物Seq应用。DNA亚硫酸氢钠处理和高通量测序（BS-Seq）的结合可以通过以单碱基分辨率显示全基因组胞嘧啶甲基化来捕捉细胞表观基因组状态的快照。Bismark是一种灵活的工具，用于对BS-Seq数据进行高效的时间分析，它可以在一个方便的步骤中执行读取映射和甲基化调用。它的输出区分CpG、CHG和CHH上下文中的胞嘧啶，并使实验室科学家能够在测序完成后很快可视化和解释其甲基化数据。可用性和实施：Bismark是根据GNU GPLv3+许可证发布的。源代码可从www.bioinformatics.bbsrc.ac.uk/projects/bismark/免费获得。
主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21493656
相关软件： B平滑;甲基试剂盒;蝴蝶结2;BS搜索器;BSMAP公司;STAR公司;Trimmomatic公司;快速质量控制;关贸总公司;HiTEC公司;勒波蒂;TFBS工具;ggplot2;基因组比对;业务连续性;rGADEM公司;iClusterPlus（iClusterPlus）;甲基寻求者;rGREAT公司;Trim Galore公司
引用于： 6文件

标准条款

1出版物描述软件 年份
Bismark：一种用于亚硫酸氢盐-seq应用的灵活对准器和甲基化调用者
Felix Krueger；西蒙·安德鲁斯。
2011
全部的 前5名

18位作者引用

1 阿卡林，阿尔图纳
1 吉列尔莫·巴图伦
1 斯特凡·坎扎尔
1 查克拉波蒂，舒纳克
1 佛兰德·弗兰克
1 迈克尔·哈肯伯格
1 林，吉米
1 Manuel E.拉德瑟。
1 托拜厄斯·马尔沙尔
1 JoséL·奥利弗。
1 安东尼·皮尔逊
1 乔纳森·罗宁
1 马塞尔·舒尔茨。
1 沈，卡罗尔
1 沈，托尼
1 孙淑英
1 乌亚尔，波拉
1 于小青

3篇连载文章中引用

1 数学生物学杂志
1 遗传学和分子生物学中的统计应用
1 查普曼和霍尔/CRC计算生物学系列

在4个字段中引用

6 生物学和其他自然科学（92-XX）
2 统计学（62-XX）
1 概率论与随机过程（60-XX）
1 计算机科学（68至XX）

按年份列出的引文