预GPI swMATH ID: 17176 软件作者： Pierleoni A、Martelli PL、Casadio R 说明： PredGPI：一种GPI锚定预测器。背景：一些与质膜细胞外小叶相关的真核蛋白携带一个糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚，它在所谓的ω位点发生蛋白水解裂解后与C末端残基相连。发展了计算方法来区分从氨基酸序列开始进行翻译后修饰的蛋白质。然而，需要更准确的方法对整个蛋白质组进行可靠的注释。结果：这里我们提出了PredGPI，一种通过耦合隐马尔可夫模型（HMM）和支持向量机（SVM）的预测方法，能够有效预测GPI锚的存在和ω-位点的位置。PredGPI是在实验表征的GPI锚定蛋白的非冗余数据集上训练的，其注释在文献中进行了仔细检查。结论：PredGPI优于所有其他先前描述的方法，能够正确复制先前发表的高通量实验的结果。与其他可用方法相比，PredGPI的假阳性预测率更低，因此它是筛选整个蛋白质组的一种无成本、快速和准确的方法。 主页： http://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-9-392 相关软件： 图像J;菲比乌斯;pSLIP接口;奥克托普斯;群集查找;AA索引;PseAAC-建筑商;PROSITE公司;Cd命中;Memtype-2L型;PseAAC公司;伦敦银行支持向量机;ARB公司;EMBOS公司;最小值;埃米尔吉;维也纳RNA;标签清理器;OligoWalk公司;最优RNAi 引用于： 3文件 全部的 前5名7位作者引用 1 陈彦光 1 格雷厄姆（David M.Graham）。 1 布莱恩·科比尔凯维奇（Brian M.Kobylkevich）。 1 李国斌 1 马克·梅塞利。 1 埃内斯托·皮卡尔迪 1 安妮莎·萨尔卡 2篇连载文章中引用 2 理论生物学杂志 1 分子生物学方法 在4个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 总体主题；集合（00-XX） 1 统计学（62-XX） 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文