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科学代表。2016; 6: 19070.
2016年1月12日在线发布。 数字对象标识:10.1038/srep19070
预防性维修识别码:项目经理4709557
PMID:26754079

RNA干扰阻断TRIM25通过TGF-β信号抑制胃癌细胞的迁移和侵袭

摘要

TRIM25是TRIM蛋白的一个成员,在女性生殖系统癌症中异常表达。在这里,TRIM25在人类胃癌(GC)组织中显著表达,其高表达通常与患者预后不良相关。小干扰RNA(siRNA)介导的MGC-803和AGS细胞TRIM25表达的下调对细胞增殖没有影响,但减少了细胞迁移和侵袭。对癌症基因组图谱胃腺癌(STAD)数据集的基因集富集分析显示,在TRIM25高表达患者中富集了几种信号通路,包括迁移、E-钙粘蛋白和转化生长因子-β(TGF-β)通路。此外,TRIM25在低表达的GC细胞系中的异位表达显著促进了迁移和侵袭。进一步的TGF-β抑制剂实验表明,TRIM25可能通过TGF-α途径发挥其功能。总之,我们的结果表明TRIM25在GC中作为癌基因发挥作用,从而为GC的检测和治疗提供了一个新的靶点。

在全球范围内,胃癌是第四大最常见的恶性疾病,也是癌症死亡的主要原因1在远处转移已经发生后,在晚期诊断为GC。尽管近年来GC在手术、化疗和放疗方面取得了显著进展,但GC仍然是一个严重的健康问题,五年生存率仅为20%2因此,迫切需要深入了解胃癌发生的分子机制,并确定GC的新治疗靶点。

含有25的三分基序(TRIM25,也称为雌激素反应指蛋白(EFP))是TRIM蛋白的成员。TRIM25包含一个环形结构域、两个B盒结构域和一个线圈结构域,并作为E3泛素连接酶发挥作用在TRIM25基因的3′-非翻译区(UTR)发现了一种雌激素反应元件(ERE),其表达是由雌激素诱导的4近年来,发现TRIM25在女性生殖系统癌症中异常表达。据报道,TRIM25在乳腺癌中过度表达5,6和卵巢癌7在子宫内膜癌中,TRIM25表达下调8.TRIM25被认为以14-3-3σ(一种细胞周期调节因子)为靶点,用于蛋白质水解并促进乳腺癌生长5,9.TRIM蛋白的其他成员,包括TRIM2810,阀内件2911和TRIM3112,13已报告在GC中上调。然而,关于TRIM25在GC中的表达和功能知之甚少。

在目前的研究中,我们发现TRIM25 mRNA在GC组织中的表达水平高于正常组织。TRIM25的高丰度与GC患者的总体生存率低密切相关。我们还发现,TRIM25的敲除对GC细胞的增殖没有影响,但抑制了GC细胞的迁移和侵袭。还探讨了相关的可能机制。综上所述,这些结果表明TRIM25可以调节胃癌的发生,并可能成为抗肿瘤治疗的潜在靶点。

结果

TRIM25在GC组织中经常上调

鉴于TRIM蛋白的几个成员在GC中上调,我们重新分析了从癌症基因组图谱网站(TCGA)胃腺癌(STAD)数据集下载的RNA-seq数据,发现GC组织中的TRIM25水平高于正常组织对照组(P<0.0001)(图1A). 然后,我们通过qRT-PCR分析评估了90对GC组织和非肿瘤组织中TRIM25的mRNA水平。使用∆Ct法计算TRIM25 mRNA与GAPDH的相对水平。如所示图1B与正常组织对照组相比,GC组织中TRIM25的水平显著增加(P(P) < 0.0001).

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TRIM25在GC中过度表达。

(A类)基因表达数据RNA-Seq分析GC组织(n=32)和正常组织(n=250)中TRIM25 mRNA的表达。RNA-Seq分析使用了从TCGA下载的数据(P(P) < 0.0001). (B类)用qRT-PCR检测90对GC和正常组织中TRIM25的mRNA水平。与非肿瘤组织相比,胃癌组织中TRIM25 mRNA显著过度表达(P(P) < 0.0001). (C类)总体生存分析表明,TRIM25低表达肿瘤的预后优于TRIM25高表达肿瘤(P(P) < 0.05)。(D类)使用qRT-PCR方法(左面板)和免疫印迹法(中面板和右面板)检查6个人类GC细胞系中TRIM25的表达水平。显示了代表性的免疫印迹(中间面板)和定量结果(右侧面板)(*P(P) < 0.05, **P(P) < 0.01, ***P(P) < 0.001).

