AdaTiSS公司 swMATH编号： 43388 软件作者： 孟旺、江丽华、迈克尔·斯奈德 描述： AdaTiSS：一种新的用于识别组织特异性评分的数据自适应稳健方法。准确检测基因中的组织特异性（TS）有助于研究人员在分子水平上了解组织功能。基因型问题表达项目是一个公开的数据资源，提供跨多种组织类型的大规模基因表达。多重组织比较和异质组织表达使得准确识别组织特异性基因表达变得非常困难。如何区分内嵌表达式和离群表达式对于构建群体级信息和进一步量化TS至关重要。目前仍缺乏考虑数据异质性的稳健的数据自适应TS方法。结果：我们发现确定组织特异性基因表达的关键是正确定义表达群体的概念。在一个线性回归问题中，我们提出了一种新的数据自适应稳健估计方法（AdaReg），该方法在未知的异常值分布和非零的异常值比例下基于密度功率加权。在确定TS时考虑了高斯-种群混合模型。我们考虑了基因表达的异质性，并应用稳健的数据自适应程序估计种群参数。利用估计好的总体参数，我们构建了AdaTiSS算法。我们的AdaTiSS分析了每个基因和每个组织的TS，从而根据TS标准化了基因表达。我们为定义TS的文献提供了一个新的强大工具。可用性和实现：https://github.com/mwgrassgreen/AdaTiSS。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8652109/ 源代码： https://github.com/mwgrassgreen/AdaTiSS 依赖项： R（右） 相关软件： S-加;clusterProfiler（群集探查器）;WRS2型;坚固的基础;R（右） 引用于： 1文件 2位作者引用 1 蒋丽华 1 迈克尔·斯奈德。 连载1篇 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文