使用Jmol:A-L的网站
使用J（S）mol的网站 课堂上的J（S）mol 使用J（S）mol的日志 J（S）mol文献 使用J（S）mol的文章 使用J（S）mol的书籍 使用J（S）mol的Wiki 博客使用J（S）mol CMS使用J（S）mol （穆德和其他公司） 课程管理系统、学习管理系统、虚拟学习环境、电子学习平台 嵌入Jmol的应用程序 分布包括Jmol 蓝色方尖碑
3Dchem.com网站 牛津大学的Molecule of The Month网站现已更新为使用Jmol，显示了数百种小分子、无机多面体和蛋白质结构 -卡尔·哈里森，英国牛津。 3D电子显微镜数据导航器 大阪大学提供了Yorodumi Viewer，它使用Jmol绘制电子密度图。 单击 结构查看器 链接以查看示例。 请注意，Jmol可以在页面中调整大小。 有机化学中的三维结构 与基础有机化学（DE）教学相关的模型和结构 -PD Stefan Immel博士 手足和手性分子的三维结构 可视化不同类型手性（DE）的结构 -PD Stefan Immel博士 振动光谱中的三维结构和动画 红外光谱（DE）中用于可视化振动频率的结构和动画 -PD Stefan Immel博士
锚查询 针对MCR化学中蛋白质相互作用的专门药效团搜索。 匹兹堡大学。 模型链接的注释列表 英国纽卡斯尔大学BWT的本科无机或结构化学教学模型网页组合列表，以及可能的使用说明 Aptanomics内部网 Jmol小程序用于探索我们数据库中的分子结构。 -法国里昂Aptanomics SA。 生物分子生物学研究 作者：M.Gonzalo Claros -马拉加大学，马拉加（西班牙）。 Arduengo研究小组X射线结构 Jmol applet用于描述A.J.Arduengo教授研究小组获得的X射线结构（结构条目 结构 链接。 -美国阿拉巴马大学塔斯卡卢萨分校。 大分子图谱 是一个包含150多个3D蛋白质或核酸结构的可浏览列表，其中许多结构带有快照，每个结构都有可在中查看的链接 JSmol简介 . 创作模板 对于使用JSmol（JTAT）的教程，2018年8月更新为使用JSmol。 下载一个模板，您可以在其中插入分子视图和文本。 需要使用纯文本编辑器。 提供了详细说明。
互动分子银行 这是一个正在进行的项目，旨在为高中和高等教育学生和教师提供工具，以培养全面的化学教学经验- 西班牙语，由 埃纳尔·库廷 ，洛斯安第斯大学（委内瑞拉）。 BF3分子轨道 用于教学的可点击MO能级图，导致Jmol/JSmol模型显示价层轨道的表面和/或轮廓-英国纽卡斯尔大学 医学生生物化学——蛋白质结构与功能 与医学相关的蛋白质结构的例子-- Eric Walters，罗莎琳德·富兰克林医科大学（美国）。 生物模型 生物分子结构和相互作用的教学资源和自导学习：氨基酸、碳水化合物、立体异构体、脂质、脂质双层、蛋白质、核酸、核酸-蛋白质复合物、生物聚合物 -西班牙语，由 安吉尔·埃尔雷斯（Angel Herráez） 阿尔卡拉大学（西班牙）。 还有一些部分用英语复制 用户可以选择Jmol或JSmol。 生物分子探险家3D 旨在让高中生物教师轻松访问生物重要分子的交互式3D结构。 网站和CD-ROM。 肯扬的生物分子 肯扬学院本科生创建的Jmol教程。 生物ROM Ayudas para el aprendizaje de bioquímica，biochnologyía y biología分子 -西班牙和智利几所大学合作的西班牙语教材。 网站和CD-ROM。 生物主题 简单生物分子的三维结构——碳水化合物、脂类、核酸和其他生物感兴趣的化合物。 生物维基 使用带有Jmol applet的DokuWiki，用户可以在wiki中的任何位置轻松放置三维分子模型。 浏览器链接的Chemkin型热力学数据库 演示如何在不改变传统数据库的情况下链接化学昵称和结构。
化学计算 免费计算化学教育。 免费使用GAMESS、TINKER、NAMD和Psi4运行计算作业。 化学教育DL 分子360 （原网址：www.chemedl.org/collections/molecules/） 无机小分子及其特性的集合。 主持于化学教育数字图书馆。 ChemExper化学品目录 一个包含500000多个分子、10000个IR和70000个3D模型的数据库，可以使用Jmol进行可视化。 ChemgaPedia公司 化学及相关科学综合免费电子学习平台 FIZ CHEMIE（化学信息中心），德国柏林。 CDK网站 展示化学开发工具包中的功能案例。 