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结晶学报
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结构
生物学
第71卷
|
第12部分
国际标准编号:2059-7983
2015年12月发布
封面插图:
磷脂纳米盘中嵌入的人细胞色素P450(
斯卡尔·格林格
等。
第2412页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
2364-2371年
doi:10.1107/S139900471501799X
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解离的结构观点
大肠杆菌
色氨酸酶
K.绿色
,
N.卡西姆
,
G.格达尔夫斯基
,
A.科根
,
Y.戈德古尔
,
A.H.帕罗拉
,
O.洛坦
和
O.报警
一项以多聚酶色氨酸酶为模型和晶体结构分析的研究表明,蛋白质-蛋白质相互作用的结构观点以及分子水平上的解离机制。
PDB参考
:
色氨酸酶,5d8g
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《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
2372-2385
doi:10.1107/S1399004715018520
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解开光合GAPDH–CP12–PRK复合物的形状和结构组装
拟南芥
通过小角度X射线散射分析
A.德尔·朱迪斯
,
N.V.帕维尔
,
L.加兰提尼
,
G.法利尼
,
P.特罗斯特
,
S.费尔曼尼
和
F.斯巴拉
光合作用GAPDH–CP12–PRK复合物及其单组分的结构和组装过程,
即
PRK和GADPH–CP12复合体,来自
拟南芥
已通过小角度X射线散射进行了研究。
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《水晶学报》。
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71
,
2386-2395
doi:10.1107/S1399004715018519
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发送包装:蛋白质工程产生一种新的晶体形式
铜绿假单胞菌
DsbA1具有更高的催化表面可及性
R.M.麦克马洪
,
M.Coinçon先生
,
S.Tay公司
,
B.赫拉斯
,
C.J.莫顿
,
M.J.斯坎隆
和
J.L.马丁
a的晶体结构
铜绿假单胞菌
DsbA1变体更适合于基于片段的铅发现工作,以识别该抗菌药物靶点的抑制剂。
在所报告的结构中,蛋白质的活性部位可以同时结合结晶溶液中引入的多个配体或
通过
浸泡。
PDB参考
:
E82I PaDsbA1,4zl7型
;
4zl8个
;
4兹罗9
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(2015).
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71
,
2396-2411
doi:10.1107/S1399004715018714
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X射线诱导的多铜氧化酶催化活性位还原:质子中继机制和O的结构见解
2
-还原状态
H.塞拉诺·波萨达
,
S.Centeno-Leija公司
,
S.P.罗哈斯·特雷乔
,
C.罗德里格斯-阿尔马赞
,
V.斯托亚诺夫
和
E.鲁迪尼奥·皮涅拉
12晶体结构
嗜热杆菌
报道了以holo、apo和Hg结合形式以及不同吸收X射线剂量的HB27多铜氧化酶,揭示了X射线诱导O还原中质子中继机制的首次结构证据
2
至2H
2
O位于酶的三核铜簇上。
不同的O
2
-在高于0.2的辐射剂量下T2Cu的还原态和总损耗
还观察到MGy。
PDB参考
:
第T次
-主控振荡器,2xu9
;
阿波罗
第T次
-MCO,2xuw
;
汞-
第T次
-MCO,2个vb
;
汞-
第T次
-MCO-2h、4ai7
;
时间
-MCO-C1,2年
;
第T次
-MCO-C2,2英尺
;
第T次
-MCO-C3,2小时
;
第T次
-MCO-C4,2根
;
时间
-MCO-C5,2姚
;
第T次
-MCO-C6,2年
;
第T次
-MCO-C7,2年
;
第T次
-MCO-C8,2码
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《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
2412-2421
doi:10.1107/S1399004715018702
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磷脂纳米盘环境中人细胞色素P450的形状和定位的小角散射测定
N.斯卡尔·格林格
,
S.A.R.Kynde公司
,
I.G.杰尼索夫
,
X.叶
,
I.列诺夫
,
S.G.拖鞋
和
L.阿尔勒
A组合
从头算
发展了用于小角度散射分析的刚体方法。
这提供了一个以前无法获得的关于人类细胞色素P450 CYP3A4的低分辨率结构的见解,该结构被嵌入模拟天然膜的纳米盘中。
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(2015).
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71
,
2422-2432
doi:10.1107/S1399004715018659
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一种酶以两种构象状态捕获:晶体结构
S公司
-腺苷-
L(左)
-同型半胱氨酸水解酶
埃氏慢生根瘤菌
T.曼谢夫斯基
,
K·辛格
,
B.伊莫尔奇克
和
雅斯科尔斯基
S公司
-腺苷-
L(左)
-一株固氮细菌的同型半胱氨酸水解酶结晶为一种生物相关的同四聚体,由不同构象状态的亚基组成。
其中三个是Ado产品绑定的闭合构造,而第四个是空的和开放的。
PDB参考
:
S公司
-腺苷-
L(左)
-同型半胱氨酸水解酶,与腺苷复合,4lvc
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《水晶学报》。
(2015).
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71
,
2433-2448
doi:10.1107/S1399004715018672
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细胞内GH42β-半乳糖苷酶Gan42B的结构-功能关系
嗜热脂肪地芽孢杆菌
H.V.所罗门
,
O.塔巴奇尼科夫
,
S.兰斯基
,
R.萨拉马
,
H.范伯格
,
Y.肖姆
和
G.肖姆
GH42β-半乳糖苷酶Gan42B的晶体结构
嗜热脂肪杆菌
已确定为野生型(2.45
?分辨率)及其亲核催化突变体(E323A;2.50
分辨率)。
这些结构表明,Gan42B蛋白是一种同源三聚体,其中三个活性位点形成于构成该蛋白的每对单体之间的界面上,均朝向锥形内腔。
PDB参考
:
甘42B-WT,4oif
;
甘42B-E323A,5dfa
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《水晶学报》。
(2015).