此外,将TRIM25 mRNA相对水平的中位数(0.759)设为截止值,将90例患者分为低表达组和高表达组。为了研究TRIM25低或高表达的GC亚型的临床结果,进行了Kaplan-Meier生存分析。如所示图1C,TRIM25-低表达患者的生存时间显著长于TRIM25高表达患者(P(P) < 0.05). 这些结果表明,TRIM25在胃癌组织中的表达上调,这与胃癌患者的总生存率低密切相关。

GC细胞中TRIM25的敲除

调查TRIM25功能在体外,我们检测了6个GC细胞系中TRIM25的表达。如所示图1D选择TRIM25在mRNA和蛋白水平均较高表达的MGC-803和AGS,研究TRIM25的功能。将两个特异于TRIM25的siRNA(siTRIM25-1和siTRIM256-2)和一个阴性对照siRNA(siNC)转染到MGC-803和AGS细胞中,随后通过免疫印迹和qRT-PCR分析测定TRIM25水平。如所示图2A、B,这两种siRNAs均有效抑制TRIM25的表达,并选择效率更高的siTRIM25-1进行进一步检测。

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在GC细胞中,通过siRNA转染抑制TRIM25的表达。

TRIM25在MGC-803中的表达(A类)和AGS细胞(B类)通过qRT-PCR(左面板)和免疫印迹(中面板和右面板)进行分析。WT:野生型细胞;siNC:干扰siRNA-转染细胞;siTRIM25-1、siTRIM256-2:TRIM25-siRNA-1或TRIM25-siRNA-2转染细胞(*P(P) < 0.05, **P(P) < 0.01).

TRIM25 siRNA对GC细胞增殖的影响

然后通过CCK-8分析评估细胞增殖。有趣的是,转染siTRIM25-1的细胞与转染siNC的细胞和野生型对照(WT)细胞具有相似的增殖率(图3A,P(P) < 0.05),表明TRIM25对GC细胞增殖无影响。

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TRIM25表达减少抑制GC细胞的迁移和侵袭。

(A类)CCK-8法检测MGC-803和AGS细胞增殖。(B类)用无三角包被的transwell室检测经TRIM25 siRNA-1或对照siRNA处理的MGC-803和AGS细胞的迁移。(C类)用基质包被的跨阱室评估TRIM25 siRNA-1或对照siRNA处理的MGC-803和AGS细胞的侵袭能力。比例尺:100μm。WT:野生型细胞;siNC:干扰siRNA-转染细胞;siTRIM25-1:TRIM25-siRNA-1转染细胞(***P(P) < 0.01)。

TRIM25 siRNA对胃癌细胞转移的影响

为了确定TRIM25-siRNA是否能够影响肿瘤细胞转移,通过跨阱分析在MGC-803和转染siTRIM25-1或siNC的AGS细胞中测定细胞迁移和侵袭能力。与对照组(WT和siNC)相比,转染TRIM25 siRNA后MGC-803和AGS细胞的迁移分别减少了47.0%和39.0%(图3B). 类似地,TRIM25 siRNA转染的细胞在MGC-803和AGS细胞中均表现出抑制侵袭性。侵袭性分别下降了61.7%和37.3%(图3C).

GC中TRIM25相关通路的研究

为了鉴定GC中的TRIM25相关途径,利用TCGA STAD数据集的数据进行了基因集富集分析(GESA)。如所示图4A迁移、E-cadherin和TGF-β信号通路与TRIM25表达密切相关。

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TRIM25表达影响迁移、E-cadherin和TGF-β信号通路。

(A类)使用TCGA数据集执行GSEA。TRIM25的高表达与迁移、E-cadherin和TGF-β信号通路密切相关。(B、 C类)用TRIM25 siRNA-1或对照siRNA转染MGC-803和AGS细胞48 h后,通过免疫印迹法检测上述三种通路相关基因的表达(D、 E类)转染后6 h通过免疫印迹法评估Smad2和Smad4的磷酸化。WT:野生型细胞;siNC:干扰siRNA-转染细胞;siTRIM25-1:TRIM25-siRNA-1转染细胞(*P(P) < 0.05, **P(P) < 0.01, ***P(P) < 0.001).

