蝙蝠侠 swMATH ID: 34836 软件作者: Jie Hao、William Astle、Maria De Iorio、Timothy Ebbels 描述: BATMAN-一个R包,用于使用贝叶斯模型从核磁共振光谱中自动量化代谢物。动机:核磁共振谱被广泛用于代谢组学,以获得复杂生物混合物中的代谢物图谱。用于分配和估计代谢物浓度的常用方法包括专家手动峰值拟合或额外的预处理步骤,如峰值对齐和装箱。峰值拟合非常耗时,容易出现人为错误。相反,对齐和装箱可能会引入人工制品,并限制模型的即时生物学解释。结果:我们提出了Bayesian AuTomated代谢物核磁共振谱分析仪(BATMAN),这是一个R软件包,用于从一维核磁共振谱中解卷积峰,自动将其分配给目标列表中的特定代谢物,并获得浓度估计值。贝叶斯模型结合了代谢物特征峰模式的信息,能够解释生物样品NMR光谱中常见的峰位置的变化。它应用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)算法从模型参数的联合后验分布中进行采样,与传统的数值积分相比,获得了误差较小的浓度估计值,与经验丰富的分光镜学家的手动反褶积相当 主页: https://arxiv.org/abs/1112.5794 依赖项: R(右) 相关软件: BioMagResBank公司;自旋耦合器;Nmrglue胶水;海豚;Rtwalk公司;t形走道;PRMLT公司;ADVI公司;HMDB公司;阿达格拉德 引用于: 2文件 全部的 前5名6位作者引用 2 玛丽亚·德·伊奥里奥 2 叶丽峰 1 亚历山大·贝斯科斯 1 蒂莫西·艾伯尔斯(Timothy M.D.Ebbels)。 1 郝洁 1 安德烈亚斯·海内克 2篇连载文章中引用 1 统计与计算 1 贝叶斯分析 在2个字段中引用 2 统计学(62-XX) 2 数值分析(65-XX) 按年份列出的引文