该网站使用Jmol生成渲染3D结构。 牙买加物质化学 -西印度群岛大学，莫纳，JAMAICA，包括； 咖啡、糖和朗姆酒、水果和蔬菜、香料、铝土矿等。 化学模型 访问BWT所有JSmol模型的新网站，例如N2、CO、CO2、BF3、B2H6的MO； 无机环分子； 环己烷转化-英国纽卡斯尔大学 化学信息软件 Ed Cannon，剑桥大学博士生。 该网站使用Jmol来说明开放软件和3D分子可视化。 化学蜘蛛 为化学家建立一个以结构为中心的社区。 近2000万个分子，并使用Jmol显示它们。 化学管3D “交互式3D有机反应机制及反应性和光谱方面的支持信息。英国利物浦大学Nick Greeves著。” CheShift公司 “一个量子力学数据库 13 C类 α 蛋白质结构验证的化学变化。 " CO分子轨道 可点击的MO能级图用于教学，从而生成显示MO表面和/或轮廓的JSmol/Jmol模型。 从NBO分析中讨论NAO——英国纽卡斯尔大学 合作 2 分子轨道 用于教学的可点击MO能级图，导致Jmol/JSmol模型显示价层轨道的表面和/或轮廓-英国纽卡斯尔大学 合作 2 3D相图 在Biomodel。 阿拉伯联合酋长国 构象表位预测服务器 -印度浦那大学生物信息中心。 以Jmol显示预测的表面抗原表位。 网络上的Cocon -基于核磁共振相关数据生成成分，使用Jmol可视化结果。 冷却分子 -美国圣奥拉夫学院。 CoSyM公司 -连续对称测量，以色列开放大学。 Crystal教程项目：使用Jmol的网页上的振动模式 -Y.Noel，意大利都灵大学。 晶体教程项目：纳米管系统 -Y.Noel和R.Demichelis，意大利都灵大学。 环己烷环翻转 点击激活能图进行教学，生成Jmol/JSmol动画模型。 包括twist-boat conformer interconversion-英国纽卡斯尔大学
大理 -蛋白质结构比较和数据库搜索。 使用Jmol查看产生的结构重叠。 分子数据手册 -日本环境化学学习主页 二硼烷分子轨道 根据群论对称表示讨论分子轨道的Jmol/JSmol模型的教学网页-英国纽卡斯尔大学 DNA结构教程 -经典之作 埃里克·马茨 ，通过转换为Jmol/JSmol 安吉尔·埃尔雷斯（Angel Herráez） 。有10种语言可供选择！ 令人争议的西班牙塔姆比。 葡萄牙Também disponível em portuguás。 法国无可争议的奥西。 Auch verfügbar auf Deutsch（德国）。 Disponibil iên limba románîn。 安切·迪波尼比尔（Anche disponibile）在意大利。 Równieżdostępne w j \281]zyku polscrai。 蒂尔库塞·埃维里西·梅夫库图。 进入 中文版. ยังมีอยู่ในไทย. Επίσης διαθέσιμο στα Ελληνικά. Gutow博士的VSEPR教程 -由威斯康星大学奥斯科什分校主办，这是一篇关于确定分子形状的VSEPR（价壳层电子对排斥）模型的教程。 使用Jmol查看的示例分子。 古托博士的原子轨道页面 -该网站由威斯康星大学奥什科什分校主办，使用Jmol允许用户选择和比较原子轨道（1s、2s、2p、3s、3p、4s、3d和4p轨道）。 古托博士的混合原子轨道站点 -该网站由威斯康星大学奥斯科什分校主办，使用Jmol允许用户选择和比较混合原子轨道。 还提供了一般化学水平的解释。 DCU CHIME和Jmol页面 -都柏林城市大学访问者访问分子观察画廊和有机化学教程页面。 荷兰有机化学词典 -荷兰奈梅亨Radboud大学
生态维基 基于Wiki的社区注释 大肠杆菌 其噬菌体、质粒和可移动的遗传元素。 用于可视化具有可用结构的蛋白质的Jmol。 电子数据信息学——用分子解释 这是一个为K-12学生设计的互动网站。 埃杜摩尔 是一个基于JSmol-JSme的分子建模网站。 它的化学和教育功能针对基础和中等水平的化学教育进行了优化。 电子密度图 在JSmol中显示了如何从一西格玛电子密度数据导出等轴网，以及温度（B值）如何与电子密度相关。 电子工厂 是一套3D数据显示模块，用于模型植物的集成系统生物学 拟南芥 Jmol用于呈现带注释的蛋白质结构和蛋白质相互作用网络。 Erowid chem比较3d 对许多精神活性化合物的两个分子进行并排比较。 功能：根据用户偏好动态加载小程序，无需重新加载页面； 两种分子的鼠标控制同步； 使用下拉菜单高亮显示元素。 知识的演变 使用脚本给胰岛素和G3PD等蛋白质中的保守氨基酸着色。 注意：这是一个“智能设计”网站，链接到非同行评审的材料。 关于大分子智能设计和一般生命智能设计的论据非常薄弱，并在许多场合遭到驳斥。 请注意，本网站链接的书中的章节未经合法同行审查。