然后,我们分析了在转染siTRIM25或siRNA对照后48小时,MGC-803和AGS细胞中迁移(基质金属蛋白酶[MMMP]-2和MMP-9)、E-钙粘蛋白(E-钙粘蛋白、β-catenin和纤连蛋白1[FN1])和TGF-β信号传导(TGF-β1和骨形态发生蛋白[BBM]-4)途径相关蛋白的表达。如所示图4B、CTRIM25 siRNA处理导致MMP-2、MMP-9、β-catenin、FN1、TGF-β1和BMP-4的表达显著降低,E-cadherin的表达显著增加。这些结果进一步验证了GSEA数据。

TRIM25对TGF-β信号的调节

考虑到TRIM25 siRNA对TGF-β1表达的抑制作用,我们认为它可以抑制TGF-α信号传导。因此,我们在转染后6小时通过免疫印迹检测TGF-β1下游Smad2和Smad4的磷酸化。如所示图4D,E在GC细胞中转染TRIM25 siRNA显著抑制Smad2和Smad4的磷酸化。

为了进一步证实TGF-β信号传导的参与,TRIM25表达较低的MKN-28细胞用TRIM25过度表达,并用TGF-α抑制剂(SB-431542,图5). TRIM25的异位表达显著促进了GC细胞的迁移和侵袭,而TGF-β抑制剂则显著抑制了GC细胞迁移和侵袭。此外,SB-431542对GC细胞迁移和侵袭的抑制作用因TRIM25的异位表达而受损。免疫印迹法检测MMP-2和MMP-9的表达以及Smad2和Smad4的磷酸化(图6). SB-431542显著抑制MMP-2、MMP-9、p-Smad2和p-Smad4的水平,这种作用被TRIM25过度表达减弱。这些数据表明,TRIM25可能通过激活TGF-β途径部分促进细胞迁移和侵袭。

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TRIM25的异位表达逆转了TGF-β抑制剂对MKN-28细胞迁移和侵袭的影响。

(A类)用控制质粒(NC)或编码TRIM25的表达质粒转染MKN-28细胞。转染48 h后,通过qRT-PCR和免疫印迹分析TRIM25的表达。(B、 C类)用TRIM25或NC转染MKN-28细胞,并在含有DMSO或10μM TGF-β抑制剂SB431542(Sigma)的转染室中进行迁移和侵袭试验。比例尺:100μm。

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TRIM25的异位表达逆转了TGF-β抑制剂对TGF-α信号传导的影响。

(A类)免疫印迹法检测MMP-2和MMP-9的表达。(B类)通过免疫印迹法测定Smad2和Smad4的磷酸化(*P(P) < 0.05, **P(P) < 0.01, ***P(P) < 0.001).

讨论

尽管TRIM蛋白最近在不同类型的恶性肿瘤中进行了研究和TRIM蛋白的其他成员10,11,12,13已经发现TRIM25在GC中过度表达,但对TRIM25的异常表达和可能在GC中的作用仍缺乏了解。在这里,我们发现与正常对照相比,TRIM25在GC组织中的表达显著增加,这与TCGA STAD数据集的分析一致。此外,胃癌组织中TRIM25的上调可能与胃癌的预后有关,提示TRIM25在胃癌组织中可能具有临床价值(图1).

