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寡聚物

  

此软件包适用于Bioconductor 2.10版;有关稳定的最新版本,请参阅寡聚物.

寡核苷酸阵列的预处理工具。

生物导体版本:2.10

用于在探针水平分析寡核苷酸阵列(expression/SNP/tiling/exon)的软件包。它目前支持Affymetrix(CEL文件)和NimbleGen阵列(XYS文件)。

作者:Benilton Carvalho和Rafael Irizarry。撰稿人:本·博尔斯塔德、文森特·凯里、沃尔夫冈·胡贝尔、哈里斯·贾菲、吉姆·麦克唐纳、马特·塞勒斯

维修人员:Benilton Carvalho<Benilton。Carvalho在cancer.org.uk上>

引文(来自R,进入引文(“oligo”)):

安装

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PDF格式 低聚物-底漆
PDF格式   参考手册
文本   新闻

细节

生物视图 生物信息学,数据导入,差异表达式,ExonArray公司,基因表达,微阵列,一个频道,预处理,SNP公司,软件,双通道
版本 1.20.4
在生物导体中 生物技术2.0(R-2.5)(9年)
许可证 LGPL(>=2)
取决于 R(>=2.14.0),寡头类(>= 1.17.35)
进口 阿菲奥(>= 1.23.2),affxparser软件(>= 1.27.5),博科生物(>= 2.15.4),生物串(>= 2.23.6),生物遗传学(>= 0.1.14),数据库接口(>= 0.2-5),ff(关闭),图形,方法,预处理核心(>=1.17.7),样条曲线,统计,统计4,实用程序,zlibbico公司
链接到 预处理核心
建议 hapmap100kxba,pd.mapping50k.xba240磅,pd.huex.1.0.st.v2,pd.hg18.60mer.expr公司,pd.hugene.1.0.st.v1,maqcExpression4plex,基因过滤器,利马,R彩色啤酒,寡头数据,RUnit(运行单位)
系统要求
增强功能 ff(关闭),国防部军事司令部,doMPI(doMPI)
统一资源定位地址
取决于我 斜体字,寡数据,pd.081229.hg18.发起人.medip.hx1,pd.2006.07.18.hg18.refseq.提示符,pd.2006.07.18.mm8.参考序列号,pd.2006.10.31.rn34.refseq.罗马特,太平洋航空公司,pd.aragene.1.0.st,pd.aragenee.1.1.st版,pd.ath1.121501,pd.巴利1,pd.bovgene.1.st文件,pd.绵羊,pd.枯草杆菌,pd.范围.1.1.st,pd.嘌呤,pd.犬齿。2,pd.线虫,pd.charm.hg18示例,pd.鸡肉,pd.柑橘,pd.棉花,pd.cyrgene.1.1.st版,pd.cytogenetics.阵列,玫瑰基因组1,pd.果蝇.2,大肠杆菌2型,大肠杆菌,电子邮箱.asv2,pd.equgene.1.0.st,pd.equgene.1.1.st版,pd.feinberg.hg18.me.hx1,pd.feinberg.mm8.me.hx1,pd.felgene.1.st文件,pd.基因组5,pd.全基因组snp.6,pd.hc.g110号文件,pd.hg.焦点,pd.hg.u133.加.2,邮编:u133a,钯汞铀133a.2,pd.hg.u133a.标签,pd.hg.u133b型,pd.hg.u219型,pd.hg.u95a型,pd.hg.u95av2型,pd.hg.u95b型,pd.hg.u95c型,pd.hg.u95d型,pd.hg.u95e型,pd.ht.hg.u133.plus.pm文件,pd.ht.hg.u133a型,pd.ht.mg.430a,pd.hu6800型,pd.huex.1.0.st.v2,pd.hugene.1.0.st.v1,pd.hugene.1.1.st.v1版本,pd.尺寸,pd.映射250k.nsp,pd.mapping250k.sty公司,pd.mapping50k.hind240,pd.映射50k.xba240,pd.医学,pd.mg.u74a型,pd.mg.u74av2型,pd.mg.u74b型,pd.mg.u74bv2,pd.mg.u74c,pd.mg.u74cv2型,局部mirna.1.0,pd.moe430a公司,pd.moe430b公司,pd.moex.1.0.st.v1,pd.mogene.1.0.st.v1,pd.mogene.1.1.st.v1,pd.鼠标430.2,pd.鼠标430a.2,pd.mu11变电站,pd.mu11k橡胶,pd.卵生.1.0.st,pd.卵生.1.1.st,pd.pae.g1a,pd.等离子.无窗口,pd.pollar公司,pd.猪,pd.porgene.1.0.st版,pd.porgene.1.1.st文件,pd.rae230a型,pd.rae230b型,pd.raex.1.0.st.v1,pd.ragen.1.0.st.v1,pd.代理1.1.st.v1,局部额定值230.2,pd.rg.u34a型,pd.rg.u34b型,pd.rg.u34c,pd.rhegene.1.st文件,pd.rhesus公司,pd.冰,pd.rn.u34号,pd.s.aureus公司,pd.大豆,pd.soygene.1.1.st,pd.甘蔗,pd.托马托,pd.u133.x3p型,葡萄球菌,pd.小麦,pd.x.laevis.2号,pd.x.热带,pd.xenobus.laevis公司,pd.酵母.2,pd.yg.s98型,pd.zebgene.1.st,pd.斑马鱼,pdf信息生成器
导入我 魅力,中国农场,联邦铁路管理局,斜体字
建议我 生物遗传学,fastseg公司,frma工具,hapmap100khind公司,hapmap100kxba,hapmap500knsp公司,hapmap500ksty公司,hapmapsnp5型,hapmapsnp6基因,maqcExpression4plex
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Windows二进制 oligo_1.20.4.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
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Git源 https://github.com/Bioconductor-mirror/oligo/tree/release-2.10
包短Url http://bioconductor.org/packages/oligo/
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