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生物分子

生物分子是一个同行评审，关于生物活性和生物成因物质的结构和功能、具有生物和医学意义的分子机制以及生物材料及其应用的开放存取期刊。 生物分子由MDPI每月在线发布。The 西班牙生物化学和分子生物学学会（SEBBM）隶属于生物分子他们的会员可以在物品处理费用上获得折扣。

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高能见度：在中建立索引Scopus公司,科学之网,公共医学,MEDLINE公司,项目管理咨询公司,Embase公司,CAPlus/SciFinder、和其他数据库.
期刊排名：JCR-第一季度(生物化学与分子生物学)/CiteScore-第一季度(生物化学)
快速出版：手稿经过同行评议提交后约16.9天，将决定提供给作者；接受出版时间为2.9天（发表论文的中值这本杂志于2023年下半年出版）。
评审员的认可：提供及时、彻底的同行评审报告的评审员会收到代金券，使他们有权在任何MDPI期刊上的下一次出版的APC上获得折扣，以表彰他们所做的工作。
部分：出版于19年局部切片.
证词： 看看我们的编辑和作者是怎么说的生物分子.
同伴日记： 受体.

影响因素：5.5 (2022);5年影响因素：5.8（2022年）

印记信息期刊传单开放式访问 国际标准编号：2218-273X

最新文章

19页，4508 KiB

开放式访问第条

内源性脂肪酸激活角质形成细胞过氧化物酶体增殖物激活受体-β/δ（PPARβ/δ）

通过朱博凯,朱晓阳,迈克尔·博兰德,道格拉斯·H·拉尔夫,克里斯托弗·基亚罗,克里斯托弗·W·克劳斯,詹姆斯·恩坦比（James M.Ntambi）,亚当·格利克,安德鲁·帕特森,加里·佩杜,弗兰克·J·冈萨雷斯和杰弗里·彼得斯

生物分子 2024,14(6), 606;https://doi.org/10.3390/biom14060606-2024年5月21日

摘要

核激素受体依赖于与配体、蛋白质和染色质的相互作用，在转录活性和非活性复合物之间处于动态平衡。本研究验证了内源性配体激活角质形成细胞过氧化物酶体增殖物激活受体-β/δ（PPARβ/δ）的假说。佛波酯处理或HRAS[…]阅读更多信息。

核激素受体依赖于与配体、蛋白质和染色质的相互作用，在转录活性和非活性复合物之间处于动态平衡。本研究验证了内源性配体激活角质形成细胞过氧化物酶体增殖物激活受体-β/δ（PPARβ/δ）的假说。佛波酯治疗或原代角质形成细胞HRAS感染增加了与增强PPARβ/δ活性相关的脂肪酸。脂肪酸导致PPARβ/δ依赖性染色质占用和血管生成素样蛋白4表达增加(Angptl4号机组)mRNA分析显示硬脂酰Co-A去饱和酶1(Scd1号机组)调节角质形成细胞中作为PPARβ/δ配体的细胞内单不饱和脂肪酸的增加。用棕榈油酸或油酸激活PPARβ/δ会导致表达HRAS的角质形成细胞在细胞周期的G2/M期停滞，而在类似处理的HRAS表达细胞中没有发现Pparb/d（磅/天）-角质形成细胞缺失。HRAS表达第1页-空白小鼠角质形成细胞表现出增强的细胞增殖，这种效应可以通过棕榈油酸或油酸治疗缓解。与这些发现一致，PPARβ/δ与GW0742或油酸的配体激活阻止了UVB诱导的非黑色素瘤皮肤致癌作用，这种作用需要PPARβ-δ。这些研究的结果表明，PPARβ/δ在角质形成细胞中具有内源性作用，并可被饮食和细胞成分中的脂质激活。全文

（本文属于特刊过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）：Walter Wahli教授的主题议题)

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图1

13页，2969 KiB

开放式访问第条

益生菌的功效短乳杆菌对抗牙釉质表面脱矿过程的体外研究结果

通过塞雷娜·阿尔塔穆拉,弗朗西丝卡·罗萨里亚·奥杰洛,Eleonora奥尔图,大卫·彼得罗波里,贝内德塔·辛克,马里奥·贾诺尼和弗朗西丝卡·隆巴迪

生物分子 2024,14(5), 605;https://doi.org/10.3390/biom14050605-2024年5月20日

摘要

背景。牙釉质在保护人类牙齿底层方面起着至关重要的作用；因此，保存它至关重要。本实验研究旨在评估短乳杆菌抵消脱盐剂对牙釉质的作用[…]阅读更多信息。

背景。牙釉质在保护人类牙齿底层方面起着至关重要的作用；因此，保存它至关重要。本实验研究旨在评估短乳杆菌在体外抵消脱钙剂对牙釉质形态和矿物成分的作用。方法。样本包括12颗健康的人类后牙。每个牙齿的冠部纵向分为两个相等的部分。标本被随机分为四组：人工唾液、，短乳杆菌悬浮液、脱盐剂（DA）和DA plus短乳杆菌采用扫描电子显微镜（SEM）和能量色散X射线光谱（EDS）分别评估表面微观形貌和矿物含量。使用单向方差分析进行统计分析，然后进行Tukey的事后检验。结果。SEM分析没有突出显示牙釉质微观结构的显著变化短乳杆菌-处理后的样本与对照组进行比较。当标本与益生菌接触时，DA对牙釉质结构的损伤大大减少。DA处理显著降低了关键釉质矿物质（即钙和磷）的重量%。值得注意的是，益生菌能够逆转脱矿过程，使钙和磷重量%恢复到基本水平，包括钙磷比。结论。调查结果表明短乳杆菌能够有效保护牙釉质表面免受DA的损伤，提高牙釉质的抗脱矿能力。总的来说，短乳杆菌通过一种新的机制，在模拟龋齿过程的化学挑战下保护牙齿表面，证实其在预防或抵消龋齿损伤作用方面的功效。全文