先前的研究表明,TRIM25的敲除抑制肺癌细胞的生长14和乳腺癌细胞9然而,我们的数据表明,TRIM25的表达减少对GC细胞的增殖没有影响(图3A). TRIM25敲除后的这些不同结果可能是由于不同类型的转染细胞所致。与之前肺癌的发现一致14,我们还发现TRIM25也能显著抑制GC细胞的迁移(图3B). 此外,我们发现敲除GC细胞中的TRIM25可以显著降低细胞侵袭能力(图3C). 相反,TRIM25在低表达的GC细胞系中的异位表达可显著诱导细胞迁移和侵袭(图5B、C). 因此,我们的数据表明,TRIM25在GC的发展中可能很重要。

虽然控制TRIM25功能的分子机制尚不完全清楚,但基于TCGA STAD数据集的GSEA分析发现,包括迁移、E-cadherin和TGF-β通路在内的几个癌症相关网络与TRIM25表达呈正相关(图4A). 有力的证据表明,细胞迁移和侵袭对癌症的发生、发展和转移至关重要15上皮间质转化(EMT)被认为是原发性肿瘤向转移进展的关键步骤16,17E-钙粘蛋白被认为是EMT的主要因子,从而导致大多数上皮性肿瘤的恶性进展16,17TGF-β信号通路不仅是上皮细胞增殖的重要抑制因子,也是EMT的关键调节因子18其他TRIM蛋白已被证明调节TGF-β信号19,20在本研究中,TRIM25 siRNA处理影响了迁移(MMP-2和MMP-9)、E-钙粘蛋白(E-cadherin、β-catenin和FN1)和TGF-β信号通路相关蛋白(TGF-?和BMP-4、p-Smad2和p-Smad4)的表达(图4B、C). 此外,TGF-β抑制剂SB431542对GC细胞迁移和侵袭的抑制作用因TRIM25过度表达而受损(图5)提示TRIM25可能通过激活TGF-β途径部分促进细胞迁移和侵袭。我们的数据表明,上调TRIM25的表达将增强EMT,从而促进GC和侵袭性的发展。有必要进行进一步研究以探索这些可能性。

总之,TRIM25在GC中过度表达,TRIM35的异常表达可能通过调节TGF-β信号通路和其他关键靶基因影响GC细胞的迁移和侵袭。因此,抑制TRIM25可能是GC潜在的治疗策略。

材料和方法

组织标本和细胞系

收集2007年2月至2009年6月在中国上海浦东新区人民医院普外科手术的患者的GC组织和匹配的非肿瘤组织。匹配的非肿瘤组织取自距离肿瘤组织边缘至少5cm的位置。总生存率(OS)定义为手术日期和死亡日期之间的间隔。研究中使用的方案符合浦东新区人民医院独立伦理委员会批准的指南。获得所有患者的书面知情同意书。

GC细胞系MKN-45、MGC-803、BGC-823、MKN-28、AGS和SGC-7901细胞均来自中国科学院细胞库(中国上海)。细胞保存在Dulbecco改良的Eagle's培养基中(DMEM,美国纽约州格兰德岛生命科技公司),补充10%胎牛血清(HyClone,Logan,UT,USA),100 mg/ml青霉素G和50μG/ml链霉素,37°C,5%CO2.

小干扰RNA(siRNAs)、质粒和细胞转染

靶向TRIM25(siTRIM25-1,5′-GGGAUGAGUUCGAGUUUCUUUU-3′;siTRIM256-2,5′-GGCUCAACACUUGAUAUAU-3′)和干扰siRNA(siNC)的siRNA购自Genepharm Technologies(中国上海)。Genewiz公司(中国上海)将人TRIM25 CDNA克隆到pcDNA3表达载体(Invitrogen,Carlsbad,CA,USA)中。pcDNA3表达载体作为阴性对照(NC)。根据制造商的方案,通过使用Lipofectamine 2000(Invitrogen)进行所有转染。

RNA提取、cDNA合成和实时定量PCR

使用TRizol试剂(Invitrogen)从组织样本或细胞中分离出总RNA,并根据制造商的协议(美国马里兰州汉诺威Fermentas)将其反向转录到cDNA。定量实时PCR(qRT-PCR)是使用ABI 7300实时PCR机器(加利福尼亚州福斯特市应用生物系统公司)和SYBR Green PCR试剂盒(美国伊利诺伊州罗克福德赛默飞世尔科学公司)进行的。用2-(ΔCt)方法计算基因(TRIM25和GAPDH)的相对表达。此处列出了使用的引物(TRIM25正向,5′-GTCTCACCAGAAACAGTTCC-3′;TRIM25反向,5′-ATCAACAGCTGATTCC-3’;GAPDH-forward,5′-CACACTCTCCACCTTG-3′;GAPDH反向,5’-CACACCCTGCTGTGTGTAG-3′)。

