BISMA公司 swMATH ID: 23507 软件作者: Rohde,C.、Y.Zhang、R.Reinhardt、A.Jeltsch 描述: BISMA-从独特和重复序列中对单个克隆进行快速准确的亚硫酸氢盐测序数据分析。背景:亚硫酸氢盐测序是一种常用的高分辨率分析DNA甲基化模式的方法。PCR针对感兴趣的区域,通常分析约20-50个亚克隆DNA分子,以确定单个CpG位点的甲基化状态和分子分辨率。结果:用于分析初级亚硫酸氢盐测序数据的BISMA(亚硫酸盐测序DNA甲基化分析)软件实现了测序数据提取,并增强了数据处理、质量控制、甲基化状态的分析和表示。它使用改进的策略检测克隆分子和准确的CpG位点,并支持首次分析重复序列。结论:BISMA工作高度自动化,但仍为用户提供对分析所有步骤的完全控制。BISMA软件可免费作为在线工具,用于学术目的,分析来自独特和重复序列的亚硫酸氢盐测序数据http://biochem.jacobs-university.de/BDPC/BISMA/。 主页: https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-11-230 相关软件: B平滑;甲基试剂盒;BSMAP公司;PASS-bis(通过);COHCAP公司;SAAP-RRBS公司;MOABS公司;DMAP公司;HMM-DM公司;RRBSMAP公司;二硫醚;俾斯麦;甲基Sig;HMM-Fisher公司;BS搜索器 引用于: 1文件 标准条款 1出版物描述软件 年份 BISMA-快速准确的亚硫酸氢盐测序数据分析,分析来自独特和重复序列的单个克隆罗德,基督徒;张莹莹;理查德·莱因哈特(Richard Reinhardt);阿尔伯特·杰利奇 2010 2位作者引用 1 孙淑英 1 于晓青 连载1篇 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在2个字段中引用 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文