（本文属于特刊益生菌在健康和疾病中的作用)

14页，5079 KiB

开放式访问第条

超声处理透明质酸水凝胶在体外调节CD44介导的人血管内皮细胞的血管生成潜力

通过Kelum Chamara Manoj Lakmal Elvitigala公司,威尔丹·穆巴洛克和酒井信治

生物分子 2024,14(5), 604;https://doi.org/10.3390/biom14050604-2024年5月20日

摘要

水凝胶的开发可以使血管内皮细胞形成毛细血管样网络，这对于推进组织工程和药物研发至关重要。在本研究中，我们通过[…]阅读更多信息。

开发能够使血管内皮细胞形成毛细血管样网络的水凝胶对于推进组织工程和药物发现至关重要。在本研究中，我们通过水溶液中的超声处理，开发了由平均分子量为490–159 kDa的酚醛透明质酸（HA-Ph）组成的水凝胶。这些水凝胶是在过氧化氢和酚化明胶存在下，通过辣根过氧化物酶催化苯酚部分交联而合成的。与原始的HA-Ph（490 kDa）和低降解的HA-Ph（312–399 kDa。此外，在这些水凝胶上培养的HUVEC形成了网络，而在由原始HA-Ph制成的水凝胶上没有出现。CD44表达和PI3K基因表达这两个与血管生成相关的标记物分别高3.5倍和1.8倍，与在含有原始HA-Ph的水凝胶上培养的细胞相比，在超声降解的HA-Ph水凝胶上培育的细胞中。这些结果突出了含有超声降解HA-Ph水凝胶在涉及人类血管内皮细胞的组织工程和药物筛选应用中的潜力。全文

（本文属于收藏“生物和生物材料”部分的专题论文)

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图1

17页，4649 KiB

开放式访问第条

胆固醇调节减弱单纯疱疹病毒1型感染诱导的AD样表型

通过布兰卡·萨尔加多,比阿特丽斯·伊兹基尔多,阿尔巴·萨帕塔,伊莎贝尔·萨斯特雷,亨利克·克里斯汀,朱莉娅·特雷罗斯,维克托·梅亚斯,玛丽亚·布利多和杰苏斯·阿尔杜多

生物分子 2024,14(5), 603;https://doi.org/10.3390/biom14050603-2024年5月20日

摘要

胆固醇是细胞膜的重要组成部分，它影响各种生物过程，包括膜运输、信号转导和人与人之间的相互作用。胆固醇稳态的破坏与先天性和后天性疾病有关，包括阿尔茨海默病（AD）等神经退行性疾病。我们以前的研究[…]阅读更多信息。

胆固醇是细胞膜的重要组成部分，它影响各种生物过程，包括膜运输、信号转导和人与人之间的相互作用。胆固醇稳态的破坏与先天性和后天性疾病有关，包括阿尔茨海默病（AD）等神经退行性疾病。我们小组先前的研究表明，单纯疱疹病毒I型（HSV-1）在几种感染细胞模型中诱导了AD样表型。本研究探讨胆固醇与HSV-1诱导的神经退行性变之间的相互作用。使用神经母细胞瘤细胞系SK-N-MC和N2a，通过甲基-β-环糊精（MβCD）调节胆固醇水平来确定胆固醇的影响。我们发现，HSV-1感染在类似内溶酶体/自噬区室的结构中触发胆固醇的细胞内积累，这一过程在MβCD治疗后是可逆的。此外，MβCD在HSV-1感染的各个阶段都表现出抑制作用，这突出了细胞胆固醇水平的重要性，不仅在病毒进入过程中，而且在随后的进入后阶段。MβCD还减轻了病毒感染诱导的AD-like神经变性的几个特征，包括溶酶体损伤和淀粉样β肽（Aβ）和磷酸化tau在细胞内的积累。总之，这些发现突出了胆固醇、神经变性和HSV-1感染之间的联系，为AD的潜在机制提供了有价值的见解。全文

（本文属于特刊神经退行性疾病生物标志物研究进展)

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图形摘要

11页，1327 KiB

开放式访问第条

基因组尺度代谢模型中NAD浓度的计算捕获了NAD缺失系统中的重要代谢变化

通过罗兰·索特,苏拉伊·夏尔马和伊内斯·海兰德

生物分子 2024,14(5), 602;https://doi.org/10.3390/biom14050602-2024年5月20日

摘要

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）是一种普遍存在于所有细胞中的分子，在许多代谢反应中起着关键的辅酶作用。它在能量代谢、细胞信号传递和DNA修复中起着至关重要的作用。值得注意的是，NAD水平随着年龄的增长而自然下降[…]阅读更多信息。

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）是一种普遍存在于所有细胞中的分子，在许多代谢反应中起着关键的辅酶作用。它在能量代谢、细胞信号传递和DNA修复中起着至关重要的作用。值得注意的是，NAD水平随着年龄的增长而自然下降，这种下降与各种与年龄相关的疾病的发生有关。尽管建立了这种联系，但目前的基因组代谢模型（为理解细胞代谢提供了强有力的工具）并没有考虑NAD浓度的动态变化。这妨碍了我们理解NAD水平波动对细胞代谢的影响及其对年龄相关疾病的贡献。为了弥补我们知识中的这一差距，我们设计了一种新的方法，将改变的NAD浓度整合到人类代谢的基因组模型中。这种方法使我们能够准确反映在亚细胞NAD水平受损的工程化人类细胞系中实验观察到的脂肪酸代谢、糖酵解和氧化磷酸化的变化。全文