免疫印迹和抗体

用新鲜添加的蛋白酶抑制剂(Sigma-Aldrich,St Louis,MO,USA)在冰镇RIPA裂解缓冲液(1%NP40,0.5%Na-deoxycolic acid和PBS中0.1%SDS)中裂解细胞。用SDS-PAGE分离含有等量蛋白质的全细胞裂解物,并转移到聚偏二氟乙烯膜上(Millipore,Bredford,MA,USA)。用5%脱脂牛奶封闭膜,然后在4°C下与一级抗体孵育过夜。根据制造商的说明,使用适当的二级抗体在室温下观察膜1小时,然后使用增强化学发光(ECL)系统(皮尔斯,罗克福德,伊利诺伊州,美国)。免疫印迹信号的强度通过Image J软件(美国国立卫生研究院)的密度计进行定量。所有实验至少重复三次。主要抗体来源如下:TRIM25、转化生长因子(TGF)-β1、骨形态发生蛋白(BMP)-4、纤维连接蛋白1(FN1)、基质金属蛋白酶(MMP)-2和MMP-9,Abcam(美国马萨诸塞州剑桥);E-cadherin、β-catenin、p-Smad2、p-Smad4、Smad2,Smad4和GAPDH,细胞信号技术(丹弗斯,马萨诸塞州,美国)。辣根过氧化物酶结合二级抗体购自Beyotime(中国上海)。

细胞生长分析

将MGC-803和AGS细胞置于6孔板中,培养24 h,然后转染siNC或siTRIM25-1。48小时后,将细胞接种到96个平板上,并使用CCK-8(日本熊本Dojindo实验室)在0、24、48和72小时测定细胞增殖。在指定的时间点,细胞在37°C的正常培养基中的CCK-8溶液中培养1小时。用设置为450 nM的微孔板读卡器测量每个孔的吸光度。所有实验均一式三份。

迁移和侵袭试验

将siNC、siTRIM25-1、TRIM25表达质粒或对照质粒(NC)转染12孔板上的MGC-803和AGS细胞。迁移试验,转染后48小时,1×105将无血清培养基中的细胞添加到transwell插入物的上腔(8m孔径;康宁Costar,美国纽约州纽约市)。为了进行入侵检测,使用Matrigel涂层膜将细胞添加到上腔(BD Bioscience,Franklin Lakes,NJ,USA)。对于转染TRIM25表达质粒或NC的细胞,如图所示,向上腔添加DMSO或10μM TGF-β抑制剂SB431542(Sigma-Aldrich)。将含有20%FBS的培养基添加到下室。24小时后,没有通过毛孔迁移或侵入的细胞被棉签完全清除。迁移或侵入的细胞用4%多聚甲醛固定,用0.2%结晶紫染色,显微镜下计数。

生物信息学分析

基因表达数据在癌症基因组图谱网站(TCGA,https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/)用于胃腺癌(STAD)项目。为了通过TRIM25探索GC发病的生物途径,如前所述进行了基因集富集分析(GSEA)21.

统计分析

三个独立实验的数据表示为平均值±标准偏差(SD)。双尾学生的t吨-测试用于计算P(P)值,以及P(P) < 0.05被认为具有统计学意义。使用GraphPad Prism(美国加利福尼亚州圣地亚哥)进行统计分析。

其他信息

如何引用这篇文章:Z.Zhenya。等。RNA干扰阻断TRIM25通过TGF-β信号抑制胃癌细胞的迁移和侵袭。科学。代表。 6, 19070; doi:10.1038/srep19070(2016)。

致谢

本研究得到上海市卫生和计划生育委员会科研项目(20124321)的资助。

脚注

作者贡献B.Y.、Y.W.和Z.Y.Z.设计了研究;B.Y.、Y.W.、K.H.、S.Y.Y.和Q.Z.进行了研究;Z.Y.Z.、C.H.Z.和K.H.分析数据;B.Y.和Y.W.写了手稿;所有作者都审阅了手稿。

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