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GSE8416系列 GSE8416的查询数据集
状态 2007年8月6日公开
标题 GSI,人类T-ALL
有机体 智人
实验类型 按数组分析表达式
总结 NOTCH信号级联在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)和许多其他人类癌症中被解除调控,为分子治疗提供了一个有吸引力的靶点。一种方法使用γ-分泌酶抑制剂(GSIs)抑制细胞内NOTCH(NICD)的生成,导致细胞生长停滞和凋亡。在这里,我们显示FBW7的错义突变或纯合缺失,FBW7编码靶向NICD进行破坏的泛素连接酶,介导构成性NICD表达。FBW7突变针对与NICD结合所需的关键精氨酸残基。虽然Fbw7的突变形式仍然与MYC结合,但它们并不以MYC为降解目标,这表明NICD和MYC的稳定可能有助于Fbw7突变白血病的转化。FBW7突变的白血病抵抗MRK-003 GSI的生长抑制和凋亡作用。在一些表达NICD的抗性系中,这种抗性伴随着NOTCH靶向DELTEX1以及MYC mRNA和蛋白的持续mRNA水平,这意味着由于突变FBW7导致的NICD残留活性可能有助于GSI抗性。
关键词:T-ALL、γ-分泌酶、GSI、细胞系比较、FBW7突变
 
总体设计 从培养细胞中分离的总RNA用于制造荧光标记的cRNA,并与DNA寡核苷酸杂交。简单地说,使用4µg总RNA通过逆转录合成dsDNA。cRNA由体外转录产生,并用Cy3或Cy5标记后合成。通过微阵列竞争杂交将标记cRNA的两个群体(参考群体和实验群体)相互比较。使用荧光染料反转策略对每个cRNA样本对进行两次杂交。人类微阵列含有约21000个基因对应的寡核苷酸探针。微阵列上的所有寡核苷酸探针都是用喷墨技术(安捷伦科技公司,加利福尼亚州帕洛阿尔托)原位合成的。杂交后,扫描阵列并记录每个探针的荧光强度。在对阵列强度数据进行归一化和校正后,获得转录物丰度比率(实验值与对照值)。使用Rosetta Resolver基因表达分析软件(华盛顿州西雅图Rosetta Biosoftware 6.0版)进行基因表达数据分析。
 
贡献者 奥尼尔J格里姆·J皮带P拉奥·S提比特斯D冬季C哈德威克JWelcker M公司Meijerink日本彼得斯R德雷塔·G西尔斯R比利时克勒曼看看
引文 1764640920007543
提交日期 2007年7月9日
上次更新日期 2012年3月17日
联系人姓名 奥利维娅·方
电子邮件 olivia.fong@merck.com
组织名称 默克公司。
部门 分子剖析
门诊化验室 默克研究实验室
街道地址 邮政信箱2000
西蒂 拉威
省/自治区 新冠肺炎
邮政编码 07065
国家 美国
 
平台(1)
GPL4372标准 Rosetta/Merck Human 44k 1.1微阵列
样品(36)
GSM208514标准 Jurkat第3天凌晨1点MRK-003
GSM208515标准 koptk1第3天1uM MRK-003
GSM208516标准 MOLT 4天3 1 uM MRK-003
关系
生物项目 项目编号A101469

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