JSmol简介 是一个基于浏览器的简单分子可视化工具。 按钮显示在线可用的任何高分子的信息视图。 帮助（包括颜色键）会自动显示并始终显示在视图中。 超链接只需点击一次即可显示分子。 它被设计为对新手和专家都有用。 使用次数超过500000次。 中的三维按钮 自然 显示新发布的结构 第一眼 . FlexWeb-首次在线 -美国亚利桑那州立大学； FIRST/FRODA软件用于刚度分析和几何刚度模拟。 需要注册，但非商业用户可免费注册 FXI缺陷突变数据库 -英国伦敦大学学院
Gallixa护肤霜 -Gallixa是一种含有麦芽酸镓的皮肤产品。 在这个交互式Jmol演示中，可以看到麦芽酸镓分子。 甘斯塔+ -GANGSTA+非顺序三维结构对齐工具 GRIS：糖蛋白激素受体信息系统 -GRIS收集并呈现糖蛋白激素受体（GpHRs）的异质数据，如突变数据、同源模型，并允许用户使用多种结构分析工具。 Jmol用于可视化模型。
hBar实验室：计算机辅助化学随需应变 -第一个用于执行分子建模计算（包括在线量子化学计算）的web应用程序。 需要注册。 血红蛋白 -本教程涵盖了α-2、β-2四聚体、血红素、分子氧与血红素的结合、组氨酸的作用、二级结构、两亲性α螺旋、T<-->R过渡形态动画和镰状血红蛋白的聚合 Jmol教程-创作模板 .
IMGT/3D结构-DB ：IMGT®（http:// imgt.cines.fr公司 )是国际ImMunoGeneTics信息系统，是专门研究免疫球蛋白、T细胞受体、主要组织相容性复合体和免疫系统相关蛋白的综合知识资源。 无机晶体结构数据库（ICSD） 是世界上最广泛的全面评估无机晶体结构数据数据库。 它由德国的Fachinformationszentrum FIZ Karlsruhe和美国国家标准与技术研究院NIST制作，Jmol接口由法国劳埃·朗格温研究院开发。 无机环和笼分子 JSmol/Jmol分子结构模型，支持非金属环和笼化学中的合成、结构、对称性和手性的本科课程。 每个结构都有一个“回答和评论”按钮，为无机化学家提供感兴趣的点，并经常讨论点群对称性-英国纽卡斯尔大学 交互式染色质建模 -ICM（我看到了）Web是交互式染色质建模Web服务器，位于 毕肖普理论分子生物学实验室 它允许用户将DNA序列折叠成核小体或染色质阵列。 ISFI-集成结构功能创新网站 建筑画廊中的Jmol观众。 结构与功能创新综合中心（ISFI）是美国国立卫生研究院蛋白质结构倡议专业中心，专注于开发和应用一套协同技术，旨在克服可溶性蛋白质生产和蛋白质结晶关键步骤中公认的结构确定瓶颈。
J-ICE公司 J-ICE是一个基于网络的Jmol接口，用于晶体和电子特性。 J-ICE可以处理CASTEP、CRYSTAL09（以及06、03和98）、GROMOS、QUANTUM ESPRESSO、VASP、Wiennk、FHI aim、CIF、PDB和许多其他格式。 Jena3D查看器（Jena3D） -Jena3D是基于Jmol的基于网络的三维生物聚合物结构交互式查看器。 它可以访问保存在蛋白质数据库（PDB）或核酸数据库（NDB）中的所有结构条目。 此外，还可以查看本地结构文件。 Jena3D不仅可视化PDB文件中包含的信息，还可视化SCOP、CATH和Pfam域、SAP（SNP）、PROSITE基序和映射到蛋白质上的外显子结构。 它与耶拿生物大分子图书馆（JenaLib）密切相关。 耶拿生物大分子图书馆（JenaLib） -蛋白质数据库（PDB）和核酸数据库（NDB）提供的所有3D结构的综合数据库。 来自UniProt、PROSITE和ENSEMBL等其他数据库的信息被映射到蛋白质结构上。 为了可视化，使用了密切相关的基于Jmol的Jena3D查看器。 德国耶拿 JnetPlus公司 -交互式Java查看器，用于以二维或三维图形的形式可视化网络结构。
LANL蛋白质特征强调工具 -洛斯阿拉莫斯国家实验室网站上的HIV数据库团队现在拥有一个工具，可以使用Jmol检查序列特征的结构位置。 可以提交蛋白质序列或比对，并将与选定的HIV蛋白质结构的序列进行比对； 然后可以用鼠标选择比对中的序列特征，相应的残基将在Jmol窗口的蛋白质图形上突出显示。 molécules图书馆 -法国科学中学教师分子模型库 La Chimie par le网络 -化学学生公共课程-缅因大学-法国