（本文属于特刊生理学和病理学中的NAD代谢)

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图1

24页，11094 KiB

开放式访问第条

棕榈酸通过调节子宫内膜癌细胞应激和脂滴形成发挥抗肿瘤活性

通过赵子怡,王建东,孔伟民（Weimin Kong）,梅雷迪斯·A·牛顿,韦斯利·伯克特,《汶川太阳报》,林赛白金汉,吉利安·奥唐纳,红岩所,波尔登,沈小昌,张欣（Xin Zhang）,天然浩,周春晓和维多利亚·L.Bae-Jump

生物分子 2024,14（5），601；https://doi.org/10.3390/biom14050601-2024年5月20日

摘要

流行病学和临床证据广泛证明了肥胖在子宫内膜癌发生中的作用。然而，脂肪酸对子宫内膜癌细胞生长的影响尚未得到广泛研究。在这里，我们报道棕榈酸显著抑制细胞[…]阅读更多信息。

流行病学和临床证据广泛证明了肥胖在子宫内膜癌发生中的作用。然而，脂肪酸对子宫内膜癌细胞生长的影响尚未得到广泛研究。在此，我们报告了棕榈酸显著抑制子宫内膜癌细胞和子宫内膜癌原代培养物的细胞增殖，并降低子宫内膜癌转基因小鼠模型中的肿瘤生长，同时增加细胞应激和凋亡，减少细胞粘附和侵袭。N-乙酰-L-半胱氨酸抑制细胞应激可有效逆转棕榈酸对子宫内膜癌细胞增殖、凋亡和侵袭能力的影响。棕榈酸以时间和剂量依赖性的方式增加细胞内脂滴的形成。通过阻断DGAT1和DGAT2耗尽脂滴，有效提高了棕榈酸抑制细胞增殖和诱导裂解caspase 3活性的能力。总之，这项研究为棕榈酸对细胞增殖和侵袭以及脂滴形成的影响提供了新的见解，这些可能在肥胖驱动的子宫内膜癌的治疗中具有潜在的临床相关性。全文

（本文属于特刊子宫内膜异位症和子宫内膜癌的分子和细胞生物学)

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图1

12页，1982 KiB

开放式访问第条

用于快速突触囊泡融合的双环SNAREpin机械调节

通过马蒂厄·卡鲁尔和Frédéric Pincet

生物分子 2024,14(5), 600;https://doi.org/10.3390/biom14050600-2024年5月19日

摘要

在神经传递过程中，神经递质在动作电位到达后不到一毫秒就会释放出来。为了实现这一超快事件，突触囊泡必须预先对接到质膜上。在这种启动状态下，SNAREpins是一种蛋白质螺旋，其组装提供了[…]阅读更多信息。

在神经传递过程中，神经递质在动作电位到达后不到一毫秒就会释放出来。为了实现这一超快事件，突触囊泡必须预先对接到质膜上。在这种启动状态下，SNAREpins是一种蛋白质卷曲的线圈，其总成提供能量以触发融合，它的部分拉链和夹持就像发夹一样，保持打开状态，并准备在松开夹持时闭合。最近，有人提出，三种类型的调节因子，突触素、突触素和络合剂协同作用，组织两个同心环，一个中心环和一个外周环，每个环最多包含六个SNAREpin。我们使用了具有两种不同状态（半拉链和全拉链）的SNAREpin的力学模型，并根据每个环中SNAREpin的数量确定了能量景观。我们还进行了模拟，以估计每种情况下的融合时间。外围SNARE钉的存在通常会平滑能量景观并加快融合时间。根据预测的六个中央和六个外围SNARE钉的生理数量，由于外围SNAREpins的存在，融合时间至少加快了100倍，融合发生在10μs以内，这完全符合生理要求。全文

（本文属于特刊膜融合的分子机制研究)

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图1

11页，1692 KiB

开放式访问第条

3-羟基苯丙酸延缓麻痹秀丽隐杆线虫淀粉样β和聚谷氨酰胺蛋白毒性模型

通过布拉德福德·T·赫尔,凯拉·米勒,卡罗琳·科尔班,授予支持者,苏珊·希汉,罗恩·科尔斯坦杰和乔治·苏特芬

生物分子 2024,14(5), 599;https://doi.org/10.3390/biom14050599-2024年5月18日

摘要

年龄是阿尔茨海默病和亨廷顿病等神经退行性疾病的主要危险因素。阿尔茨海默病是痴呆症最常见的形式，也是美国老年人死亡的主要原因。没有有效的治疗方法[…]阅读更多信息。

年龄是阿尔茨海默氏症和亨廷顿舞蹈症等神经退行性疾病的主要危险因素。阿尔茨海默病是最常见的痴呆症，也是美国老年人死亡的主要原因。目前还没有有效的治疗这些疾病的方法。确定阿尔茨海默病、亨廷顿病和其他神经退行性疾病的有效治疗方法是当前国家科学资源的主要重点，迫切需要新的治疗策略。在这里，我们研究了使用秀丽隐杆线虫在体壁肌肉中表达淀粉样β或聚谷氨酰胺肽，分别模拟阿尔茨海默病和亨廷顿病的蛋白质毒性。我们发现，在两种模型中，击倒降解3HAA、3HAA双加氧酶（HAAO）的酶可以延缓与年龄相关的瘫痪。这种对瘫痪的影响与聚谷氨酰胺模型中的蛋白质聚集无关。我们还表明，补充3HAA模拟了对HAAO敲低蛋白毒性的保护机制，支持升高的3HAA作为将HAAO敲低与延迟性麻痹联系起来的中介事件。这项工作证明了3HAA作为神经退行性疾病靶向治疗的潜力，尽管其机制尚待探索。全文

