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PDBsum条目4lmm
转至PDB代码:
蛋白质结合
PDB id
400万
目录
蛋白质
链
公元91年。
配体
ACY公司
金属
_CL公司
水域
×129
PDB文件中列出的参考
关键参考
标题
晶格陷阱捕获的nherf1-Cxcr2信号复合物的新构象状态。
作者
姜瑜,
G.Lu,
L.R.特雷斯科特,
侯耀文,
X.Guan、,
S.Wang,
A.斯塔门科维奇,
J.Brunzelle,
N.Sirinupong,
C.李,
Z.杨。
裁判。
公共科学图书馆期刊
, 2013,
8
,
e81904。
[
DOI编号:
10.1371/日记本.0081904
]
公共医疗id
24339979
摘要
NHERF1是一种PDZ衔接蛋白,支持多种信号的组装
并与许多癌症有关。
然而,人们知之甚少
关于脚手架混乱或其能力的机制
绑定到多个目标。
计算研究表明,PDZ
混杂可能归因于其构象动力学,但实验性的
这种关系的证据仍然非常有限。
在这里,我们检查
利用晶格研究NHERF1 PDZ1畴的构象柔性
通过求解新晶体形式的PDZ1结构进行捕获,
与不同空间群的先前PDZ1结构一起,揭示了4
11个配体相互作用残基中有11个发生了显著的晶体堆积诱导
结构变化。
这些残留物大多与所涉及的残留物相对应
肽配体结合时的变构转变。
此外
配体构象的差异导致相同的肽轻微结合
不同晶体形式的不同模式。
这些发现表明
PDZ1多肽结合具有显著的结构灵活性
袋,并且捕获在当前晶体形式中的结构亚态可以是
用于表示蛋白质可访问的构象空间。
这样的
知识对于针对NHERF1 PDZ1结构域的药物设计至关重要,
强调对实验测定的PDZ1-l和
复合物。
PROCHECK检查
标题