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GSE86490系列 GSE86490的查询数据集
状态 2018年5月1日公开
职务 UTX介导的增强子和染色质重塑通过ETS和GATA程序的非催化逆调节抑制髓系白血病的发生
有机体 小家鼠
实验类型 高通量测序的基因组结合/占有率分析
总结 组蛋白H3 Lys27特异性去甲基化酶UTX(或KDM6A)是多种癌症中功能丧失突变的靶点。在这里,我们证明UTX通过非催化功能抑制髓系白血病的发生,这一特性与其催化不活跃的Y染色体副对数UTY(或KDM6C)相同。与此相一致,我们证明KDM6A(UTX)和UTY在多种人类癌症中伴随丢失/突变。从机制上讲,全球基因组图谱显示H3K27me3仅发生微小变化,但H3K24ac和染色质可及性发生显著双向变化;H3K4me1修饰的主要损失;ETS和GATA-因子约束的变化;Utx缺失后基因表达发生改变。通过整合蛋白质组学和基因组分析,我们将这些变化与UTX对ATP-依赖性染色质重塑的调节、COMPASS复合体的协调以及ETS因子在AML进化过程中的先导活性增强联系起来。总之,我们的研究发现UTX通过抑制致癌ETS和上调肿瘤抑制GATA程序,在抑制急性髓系白血病中具有双重作用。
 
总体设计 参考单个系列
 
引文 29736013
提交日期 2016年9月6日
上次更新日期 2019年5月15日
联系人姓名 布赖恩·亨特利
电子邮件 bjph2@cam.ac.uk公司
组织名称 剑桥大学
部门 血液学系
街道地址 Hills路
西蒂 剑桥
邮政编码 CB2 0AW型
国家 大不列颠联合王国
 
平台(1)
GPL13112型 Illumina HiSeq 2000(小家鼠)
样品(20)
克/平方米304469 KAMX52-WT1-H3K27Me3型
GSM2304470 KAMX52-WT2-H3K27Me3型
GSM2304471标准 KAMX52-KO1-H3K27Me3型
此超级系列由以下子系列组成:
GSE86488型 UTX介导的染色质重塑通过ETS和GATA转录程序的非催化逆调控抑制髓系白血病的发生(ChIP-Seq)
GSE86489型 UTX介导的染色质重塑通过ETS和GATA转录程序的非催化逆调控抑制髓系白血病的发生(ATAC-Seq)
关系
生物项目 PRJNA342026型

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