摘要
炎症性肠病(IBD)是一种肠道慢性炎症性疾病。 遗传关联研究已确定高度可变的人类白细胞抗原(HLA)区域是IBD最易感位点,特别是DRB1*01:03是溃疡性结肠炎(UC)的决定因素。 然而,由于HLA内连锁不平衡的紧密结构,大多数关联信号(如轮廓)无法进行描述。 因此,本研究的目的是使用跨种族方法进一步表征HLA信号。 我们对9272名非裔美国人、东亚人、波多黎各人、印度人和伊朗人后裔的队列人群和40 691名之前分析过的白种人进行了UC中单个HLA等位基因的全面精细定位,并对整个HLA单倍型进行了分析。 我们通过计算表征了相关HLA等位基因与人类自身肽的结合,并分析了HLA蛋白和预测的自身肽体的物理化学性质。 通过突出HLA-DRB1*15组的等位基因及其相关的HLA-DQ-DR单倍型,我们不仅确定了不同种族之间的一致关联(关于影响方向/程度),还确定了人群特异性信号(关于等位基因频率的差异)。 我们观察到DRB1*01:03主要存在于西欧血统的个体中,在非高加索个体中几乎不存在。 我们发现与HLA等位基因结合的肽富含带正电荷的氨基酸。 我们得出结论,HLA在不同种族的UC易感性中起着重要作用。 这项研究进一步揭示了肽的特定特征,这些肽预计会结合风险和保护性HLA蛋白。
©作者2021。 牛津大学出版社出版。 保留所有权利。 有关权限,请发送电子邮件至: journals.permissions@oup.com。
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