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太平洋航空公司增殖细胞核抗原[小家鼠(家鼠)]

基因ID:18538,更新日期2024年9月18日

总结

官方符号
太平洋航空公司由提供MGI公司
官方全名
增殖细胞核抗原由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:97503
参见相关内容
乐团:ENSMUSG00000027342 联盟基因组:MGI:97503
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
临时的
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;Murinae公司;穆斯;穆斯
总结
启用酶结合活性。通过半保守复制和复制叉处理参与有丝分裂端粒维护。作用于基底切口修复、间隙填充的上游或内部;细胞对外来刺激的反应;RNA聚合酶II对转录的负调控。位于核膜和复制叉。细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶全酶复合物的一部分。以多种结构表达,包括消化系统;脑;前肢;心脏;和感觉器官。该基因的人类直系同源物与胃癌有关。与人类PCNA(增殖细胞核抗原)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在肝脏E14.5(RPKM 270.8)、肝脏E14(RPKM268.7)和26个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

位置:
2层;2 64.15立方厘米
外显子计数:
6
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 2 NC_000068.8(132091206..132095100,补遗)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 2 NC_000068.7(132249286..132253180,补遗)

2号染色体-NC_000068.8描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene predicted gene 14051 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_05736 Neighboring gene predicted gene, 29720 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10149 Neighboring gene transmembrane protein 230 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr2:132079079-132079188 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E331 Neighboring gene expressed sequence AV099323 Neighboring gene predicted gene, 46766 Neighboring gene CDP-diacylglycerol synthase 2

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能中的基因参考

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
支持DNA聚合酶结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
支持DNA聚合酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
激活DNA聚合酶加工因子活性 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
激活DNA聚合酶加工因子活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
启用MutLalpha复杂绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
启用MutLalpha复杂绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用染色质结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用染色质结合 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
使受损的DNA结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使受损的DNA结合 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
启用二核苷酸插入或删除绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
启用二核苷酸插入或删除绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
使酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使组蛋白乙酰转移酶结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
使组蛋白乙酰转移酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
实现相同的蛋白质结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
实现相同的蛋白质结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使核雌激素受体结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
使核雌激素受体结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
实现含蛋白复合物结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
实现嘌呤特异性错配碱基对DNA N-糖苷酶活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
实现嘌呤特异性错配碱基对DNA N-糖苷酶活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使受体酪氨酸激酶结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
使受体酪氨酸激酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用转录因子结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
过程 证据代码 酒吧
acts_upstream_of_or_withinbase切除修复,间隙填充 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞对紫外线的反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞对紫外线的反应 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与细胞对过氧化氢的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
acts上游of或细胞内对外源刺激的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与上皮细胞分化 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与发情周期 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与心脏发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
牵涉到主股伸长率 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与肝再生 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
involved_in不匹配修复 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
involved_in不匹配修复 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
involved_in不匹配修复 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
通过半保守复制参与有丝分裂端粒的维持 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
acts_upstream_of_or内RNA聚合酶II对转录的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与DNA修复的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与DNA修复的正调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与DNA复制的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与DNA复制的正调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与DNA-定向DNA聚合酶活性的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与DNA-定向DNA聚合酶活性的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与脱氧核糖核酸酶活性的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与脱氧核糖核酸酶活性的正调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
involved_in复制分叉处理 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与L-谷氨酸反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
与镉离子反应有关 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与地塞米松反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
与雌二醇反应有关 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与脂质反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与经病变合成 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与经病变合成 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与经病变合成 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
组件 证据代码 酒吧
PCNA复合体的一部分 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
PCNA复合体的一部分 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
PCNA复合体的一部分 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
PCNA-p21复合体的一部分 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
PCNA-p21复合体的一部分 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
位于中心体 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
公共医学 
染色质定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
染色质定位 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
细胞周期素依赖性蛋白激酶全酶复合物的一部分 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
定位于细胞内解剖结构 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于雄性生殖细胞核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于核体 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
定位于核体 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于核膜内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
located_in核复制分叉 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
located_in核复制分叉 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
核质定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于核内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于核内 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
公共医学 
located_in复制分叉 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
located_in复制分叉 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
公共医学 

一般蛋白质信息

首选名称
增殖细胞核抗原
姓名
细胞周期蛋白

NCBI参考序列(参考序列)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. 纳米_011045.2NP_035175.1型增殖细胞核抗原

    参见NP_035175.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:暂定

    源序列
    AL807793型
    共识CDS
    CCDS16771.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第17918页
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q542J9号,Q91ZH2型
    相关的
    ENSMUSP00000028817.7号,ENSMUST00000028817.7
    保守领域(2)总结
    cd00577
    位置:4256
    PCNA;真核生物和古生菌中发现的增殖细胞核抗原(PCNA)结构域。这些聚合酶加工因子在DNA复制和修复中发挥作用。PCNA围绕其中央腔中的双链DNA,为。。。
    钨极氩弧焊00590
    位置:1259
    pcna;增殖细胞核抗原(pcna)

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000068.8参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    132091206..132095100补充
    下载
    GenBank(基因银行),法斯塔,序列查看器(图形)