（本文属于特刊寿命和衰老机制及调控的分子研究进展)

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图1

32页，8907 KiB

开放式访问第条

虎杖苷和烟酰胺通过线粒体未折叠蛋白反应（mtUPR）激活拯救线粒体疾病的细胞表型

通过保拉·西列洛斯·霍尔加多,大卫·戈梅斯·费尔南德斯,罗西奥·皮涅罗·佩雷斯,何塞·曼努埃尔·罗梅罗·多明格斯,马尔塔·塔拉文·雷伊,戴安娜·雷切·洛佩斯,胡安·米盖尔·苏亚雷斯-里韦罗,莫尼卡阿尔瓦雷斯-科尔多瓦,安娜·罗梅罗·冈萨雷斯,亚历杭德拉·洛佩斯·卡布雷拉,马尔塔·卡斯特罗·德·奥利维拉,安德烈斯·罗德里格斯-萨克里斯坦和何塞·安东尼奥·桑切兹·阿尔卡扎尔

生物分子 2024,14(5), 598;https://doi.org/10.3390/biom14050598-2024年5月18日

摘要

原发性线粒体疾病由核DNA（nDNA）或线粒体DNA（mtDNA）基因突变引起，这些基因编码对线粒体结构或功能至关重要的蛋白质。鉴于线粒体疾病的疾病特异性治疗很少，因此有必要采用新的治疗方法来逆转线粒体功能障碍。在这个[…]阅读更多信息。

原发性线粒体疾病由核DNA（nDNA）或线粒体DNA（mtDNA）基因突变引起，这些基因编码对线粒体结构或功能至关重要的蛋白质。鉴于线粒体疾病的疾病特异性治疗很少，因此有必要采用新的治疗方法来逆转线粒体功能障碍。在这项工作中，我们探索了利用成纤维细胞和诱导神经元治疗线粒体疾病的新方法，这些细胞来源于线粒体基因突变患者GFM1型基因。该基因编码参与线粒体蛋白质合成的必需线粒体翻译延伸因子G1。由于严重的线粒体缺陷GFM1型成纤维细胞不能在半乳糖培养基中存活，这使其成为检测药物有效性的理想筛选模型。我们发现，虎杖苷和烟酰胺的联合使用能够使突变株存活GFM1型成纤维细胞在应激介质中。我们还证明，虎杖苷和烟酰胺上调线粒体未折叠蛋白反应（mtUPR），尤其是SIRT3通路。mtUPR的激活部分恢复了线粒体蛋白质的合成和表达，并改善了细胞生物能量学。此外，我们在GFM1型从患者成纤维细胞直接重编程获得的突变诱导神经元。总的来说，我们提供了令人信服的证据，证明mtUPR激活是一种有希望的治疗策略GFM1型突变。全文

（本文属于特刊衰老和神经变性患者的线粒体质量控制)

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图1

11页，4615 KiB

开放式访问通信

寻找更好的基于肽（源自PD-L2）的免疫检查点抑制剂

通过鲍里斯·克莱班斯基,玛丽娜·巴克尔,维塔利·戈尔巴托克,奥尔加·维诺格拉多娃和约瑟夫·贝克尔

生物分子 2024,14(5), 597;https://doi.org/10.3390/biom14050597-2024年5月18日

摘要

目前的抗癌免疫检查点治疗依赖于主要针对PD-1/PD-L1（-L2）负调控通路的抗体。虽然这些抗体在某些癌症的治疗中非常成功，但对大多数患者并没有帮助，据推测，他们应该从这种治疗中受益。因此[…]阅读更多信息。

目前的抗癌免疫检查点治疗依赖于主要针对PD-1/PD-L1（-L2）负调控通路的抗体。虽然这些抗体在某些癌症的治疗中非常成功，但对大多数患者并没有帮助，据推测，他们应该从这种治疗中受益。因此，针对免疫检查点的新型、更有效药物的临床需求仍未满足。我们已经开发了一系列干扰PD-1/PD-L1（-L2）蛋白-蛋白质相互作用的高效肽抑制剂。我们最好的肽抑制剂是12和14个氨基酸长，显示亚微摩尔IC₅₀体外测定中的抑制活性。通过广泛建模探索了肽在PD-1结合位点内的定位。PD-1/肽复合物的2D NMR研究进一步支持了这一观点。这些结果反映了使用肽模拟物开发免疫检查点抑制剂的重大进展。全文

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图1

15页，4181 KiB

开放式访问第条

PPARγ拮抗剂通过调节铁凋亡和二硫中毒发挥抗肿瘤作用

通过张世玉,王颖（音）,顾俊杰,杨扬,景亮,王一梅,宁记,刘铭（音）,张颖欣,Silu Sun公司,陈谦明和李静（音译）

生物分子 2024,14(5), 596;https://doi.org/10.3390/biom14050596-2024年5月18日

摘要

口腔鳞状细胞癌（OSCC）是头颈部鳞癌的一种常见亚型，导致疾病复发和低生存率。PPARγ是一种配体依赖的核转录因子，在肿瘤发生发展中具有重要意义。然而，PPARγ在[…]阅读更多信息。

