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ERX1886709型:Illumina HiSeq 2500配对末端测序;猪转录组注释和基因表达图谱
4次ILLUMINA(ILLUMINA HiSeq 2500)跑步:39.1M次,11.7G次,7.3Gb下载

提交人:罗斯林研究所
研究:猪转录组和基因表达图谱
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猪组织的RNA测序用于转录子注释和表达分析。生成组织特异性RNA-seq数据,以支持编码和非编码基因的注释,并测量组织特异性表达。本研究是FAANG项目的一部分,旨在促进数据的快速预发布,以支持研究团体。如《多伦多声明》(多伦多国际数据发布研讨会,Birney等人,2009)所确认,这些数据是根据劳德代尔堡原则发布的。出版前数据共享。《自然》461:168-170)。任何对该数据集的使用都必须遵守FAANG数据共享原则。数据生产者保留首次发表对这些数据的全球分析的权利。如果您不确定是否允许发布此数据集,请联系alan.archibald@roslin.ed.ac.uk, lel.eory@roslin.ed.ac.ukfaang@iastate.edu询问。完整指南可在http://www.faang.org/data-share-principle”.
样品:枕叶
生物体:苏斯克罗法
图书馆:
姓名:2023N_0104号
仪器:Illumina HiSeq 2500公司
战略:RNA-Seq号
资料来源:转录学
选择:反向rRNA
布局:配对
施工方案:TruSeq Straded mRNA样品制备指南E版
实验属性:(显示所有24个属性…)(隐藏…)
分析类型:高通量序列的转录谱分析(显示全文…)(隐藏…)
高通量测序的转录谱分析
样品储存:冷冻,-150冷冻箱
样品储存处理:液氮冷冻保存(死组织)
取样至制备间隔:4周
实验方案:http://support.illumina.com/content/dam/illumina-s(显示全文…)(隐藏…)
http://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/chemistry_documentation/samplepreps_truseq/truseqstrandedtotalrna/truseq-stranded-total-rna-sample-prep-guide-15031048-e.pdf
提取协议:ftp://ftp.faang.ebi.ac.uk/ftp/protocols/samples/RO(显示全文…)(隐藏…)
ftp://ftp.faang.ebi.ac.uk/ftp/protocols/samples/ROSLIN_SOP_Isolation_of_RNA_from_frozen_tissue_20161108.pdf
库准备位置:爱丁堡基因组学,爱丁堡大学,E(显示全文…)(隐藏…)
爱丁堡基因组学,爱丁堡大学,EH9 3FL,苏格兰爱丁堡
库准备位置经度:-3十进制度数
图书馆准备位置纬度:56十进制度数
库准备日期:2014年3月25日年月日
排序位置:爱丁堡基因组学,爱丁堡大学,E(显示全文…)(隐藏…)
爱丁堡基因组学,爱丁堡大学,EH9 3FL,苏格兰爱丁堡
排序位置经度:-3十进制度数
测序位置纬度:56十进制度数
排序日期:不适用
实验目标:总核糖核酸
rna制备3'适配器连接方案:http://support.illumina.com/content/dam/illumina-s(显示全文…)(隐藏…)
http://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/chemistry_documentation/samplepreps_truseq/truseqstrandedtotalrna/truseq-stranded-total-rna-sample-prep-guide-15031048-e.pdf
rna制备5'适配器连接方案:http://support.illumina.com/content/dam/illumina-s(显示全文…)(隐藏…)
http://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/chemistry_documentation/samplepreps_truseq/truseqstrandedtotalrna/truseq-stranded-total-rna-sample-prep-guide-15031048-e.pdf
文库生成pcr产物分离方案:http://support.illumina.com/content/dam/illumina-s(显示全文…)(隐藏…)
http://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/chemistry_documentation/samplepreps_truseq/truseqstrandedtotalrna/truseq-stranded-total-rna-sample-prep-guide-15031048-e.pdf
制备逆转录协议:http://support.illumina.com/content/dam/lillumina-s(显示全文…)(隐藏…)
http://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/chemistry_documentation/samplepreps_truseq/truseqstrandedtotalrna/truseq-stranded-total-rna-sample-prep-guide-15031048-e.pdf
库生成协议:http://support.illumina.com/content/dam/lillumina-s(显示全文…)(隐藏…)
http://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/chemistry_documentation/samplepreps_truseq/truseqstrandedtotalrna/truseq-stranded-total-rna-sample-prep-guide-15031048-e.pdf
读取链:配偶2感觉
rna纯度-260:280比率:1.96
rna纯度-260:230比率:0.8
rna完整性编号:8.3
跑:4次跑步,39.1M点,11.7G基础,7.3 Gb
运行#共个点#基础的大小出版
ERR1824433(错误1824433)11,600,3553.5克2.2 Gb2017-02-21
ERR1824434(错误1824434)11,825,1233.5克2.2 Gb2017-02-21
ERR1824513(错误1824513)7,825,3562.3克1.4 Gb2017-02-21
ERR1824514(错误1824514)7,895,8332.4克1.4 Gb2017-02-21

身份证件:
3732249

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