5ZVJ型

结核分枝杆菌HtrA1的晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.70 Å
  • R值自由:0.250 
  • R值工作:0.195 
  • 观察到的R值:0.198 

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文学类

结核分枝杆菌必需的高温需求蛋白HtrA1(Rv1223)的晶体结构揭示了其独特的特征。

K.H.辛格。雅达夫,S。D.库马尔。英国比斯瓦尔。

(2018)Acta Crystallogr D Struct Biol公司74: 906-921

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S205979831800952X
  • 相关结构的主要引文:
    5ZVJ型

  • PubMed摘要:

    高温需要A(HtrA)蛋白是热休克诱导丝氨酸蛋白酶家族的成员,参与胞质外蛋白的质量控制和细菌在应激条件下的生存策略,并与几种病原体的毒力有关;因此,它们是主要的药物靶点。结核分枝杆菌具有三种假定的HtrAs:HtrA1(Rv1223)、HtrA2(Rv0983)和HtrA3(Rv0125)。每个都有一个细胞质区、一个跨膜螺旋和一个周质区。这里,结核分枝杆菌HtrA1突变株(mHtrA1)周质区的晶体结构由蛋白酶域(PD)和PDZ域组成S387A型)报告分辨率为2.7º。尽管mHtrA1S387A型PD显示出与其他HtrAs相似的结构特征,其环路,尤其是L3和LA,显示出不同的构象。环L3在三聚体的PD和PDZ结构域之间进行通信,并经历从活性构象到非活性构象的转变,如等效HtrA(DegS)的报道。Loop LA因其在DegP中的长度(50个氨基酸)而导致低聚物的形成,其mHtrA1非常短S387A型(五个氨基酸),如mHtrA2(也是五个氨基酸),因此缺乏形成高级低聚物的必要相互作用。值得注意的是,PDZ结构域中称为插入钳的有序环与相邻分子的蛋白酶结构域相互作用,这可能有助于稳定该酶的三聚体功能单元。mHtrA1的三维结构S387A型本文将有助于酶特异性抗结核抑制剂的设计。


  • 组织附属关系

    印度新德里Aruna Asaf Ali Marg国家免疫学研究所结构和功能生物学实验室,邮编:110 067。


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丝氨酸蛋白酶337结核分枝杆菌突变: 1 
基因名称:高温气冷堆相同682835_04373
欧盟委员会:3.4.21(PDB初级数据)3.4.21.107(PDB主要数据)
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探索06291号 
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序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团06291号
序列注释
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配体1独特
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TRS公司
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B[认证A]2-氨基-2-羟甲基丙烷-1,3-二醇
C类4小时12
LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-O公司
改性残留物 1独特
身份证件链条类型公式二维示意图起源
九月
SEP查询
A类
L-肽连接C类小时86P(P)SER公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.70 Å
  • R值自由:0.250 
  • R值工作:0.195 
  • 观察到的R值:0.198 
  • 空间组:第6页
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=135.391α = 90
b=135.391β = 90
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