口腔鳞状细胞癌（OSCC）是头颈部鳞癌的一种常见亚型，导致疾病复发和低生存率。PPARγ是一种配体依赖的核转录因子，在肿瘤发生发展中具有重要意义。然而，PPARγ在OSCC发展中的作用尚未完全阐明。通过转录组测序分析，我们发现经PPARγ拮抗剂治疗后，铁凋亡相关分子显著富集。我们随后通过透射电镜、铁检测等证实了铁下垂的发生。值得注意的是，铁下垂抑制剂不能完全挽救PPARγ抑制剂引起的细胞死亡，当二硫中毒和铁下垂抑制剂共存时，挽救效果最大。我们确认确实存在二硫中毒表型。从机制上讲，通过qPCR和Western blotting，我们观察到PPARγ的抑制导致血红素加氧酶1（HMOX1）上调，从而促进铁沉积，而溶质载体家族7成员11（SLC7A11）也上调，促进OSCC中的二硫沉积。最后，利用飞行流式细胞术分析和多重免疫组织化学染色来表征PPARγ拮抗剂处理的小鼠舌原位移植瘤模型OSCC组织的免疫状态，结果表明，PPARγ的抑制导致了铁下垂和二硫中毒，促进cDC和CD8的聚集⁺T细胞，并抑制OSCC的进展。总之，我们的研究结果表明，PPARγ在OSCC的细胞死亡调节中起着关键作用，靶向PPARγ可能是OSCC的潜在治疗方法。全文

（本文属于特刊新型癌症治疗分子2.0)

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图1

18页，3294 KiB

开放式访问第条

上海不同猪种抗腹泻基因和免疫因子的检测与分析

通过周金勇,刘福勤,何梦倩,Jun Gao（高军）,吴彩凤,甘叶青,一边,金良伟,张伟建,张文刚,韩学军,戴建军和孙凌伟

生物分子 2024,14(5), 595;https://doi.org/10.3390/biom14050595-2024年5月17日

摘要

本研究的目的是确定抗原处理相关转运蛋白1的有效遗传标记(TAP1型)，α（1,2）岩藻糖基转移酶1(FUT1型)，自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1公司)，粘蛋白4(MUC4型)和[…]阅读更多信息。

本研究的目的是确定抗原处理相关转运蛋白1的有效遗传标记(TAP1型)，α（1,2）岩藻糖基转移酶1(FUT1型)，自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1公司)，粘蛋白4(MUC4型)和粘蛋白13(粘液13)上海白猪、枫泾猪、沙武头猪、眉山猪和浦东白猪等地方猪种的抗腹泻基因，为上海地方猪种资源的鉴定提供参考。应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLR）和序列测定分析上述基因的多态性，并结合一些免疫因素探讨对上海地方猪种免疫的影响。结果表明，两者都TAP1型和MUC4型五个猪品种中的基因具有抗腹泻基因型GGFUT1型在浦东白猪中检测到该基因NRAMP1公司在梅山猪中检测到该基因NRAMP1公司在浦东白猪身上检测到了该基因粘液13该基因仅在上海白猪中检测到。这个粘液13抗腹泻基因型GG仅在上海白猪中检出。这个TAP1型该基因在上海白猪、枫泾猪、沙武头猪、眉山猪和浦东白猪中具有中等多态性，其中TAP1型上海白猪和沙武托猪不满足哈代-温伯格平衡。这个FUT1型浦东白猪的基因处于低多态性状态。NRAMP1公司梅山猪和浦东白猪的遗传多样性处于中等多态状态，不符合哈代-温伯格平衡。这个MUC4型上海白猪和浦东白猪的基因处于低多态性状态MUC4型枫泾猪和沙屋头猪的基因处于中度多态状态MUC4型枫泾猪和浦东白猪的基因不满足哈代-温伯格平衡。这个粘液13上海白猪和浦东白猪的基因处于中度多态状态。梅山猪IL-2、IL-10、IgG和TNF-α水平较高，浦东白猪IL-12水平高于其他猪。在AA基因型中，白细胞介素12（IL-12）水平显著高于粘液13上海白猪的基因型比AG基因型好。AA基因型的肿瘤坏死因子α（TNF-α）指标抽头1枫泾猪的基因显著高于GG和AG基因型。沙武渡猪AG基因型IL-12指标的研究TAP1型该基因显著高于GG基因型。AA基因型的TNF-α水平NRAMP1公司梅山猪的基因显著高于AB基因型。AG型白细胞介素-2水平FUT1型该基因明显高于GG型浦东白猪，AA型浦东白猪的IL-2水平高于MUC4型基因显著高于AG型，GG型的IgG水平粘液13该基因明显高于AG型。本研究结果对指导上海白猪、枫泾猪、沙武头猪、眉山猪和浦东白猪的抗腹泻育种和分子选择具有重要意义，为今后上海地方猪种的抗腹泻选育奠定了基础。全文

（本条属于本节分子遗传学)

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图1

23页，6190 KiB

开放式访问审查

眼晶状体γ-晶体中高半胱氨酸含量的功能意义

通过尤金·塞雷布雷尼,瑞秋·W·马丁和杰玛·R·高桥

生物分子 2024,14(5), 594;https://doi.org/10.3390/biom14050594-2024年5月17日

摘要

白内障疾病与晶状体中寿命极长的晶体蛋白不断累积的氧化损伤密切相关。半胱氨酸氧化影响结晶蛋白折叠、相互作用和光散射聚集，特别是由于二硫键的形成。最小化晶体蛋白聚集对于[…]阅读更多信息。