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71
,
2449-2456
doi:10.1107/S1399004715018635
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病原菌四聚体Ⅱ型β-碳酸酐酶的晶体结构和动力学研究
霍乱弧菌
M.Ferraroni先生
,
S.Del Prete公司
,
D.Vullo
,
C.卡帕索
和
C.T.晚餐
重组Ⅱ型β-CA的动力学特征和晶体结构
霍乱弧菌
分辨率为1.9
报告了带有关闭的活动站点配置的。
PDB参考
:
β-碳酸酐酶,5cxk
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(2015).
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71
,
2457-2470
doi:10.1107/S1399004715018830
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八聚体结构
金黄色葡萄球菌
烯醇化酶与磷酸烯醇丙酮酸配合物
吴彦祖(Y.Wu)
,
C.王
,
林书豪(S.Lin)
,
吴先生
,
L·韩
,
C.田
,
十、张
和
J.臧
非连接和PEP连接结构
金黄色葡萄球菌
烯醇化酶(
Sa公司
_烯醇化酶)被溶解,发现PEP结合结构中的催化环1同时显示“开放”和“闭合”构象。
结构和生化结果表明,底物结合和催化需要八聚体
Sa公司
_烯醇化酶。
PDB参考
:
Sa公司
_烯醇化酶,5bof
;
与政治公众人物的综合体,5桶油当量
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《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
2471-2478
doi:10.1107/S1399004715019598
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自组装DNA寡核苷酸的序列依赖性结构变化
M.Saoji先生
和
P.J.Paukstelis先生
报道了含有串联G–a碱基对的三级结构模拟物的自组装DNA 14分子的X射线晶体结构。
PDB参考
:
连续氢键14-mer DNA,5bxw
;
5块
;
5亿7
;
5亿9
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《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
2479-2493
doi:10.1107/S1399004715019331
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线粒体3-酮酰基辅酶a(T1)样硫解酶的结构表征
耻垢分枝杆菌
N.贾纳丹
,
R.K.哈里扬
,
T.-R.基马
,
R.K.维伦加
和
M.R.N.Murthy先生
一种T1类硫酶的晶体结构
M.污点
三种apo形式和一种配体形式揭示了不对称四聚体结构和一种新的底物特异性口袋。
PDB参考
:
MSM-13硫酶,4zrc
;
5byv公司
;
5立方厘米
;
CoA络合物,5bz4
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(2015).
D类
71
,
2494-2504
doi:10.1107/S1399004715019392
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天冬氨酸蛋白酶Sappip的原子分辨晶体结构
假丝酵母菌
J.多斯塔尔
,
A.山核桃
,
O.Hrušková-海廷斯费尔多娃
,
L.Marečková
,
I.皮乔娃
,
佩·埃萨科娃
,
M.莱普西克
和
J.布林达
分泌型天冬氨酸蛋白酶Sapp2p的晶体结构
C.近矽肺
原子分辨率为0.825
报道了迄今为止沉积在PDB中的分辨率最高的天冬氨酸蛋白酶结构。
PDB参考
:
Sappip,4y9w
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(2015).
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71
,
2505-2512
doi:10.1107/S1399004715019549
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U32肽酶家族肽酶结构域的第一晶体结构
M.Schacherl先生
,
A.A.M.蒙塔达
,
E.布伦斯坦
和
尤·鲍曼
U32肽酶结构域的第一个晶体结构显示具有扩展的β7–β8连接的TIM桶型结构。
没有可识别的基序适合催化肽键水解。
PDB参考
:
Mk0906,5d88
阅读文章
《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
2513-2518
doi:10.1010/S139900471501603X
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天然和衍生微晶混合物中蛋白质同晶替换数据的连续晶体学分析
T·张
,
D.姚明
,
J.Wang(王)
,
Y.Gu先生
和
H.风扇
串行晶体学能够从多相衍射快照的混合物中提取/纯化单相子集。
阅读文章
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(2015).
D类
71
,
2519-2525
doi:10.1107/S139900471501857X
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用于连续飞秒晶体学的天然硫/氯SAD相位
T.纳卡内
,
C.歌曲
,
铃木先生
,
E.南戈
,
J.小林
,
T.Masuda公司
,
井上春树
,
E.米佐哈塔
,
T.Nakatsu公司
,
田中T.Tanaka
,
R.田中
,
岛村T
,
K.托诺
,
Y.乔蒂
,
T.卡梅希马
,
T.Hatsui公司
,
M.Yabashi先生
,
O.努雷基
,
岩手南部
和
M.Sugahara先生
硫SAD定相有助于利用自由电子激光的飞秒X射线确定不同天然蛋白质的结构
通过
连续飞秒晶体学。
PDB参考
:
溶菌酶,4yop
阅读文章
《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
2526-2542
doi:10.1107/S1399004715019641
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原核生物FMN合成的结构观察
B.埃尔格达斯
,
I.车道
,
塞巴斯蒂安先生
,
J.A.赫莫索
,
M.Martínez-Júlvez先生
和
M.麦地那
FAD合成酶来自
产氨梭菌
(
钙
FADS)是一种双功能酶,可折叠成两个几乎独立的模块。
配体与其单独表达的C末端核黄素激酶(RFK)模块的结合引发重要的结构变化。
他们的评估提供了对RFK催化循环期间发生的构象变化的结构见解
钙
FADS公司。
PDB参考
:
的RFK模块
钙
FADS,与ADP复合,5a88
;
与FMN和ADP复合,5a89
;
5a8a型
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