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PCNA公司增殖细胞核抗原[智人（人类）]

基因ID:5111，更新于2024年4月11日

总结

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官方符号
PCNA公司由提供HGNC公司
官方全名
增殖细胞核抗原由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:8729
请参阅相关
乐团：ENSG00000132646 MIM:176740； 联盟基因组：HGNC:8729
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
也称为
ATLD2型
总结
该基因编码的蛋白质位于细胞核中，是DNA聚合酶δ的辅因子。编码的蛋白质起着同源三聚体的作用，有助于提高DNA复制过程中主链合成的过程性。作为对DNA损伤的反应，该蛋白是泛素化的，参与RAD6依赖的DNA修复途径。对于该基因，已经发现了编码相同蛋白质的两种转录物变体。该基因的假基因已在4号染色体和X染色体上被描述。[由RefSeq提供，2008年7月]
表达式
在骨髓（RPKM 118.4）、淋巴结（RPKM 72.7）和24个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
鼠标 全部的
新款
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基因组背景

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位置：
20页12.3
外显子计数：
7
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 20 NC_000020.11（5114953..5126622，补码）
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 20 NC_060944.1（5154376..5166040，补码）
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 20 NC_000020.10（5095599..5107268，补遗）

染色体20-NC_000020.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr20:5008813-5009342 Neighboring gene ribosomal protein S21 pseudogene 7 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr20:5013735-5013892 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr20:5025885-5026104 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17505 Neighboring gene P300/CBP strongly-dependent group 1 enhancer GRCh37_chr20:5041439-5042638 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5046523-5047023 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5053633-5054152 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5054153-5054671 Neighboring gene transmembrane protein 230 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17506 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17507 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5062418-5062918 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17508 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17509 Neighboring gene RNA, 5S ribosomal pseudogene 474 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17510 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5099178-5100058 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5100059-5100939 Neighboring gene small nucleolar RNA SNORA26 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr20:5107325-5107826 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17514 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5113215-5113716 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5113717-5114216 Neighboring gene PCNA antisense RNA 1 Neighboring gene CDP-diacylglycerol synthase 2 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:5150939-5151438 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17515 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 2649 Neighboring gene NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr20:5156307-5156942 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12655 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17516 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17517 Neighboring gene meiotic recombination hotspot R Neighboring gene OCT4 hESC enhancer GRCh37_chr20:5246300-5246801 Neighboring gene ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 pseudogene 1

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
  • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目：项目编号：4337
  • 出版物：项目管理标识号24309898
  • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 一个热敏PCNA等位基因是共济失调-扩张样疾病的基础。 马格里诺·J，等生物化学杂志，2023年5月。PMID 36990216，免费PMC文章
  2. PCNA通过支架代谢酶调节初级代谢。 勒斯特LM，等.癌基因，2023年2月，PMID 36564470，免费PMC文章
  3. PCNA翻译后修饰在控制DNA合成和DNA损伤耐受中的作用——在致癌中的意义。 张S，等《国际生物科学杂志》，2021年。PMID 34671219，免费PMC文章
  4. 解锁PIP-box：肽库揭示了驱动与人类PCNA高亲和力结合的相互作用。 霍斯福尔AJ，等生物化学杂志，2021年1月-6月，PMID 33984330，免费PMC文章
  5. PCNA，专注于复制应激和端粒路径的选择性延长。 沈敏，等DNA修复（Amst），2021年4月PMID 33581499

参见PubMed中的所有（916）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. Spd1激活检查点：一个基于竞争的系统，依赖串联无序PCNA结合基序。
    标题：Spd1的检查点激活：基于竞争的系统，依赖串联无序PCNA结合基序。
  2. 角鲨烯单加氧酶通过调节PCNA促进膀胱癌的发展。
    标题：角鲨烯单加氧酶通过调节PCNA促进膀胱癌的发展。
  3. G-CSF重塑细胞溶质PCNA支架并调节中性粒细胞的糖酵解。
    标题：G-CSF重塑细胞溶质PCNA支架并调节中性粒细胞的糖酵解。
  4. FANCD2依赖性有丝分裂DNA合成依赖于PCNA K164泛素化。
    标题：FANCD2依赖性有丝分裂DNA合成依赖于PCNA K164泛素化。
  5. 短距离末端切除需要ATAD5介导的PCNA卸载以实现可靠的同源重组。
    标题：短距离末端切除需要ATAD5介导的PCNA卸载以实现真正的同源重组。
  6. 泛素特异性肽酶37和PCNA相互作用通过调节复制叉进展促进骨肉瘤发病。
    标题：泛素特异性肽酶37和PCNA相互作用通过调节复制叉进展促进骨肉瘤发病。
  7. 一个热敏PCNA等位基因是共济失调-扩张样疾病的基础。
    标题：一个热敏PCNA等位基因是共济失调-扩张样疾病的基础。
  8. FBH1的PCNA结合模式的分子见解。
    标题：FBH1的PCNA结合模式的分子见解。
  9. HNF4G通过促进IGF2BP2转录刺激胰腺癌的发展。
    标题：HNF4G通过促进IGF2BP2转录刺激胰腺癌的发展。
  10. DNA连接酶Ⅰ缺陷细胞复制过程中PCNA和DNMT1动力学不变，但非复制组蛋白H1染色质水平异常。
    标题：DNA连接酶Ⅰ缺陷细胞复制过程中PCNA和DNMT1动力学不变，但非复制组蛋白H1染色质水平异常。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（400）

