Genome-wide transcription profiling of the early phase of biofilm formation by Candida albicans

doi:10.1128/EC.4.9.1562-1573.2005

比较研究

.2005年9月；4(9):1562-73.

doi:10.1128/EC.4.9.1562-1573.2005。

白色念珠菌生物膜形成早期的基因组转录谱分析

路易斯·阿穆里略¹, 乔治·纽波特, 钟玉兰, 斯特凡·哈贝利茨, 简·邓根, 妮娜·阿加比安

附属公司

PMID： 16151249
预防性维修识别码：邮编：214198
内政部： 10.1128/EC.4.9.1562-1573.2005年

比较研究

白色念珠菌生物膜形成早期的基因组转录谱分析

路易斯·阿穆里略等。真核细胞. 2005年9月.

.2005年9月；4(9):1562-73.

doi:10.1128/EC.4.9.1562-1573.2005。

作者

路易斯·阿穆里略¹, 乔治·纽波特, 钟玉兰, 斯特凡·哈贝里茨, 简·邓根, 尼娜·M·阿加比（Nina M Agabian）

附属

¹加利福尼亚大学旧金山分校细胞和组织生物学系，地址：521 Parnassus Ave.，San Francisco，CA 94143-0422，USA。

PMID： 16151249
预防性维修识别码：项目经理1214198
内政部： 10.1128/EC.4.9.1562-1573.2005年

摘要

大多数微生物利用粘附表面和形成多细胞群落的能力在不断变化的环境中生存。生物膜的形成经历了不同的发展阶段，不仅影响医学，也影响工业和进化。在条件致病菌白色念珠菌等生物体中，作为生物膜生长的能力也是一种重要的持久性机制，有助于其在不同组织和医疗器械中广泛使用的非生物表面上生长。白念珠菌生物膜的早期特征是单个细胞粘附在基质上，随后形成复杂的菌丝网络，并开始形成致密结构。转录组的变化在与底物接触后30分钟内开始，包括硫代谢相关基因的表达，尤其是MET3，以及酿酒酵母中Ribi调节子的等效基因同源物。其中一些变更在早期启动并在整个过程中保持；其他仅限于生物膜形成的早期阶段。我们在这里确定了半胱氨酸代谢和白念珠菌谷胱甘肽生成相关基因生物膜相关表达的潜在替代途径。

PubMed免责声明

数字

**图1。**
AFM公司。使用尖端半径约为10 nm的DNPS氮化硅悬臂梁，在接触模式下对所有样品进行成像（纳米传感器）；不需要使用多孔膜（1）。扫描速度约为1 Hz，扫描尺寸在15至60μm之间。（A）细胞粘附(T型= 30); （B至E）生物膜的发展(T型=60至T型= 390). 巴：10μm（A和B）和30μm（C至E）。

**图2。**
福洛辛B染色*白色念珠菌*生物膜形成。使用一组五个培养皿，对应于生物膜形成中的每个基准点，用5μM Phloxine B（34）染色并拍照（Arcturus）。在生物膜形成的6小时内，染色差异明显。（A）T型= 30; （B）T型= 90; （C）T型= 270. 放大倍数，×40。

**图3。**
DNA微阵列分析与RT-PCR的相关性。三个基因，代表酵母特异基因(*YWP1号机组*)和两个生物膜上调(*MET3型*通过RT-PCR检测ORF19.6824）基因，并与从基因芯片数据中获得的信号值进行比较。扩增产物在1%琼脂糖凝胶上检测。车道数：0，T型= 0; 1到5，T型=30至T型=390（浮游）；6至10，T型=30至T型=390（生物膜）。

**图4。**
潜在的第二半胱氨酸合成途径*白色念珠菌。*同型半胱氨酸、蛋氨酸、半胱氨酸和*S公司*-显示了腺苷甲硫氨酸。在*酿酒酵母*（绿色基因）硫酸盐同化途径流向蛋氨酸和*S公司*-腺苷蛋氨酸。存在替代路径，如描述的OAS路径*A.鸟巢*在中找到*白色念珠菌*生物膜细胞（红色ORF）。

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[2] Ahimu、F.、A.Touhami和Y.F.Dufrene。2003。通过原子力显微镜实时成像活酵母细胞的表面形貌。酵母20:25-30。-公共医学

[3] Allen，M.J.、N.V.Hud、M.Balooch、R.J.Tench、W.J.Siekhaus和R.Balhorn。1992.鱼精蛋白复合DNA纤维的AFM图像中Tip-半径诱导的伪影。超微显微镜42:1095-1100。-公共医学

[4] Allen，M.J.、N.V.Hud、M.Balooch、R.J.Tench、W.J.Siekhaus和R.Balhorn。1992.鱼精蛋白复合DNA纤维的AFM图像中Tip-半径诱导的伪影。超微显微镜42:1095-1100。-公共医学

[5] Aoki，Y.、M.Yamamoto、S.M.Hosseini-Mazinani、N.Koshikawa、K.Sugimoto和M.Arisawa。1996年。抗真菌偶氮杆菌素通过抑制亚硫酸盐还原酶基因表达而显示出活性。抗微生物。代理Chemother。40:127-132.-项目管理咨询公司-公共医学

[6] Aoki，Y.、M.Yamamoto、S.M.Hosseini-Mazinani、N.Koshikawa、K.Sugimoto和M.Arisawa。1996年。抗真菌偶氮杆菌素通过抑制亚硫酸盐还原酶基因表达而显示出活性。抗微生物。代理Chemother。40:127-132.-项目管理咨询公司-公共医学

[7] Baek，Y.U.，Y.R.Kim，H.S.Yim和S.O.Kang。白念珠菌γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶的破坏导致谷胱甘肽绝对营养不良和凋亡。FEBS信函。556:47-52.-公共医学

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[9] Baillie，G.S.和L.J.Douglas。念珠菌生物膜的基质聚合物及其在生物膜对抗真菌药物耐药性中的可能作用。J.抗微生物。Chemother公司。46:397-403.-公共医学

[10] Baillie，G.S.和L.J.Douglas。念珠菌生物膜的基质聚合物及其在生物膜对抗真菌药物耐药性中的可能作用。J.抗微生物。Chemother公司。46:397-403.-公共医学

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