白内障疾病与晶状体中寿命极长的晶体蛋白不断累积的氧化损伤密切相关。半胱氨酸氧化影响结晶蛋白折叠、相互作用和光散射聚集，特别是由于二硫键的形成。尽可能减少晶体蛋白聚集对晶状体终身透明至关重要，因此人们可以预计普遍存在的晶状体晶体蛋白超家族（α和βγ）几乎不含半胱氨酸。然而，γ-晶体蛋白的Cys含量远高于人类蛋白质的平均水平。我们回顾了与这一长期难题相关的文献，并利用扩展的基因组数据库和改进的蛋白质结构预测机器学习工具来进一步研究它。我们观察到βγ-晶体蛋白超家族中Cys的保守性极低；然而，在γ-晶体蛋白中，Cys残基的空间位置明显受到进化的微调。我们认为，长期透镜透明度和高透镜光功率的要求对透镜β-γ-晶体蛋白施加了竞争性进化压力，导致了不同的适应性：γ-晶体中Cys含量高，但βB-晶体中Cys含量低。水生物种需要比陆生物种更强大的晶状体，这解释了许多鱼类γ-（甚至β-）结晶蛋白的高蛋氨酸含量。最后，我们讨论了晶体中含硫残基和芳香残基之间的协同作用，并提出了未来的实验方向。全文

（本文属于特刊结晶蛋白的生理和病理功能)

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图1

17页，6331 KiB

开放式访问第条

Reelin调节新皮质神经网络活动的发育去同步化转变

通过穆罕默德·哈马德,奥巴达·拉巴亚,阿卜杜拉希姆·贾巴拉,索利曼·达乌德,佩蒂亚·彼得罗娃,巴萨姆·R·阿里,穆罕默德·阿洛赫,约阿希姆·赫兹和埃卡特·弗斯特

生物分子 2024,14(5), 593;https://doi.org/10.3390/biom14050593-2024年5月17日

摘要

在出生后发育的第一和第二阶段，新皮质神经元表现出广泛的自发同步活动（SSA）。在出生后第二周结束时，SSA被更稀疏和不同步的放电模式取代。发展的不同步[…]阅读更多信息。

在出生后发育的第一和第二阶段，新皮质神经元表现出广泛的自发同步活动（SSA）。在出生后第二周结束时，SSA被更稀疏和不同步的放电模式取代。新皮质自发神经元活动的发育失同步被认为是内在生成的，因为来自外围的感觉剥夺并不影响这种转变的时间进程。细胞外蛋白reelin通过多模式信号控制神经元发育的各个方面。然而，目前尚不清楚瑞林是否参与新皮质神经元的发育去同步化转变。本研究旨在通过条件性Relin敲除（Reln^cKO公司)小鼠模型。条件性reelin缺乏症是在出生后早期发育期间诱发的，Ca²⁺从体感皮层的器官型培养（OTC）中进行记录。我们的结果表明，野生型（wt）和Reln^cKO公司在出生后一周的早期表现出SSA模式。然而，在出生后第二周结束时，wt-OTC经历了向去同步网络活动模式的过渡，而Reln^cKO公司活动保持同步。这种变化的活动模式表明，瑞林参与调节皮层神经元网络活动的发育去同步化。此外，在Reln中观察到的发育性去同步障碍^cKO公司Reln获救时^cKO公司OTC与wt-OTC共同培养。最后，我们表明，出生后第二周结束时发育向去同步状态的过渡并不依赖于谷氨酸信号。相反，这种转变取决于GABA_一个R和GABA_B类R信号。结果表明，瑞林通过GABA控制发育去同步化_一个R和GABA_B类R信号。全文

（本条属于本节生物因素)

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图1

20页，23477 KiB

开放式访问第条

达格列嗪通过PI3K-Akt-eNOS途径改善后肢缺血后的血管生成

通过李涵,叶国欣,苏文静,朱元康,吴文奇,良师好,京高,甄莉,刘芳（音）和段俊丽

生物分子 2024,14(5), 592;https://doi.org/10.3390/biom14050592-2024年5月16日

摘要

近年来，抗糖尿病药物的血管保护作用受到了广泛关注。钠-葡萄糖协同转运蛋白2（SGLT2）抑制剂已证明可减少心血管（CV）事件。然而，达帕氟嗪对周围动脉疾病血管生成的治疗作用尚不清楚。本研究旨在[…]阅读更多信息。

近年来，抗糖尿病药物的血管保护作用受到了人们的广泛关注。钠-葡萄糖协同转运蛋白2（SGLT2）抑制剂已证明可减少心血管（CV）事件。然而，达帕氟嗪对周围动脉疾病血管生成的治疗作用尚不清楚。本研究旨在探讨达帕氟嗪对后肢缺血后血管生成的影响及其机制。我们首先评估了达帕氟嗪对大鼠后肢缺血后血管生成的影响。采用激光多普勒成像检测后肢血流灌注。此外，我们使用免疫组织化学检测缺血后新毛细血管的密度。通过磷酸化蛋白组学检测，筛选了达格列酮影响缺血后血管生成的相关信号通路，并从人脐静脉内皮细胞（HUVECs）水平验证了达格列酮影响缺血后血管生成的机制。切除左股动脉后，将所有大鼠随机分为两组：达格雷福林组（左股动脉切除，连续21天给予达格雷福林（1 mg/kg/d）胃内喂养）和模型组，即：，阳性对照组（左股动脉切除，用柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液（1mg/kg/d）灌胃，连续21天）。此外，添加了对照组，即阴性对照组（不切除左股动脉，连续21天用柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液（1 mg/kg/d）灌胃）。在术后第21天，达格雷福林治疗组的血液灌注最大，伴有毛细血管密度升高。结果表明，达帕氟嗪能促进后肢缺血后的血管生成。然后，取模型组和达格氟嗪组三只大鼠的缺血后肢内收肌组织样本进行磷酸化蛋白组学检测。结果表明，PI3K-Akt-eNOS信号通路与达帕氟嗪对缺血后血管生成的影响密切相关。我们的研究旨在从内皮细胞的角度验证这一机制。在体外，达格利福嗪可增强缺血和缺氧条件下HUVEC的管形成、迁移和增殖。此外，在体内和体外，达加氟嗪给药上调了血管生成因子磷酸化Akt（p-Akt）和磷酸化内皮一氧化氮合酶（p-eNOS）以及血管内皮生长因子A（VEGFA）的表达。这些益处可以被磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）或eNOS抑制剂阻断。达帕氟嗪能促进缺血后血管生成。这种效应可能通过促进PI3K-Akt-eNOS信号通路的激活来实现。本研究为外周动脉疾病的治疗提供了新的视角、新的思路和理论基础。全文

