NGS-Trex公司 swMATH ID: 17151 软件作者： Ilenia Boria、Lara Boatti、Igor Saggese、Flavio Mignone 描述： NGS-Trex：RNA-Seq数据的自动分析工作流。RNA-Seq技术可以利用下一代测序平台快速分析整个转录组。此外，随着NGS分析成本的不断降低，RNA-Seq变得非常流行和广泛。不幸的是，数据分析在所需的生物信息技术和基础设施方面要求很高，因此限制了这种方法的潜在用户。在这里，我们描述了使用NGS-Trex平台（一个低用户交互、全自动的分析工作流）从原始序列到结果数据挖掘的样本数据的完整分析。通过网络界面使用，NGS-Trex处理数据并对样本的转录组进行分析，以确定表达的基因、转录本以及新的和已知的剪接变体。它还检测不同实验中差异表达的基因和转录物。 主页： http://link.springer.com/procol/10.1007/978-1-4939-2291-8_15 相关软件： ARB公司;EMBOS公司;最小值;埃米尔吉;维也纳RNA;标签清理器;OligoWalk公司;最优RNAi;阿斯塔拉维斯塔;预GPI;SPEPlip公司;BaCelLo公司;PolyA_DB公司;ASPicDB公司;生物城;Astex查看器;勺;战争;PatSearch（补丁搜索）;NGS QC工具包;ExpEdit（ExpEdit） 引用于： 1文件 1位作者引用 1 埃内斯托·皮卡迪 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 总体主题；集合（00-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文