表型

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在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

相关条件

描述 测验
共济失调-毛细血管扩张样疾病2
MedGen公司：C4014676号 OMIM公司：615919 基因审查：无法使用的
比较实验室

变更

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参见ClinVar中的变量

参见dbVar中的研究和变体

参见变体查看器（GRCh37.p13）

参见变体查看器（GRCh38）

基因型

HIV-1相互作用

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蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
Tat公司 塔特 HIV-1 Tat上调Jurkat细胞增殖细胞核抗原（PCNA）的表达 公共医学
塔特 当HIV-1 Tat在星形胶质细胞、神经元和非胶质细胞293T中表达时，它与许多细胞周期相关蛋白相互作用，包括细胞周期蛋白a、细胞周期蛋白B、细胞周期素D3、Cdk2、Cdk 4、Cdk1/Cdc2、cdc6、p27、p53、p63、hdlg和PCNA 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

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互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • MGC8367公司

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
支持DNA聚合酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
激活DNA聚合酶加工因子活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
启用MutLalpha复杂绑定 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
启用染色质结合 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
使受损的DNA结合 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
启用二核苷酸插入或删除绑定 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
使酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
使组蛋白乙酰转移酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
实现相同的蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
使核雌激素受体结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
实现含蛋白复合物结合 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
实现嘌呤特异性错配碱基对DNA N-糖苷酶活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
使受体酪氨酸激酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
过程 证据代码 酒吧
涉及基底切口修复、间隙填充 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与细胞对紫外线的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与细胞对过氧化氢的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与细胞对外来刺激的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与上皮细胞分化 IEP公司
从表达式模式推断
更多信息
 公共医学 
参与发情周期 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与心脏发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
牵涉到主股伸长率 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与肝再生 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
involved_in不匹配修复 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
involved_in不匹配修复 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
通过半保守复制参与有丝分裂端粒的维持 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 公共医学 
参与RNA聚合酶II对转录的负调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与DNA修复的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与DNA复制的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与DNA-定向DNA聚合酶活性的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与脱氧核糖核酸酶活性的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与复制分叉处理 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 公共医学 
参与L-谷氨酸反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
与镉离子反应有关 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与地塞米松反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
与雌二醇反应有关 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
涉及跨损伤合成 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
涉及跨损伤合成 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
组件 证据代码 酒吧
PCNA复合体的一部分 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
PCNA复合体的一部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
PCNA复合体的一部分 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
PCNA-p21复合体的一部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于中心体 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
部分染色质 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于染色体端粒区 HDA公司 公共医学 
细胞周期素依赖性蛋白激酶全酶复合物的一部分 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位于胞外外体 HDA公司 公共医学 
位于雄性生殖细胞核内 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位于核体 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
位于核膜内 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
located_in核复制分叉 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于核质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
位于核质中 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
位于核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
located_in复制分叉 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
复制体的一部分 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 公共医学 

一般蛋白质信息

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首选名称
增殖细胞核抗原
姓名
DNA聚合酶δ辅助蛋白
细胞周期蛋白

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_047066.1参考序列基因

    范围
    11665..16670
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. NM_002592.2号→NP_002583.1号增殖细胞核抗原

    参见NP_002583.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    描述
    转录物变体：此变体（1）代表较长的转录物。变体1和2编码相同的蛋白质。
    源序列
    BC000491、BU626265、CB990423
    共识CDS
    CCDS13087.1中
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2R897型,D3DW02型,2004年第1页
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q6FI35型
    相关的
    ENSP0000368458.3号,ENST00000379160.3号机组
    保守领域（1）总结
    钨极氩弧焊00590
    位置：1→259
    pcna；增殖细胞核抗原（pcna）

  2. NM_182649.2→NP_872590.1号增殖细胞核抗原

    参见NP_872590.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    描述
    成绩单变体：与变体1相比，该变体（2）在5'UTR上有所不同。变体1和2编码相同的蛋白质。
    源序列
    AK313286、BC000491、BU626265
    共识CDS
    CCDS13087.1中
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2R897型,D3DW02型,2004年第1页
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q6FI35型
    相关的
    ENSP0000368438.5号,ENST00000379143.10号
    保守领域（1）总结
    钨极氩弧焊00590
    位置：1→259
    pcna；增殖细胞核抗原（pcna）

注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000020.11参考GRCh38.p14主要组件

    范围
    5114953.5126622补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

备用T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060944.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    5154376..5166040补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
核苷酸 蛋白质
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
第1204.1页 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:P12004

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

化学信息
分子生物学数据库
研究材料
工具
其他