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图1

13页，5060 KiB

开放式访问第条

与ARRDC1或CD63融合：一种增强p53在细胞外囊泡中负载以抑制肿瘤的策略

通过刘敏（音）,于章,何剑锋,刘万喜,李哲轩,Yiti Zhang（张益蒂）,敖固,赵明日,刘木军（Mujun Liu）和刘雄浩

生物分子 2024,14(5), 591;https://doi.org/10.3390/biom14050591-2024年5月16日

摘要

小细胞外囊泡（sEV）已成为有希望的治疗剂和药物输送载体。使用基因改造策略对sEV及其内容物进行定向改造是最流行的方法之一。本研究探讨了p53与含有arrestin结构域的融合的作用[…]阅读更多信息。

小细胞外囊泡（sEV）已成为有希望的治疗剂和药物输送载体。使用基因改造策略对sEV及其内容物进行定向改造是最流行的方法之一。本研究研究了p53与arrestin结构域相关蛋白1（ARRDC1）和CD63融合对sEVs生成、p53负载效率和治疗效果的影响。ARRDC1-p53（ARP）或CD63-p53（CDP）的过度表达显著升高了p53 mRNA和蛋白水平。ARRDC1和CD63的掺入显著增强了HEK293T-sEV的生物发生，sEV相关蛋白TSG101和LAMP1的显著增加证明了这一点，从而促进了sEV生成。重要的是，与ARRDC1或CD63融合显著提高了将p53融合蛋白及其mRNA载入sEV的效率。携带ARP或CDP的sEV显著增强p53融合蛋白和mRNA在p53完整H1299细胞中的富集，导致细胞凋亡显著增加，细胞增殖减少，ARP-sEV比CDP-sEVs更有效。这些发现强调了ARRDC1和CD63修饰的sEV的功能增强，强调了基于sEV治疗靶向癌症的潜在基因修饰。全文

（本文属于主题细胞外囊泡在癌症诊断和治疗中的作用)

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图1

17页，1417 KiB

开放式访问第条

MedicalCLIP：具有非对称约束的异常检测领域泛化

通过刘洁华,罗月怡,向前气和Jun Long先生

生物分子 2024,14(5), 590;https://doi.org/10.3390/biom14050590-2024年5月16日

摘要

医学数据具有独特的特异性和专业性，需要大量的领域专业知识进行注释。精确的数据注释对于异常检测任务至关重要，这使得训练过程变得复杂。领域泛化（DG）是增强医学图像异常检测（AD）的重要方法。这篇论文[…]阅读更多信息。

医学数据具有独特的特异性和专业性，需要大量的领域专业知识来进行注释。精确的数据注释对于异常检测任务至关重要，这使得训练过程变得复杂。领域泛化（DG）是增强医学图像异常检测（AD）的重要方法。本文介绍了一种新的多模态异常检测框架MedicalCLIP。MedicalCLIP在异常检测任务中使用多模态数据，并在图像和文本的模式中建立不规则约束。MedicalCLIP的关键在于学习模式内细节表示，并将其与文本语义引导的跨模式对比学习相结合，使模型在捕获更详细信息的同时关注语义信息，从而实现更精细的异常检测。MedicalCLIP依靠GPT提示生成文本，减少了对医疗数据专业描述的需求。医学数据的文本构造有助于提高异常检测任务中多模态模型的泛化能力。此外，在文本-图像对比度增强过程中，模型从图像数据中选择和提取信息的能力得到了提高。通过层次对比度损失，在图像再现过程中实现了细粒度表示。MedicalCLIP已经在各种医学数据集上进行了验证，在医学数据异常检测中显示出良好的域泛化性能。在异常分类和分割度量方面都观察到了改进。在涉及大脑数据的异常分类（AC）任务中，该方法比现有最佳方法的性能提高了2.81。全文

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图1

20页，4631 KiB

开放式访问第条

绞股蓝苷XVII减少大鼠突触谷氨酸释放并保护其免受兴奋性毒性损伤

通过成都路,林子玉,关明秋,李明义和王素珍（Su-Jane Wang）

生物分子 2024,14(5), 589;https://doi.org/10.3390/biom14050589-2024年5月16日

摘要

兴奋性毒性是谷氨酸过量引起的神经系统疾病的常见病理过程。本研究的目的是评估绞股蓝皂苷单体绞股蓝苷十七（GP-17）对谷氨酸系统的影响。体外，大鼠皮层神经终末（突触体），GP-17[…]阅读更多信息。

兴奋性毒性是谷氨酸过量引起的神经系统疾病的常见病理过程。本研究的目的是评估绞股蓝皂苷单体绞股蓝苷十七（GP-17）对谷氨酸系统的影响。在体外，在大鼠皮层神经终末（突触体）中，GP-17剂量依赖性地降低了IC的谷氨酸释放₅₀16μM。细胞外钙的去除²⁺或阻断N型和P/Q型Ca²⁺通道和蛋白激酶A（PKA）消除了GP-17对皮层突触体谷氨酸释放的抑制作用。GP-17还显著降低了皮层突触体中PKA、SNAP-25和突触素I的磷酸化。在由红藻氨酸（KA）诱导的谷氨酸兴奋性毒性体内大鼠模型中，GP-17预处理显著预防了癫痫发作，并挽救了皮层神经元损伤和谷氨酸升高。GP-17预处理降低了钾处理大鼠皮层钠偶联中性氨基酸转运蛋白1、谷氨酸合成酶谷氨酰胺酶和囊泡谷氨酸转运蛋白1的表达水平，但增加了谷氨酸代谢酶谷氨酸脱氢酶的表达水平。此外，GP-17预处理可以阻止KA诱导的皮层N-甲基-D-天冬氨酸受体亚单位GluN2A和GluN2B的改变。GP-17还可以阻止KA诱导的脑血流量和精氨酸酶II表达的减少。这些结果表明，（i）GP-17通过抑制N型和P/Q型Ca²⁺通道和随后的PKA介导的SNAP-25和突触蛋白酶I磷酸化，减少皮质突触体的谷氨酸胞吐；和（ii）GP-17通过调节突触谷氨酸释放和脑血流，对KA诱导的大鼠谷氨酸兴奋性毒性具有神经保护作用。全文

（本条属于本节天然和生物诱导分子)

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图1

11页，1959 KiB

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胆固醇肟肟作为人类胆碱酯酶潜在配体的评估

通过多拉·科利奇,戈兰·西恩科,卢多维奇·让,穆拉德·乔亚,何塞·迪亚斯,何塞·马可·孔特勒和兹林卡·科瓦里克

生物分子 2024,14(5), 588;https://doi.org/10.3390/biom14050588-2024年5月15日

摘要

Olesoxime是一种含肟基团的胆固醇衍生物，具有跨越血脑屏障的能力，在临床研究中表现出良好的安全性和耐受性。这些特征表明它可能是乙酰胆碱酯酶（AChE）和丁酰胆碱脂酶的中心活性配体[…]阅读更多信息。

Olesoxime是一种含肟基团的胆固醇衍生物，具有跨越血脑屏障的能力，在临床研究中表现出良好的安全性和耐受性。这些特征表明，它可能是乙酰胆碱酯酶（AChE）和丁酰胆碱脂酶（BChE）的中心活性配体，有机磷化合物（OP）对其活性的破坏会导致不受控制的兴奋和潜在的危及生命的症状。为了评估olesoxime作为人类AChE和BChE的结合配体和活化剂，我们进行了在体外利用杀虫剂对硫磷、对氧磷和作战神经毒剂沙林、环沙林、塔邦和VX的活性代谢物进行动力学研究。我们的结果表明，这两种酶在中微摩尔范围内对肟具有结合亲和力，高于使用中的解毒剂（即2-PAM、HI-6等）。虽然olesoxime对AChE的再激活能力较弱，但环沙林抑制的BChE被重新激活，总的再激活速率常数与标准肟HI-6相当。此外，结合肟2-PAM，环沙林和沙林抑制的BChE的再激活最大值增加了10-30%。分子模型揭示了橄榄肟和BChE之间的有效相互作用，突出表明橄榄肟是一种潜在的BChE靶向治疗。此外，可将其添加到OP中毒治疗中，以提高BChE再激活的功效，其胆固醇支架可为开发新型肟类解毒剂提供基础。全文

（本文属于特刊胆碱酯酶在阿尔茨海默病和其他神经退行性疾病中的作用)

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图1

10页，1246 KiB

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Fluobodies/Chromobodies质量评估实用指南

通过乌尔沙·萨特,克劳迪娅·德科尔,露西娅·西卡特里西索娃,米尔娜·纳基奇,马泰奥·德马奇和阿里奥·德马尔科

生物分子 2024,14（5），587页；https://doi.org/10.3390/biom14050587-2024年5月15日

摘要

背景：荧光蛋白（FPs）是流式细胞术分析或荧光显微镜的关键试剂。通过将重组纳米体与FP融合，开发了新一代免疫试剂（荧光体/染色体）。方法：我们通过凝胶过滤组合分析此类生物分子的质量[…]阅读更多信息。

背景：荧光蛋白（FPs）是流式细胞术分析或荧光显微镜的关键试剂。通过将重组纳米体与FP融合，开发了新一代免疫试剂（荧光体/染色体）。方法：我们通过凝胶过滤和SDS-PAGE相结合的方法分析这些生物分子的质量，以识别由于聚集或材料降解导致的人工制品。结果：在SDS-PAGE过程中，发现了与单独的荧光体相对应的意外条带，并将其表征为降解产物或人工制品，系统地导致出现特定的荧光蛋白和一些实验条件。FPs中N末端蛋氨酸的消除不会影响FP片段的外观，而一些FP结构的稳定性和迁移特性受到加载缓冲液中加热的强烈影响，这是电泳分离前样品经历的一个步骤。结论：在这项工作中，我们对荧光体质量控制过程中观察到的一些奇怪结果进行了解释，并总结了选择最方便的FP融合抗体片段的实用建议。全文

（本文属于特刊纳米生物物理特性优化的传统方法和基于硅的方法)

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