跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息,确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https(https)://确保您连接到官方网站,并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
1998年;3(6):523-34.
doi:10.1016/S1359-0278(98)00068-6。

水合作用对蛋白质折叠动力学和热力学的重要性:简化晶格模型

附属公司

水合作用对蛋白质折叠动力学和热力学的重要性:简化晶格模型

J M索伦森等。 折叠Des 1998

摘要

背景:最近的研究提出了简化蛋白质折叠模型中合作性起源的各种来源。已经讨论过的对协同性的重要贡献包括主链氢键、侧链堆积和疏水相互作用。相关工作还侧重于哪些交互作用导致本地结构的自由能成为自由能景观中显著的全球最小值。此外,已经发现两种风味珠模型表现出较差的折叠协同性,并且往往缺乏独特的天然结构。我们提出了水合作用的简单多体描述,并期望它可以通过这样的方式修改自由能表面,从而增加折叠的协同性并改进双味模型的性能。

结果:我们使用我们的溶剂化模型和相应的无溶剂化项模型研究了立方体晶格上设计的36米序列的折叠热力学和动力学。通过列举最大紧态来研究本征态的简并。使用直方图蒙特卡罗方法获得折叠温度、态密度和热容曲线。通过累积平均首次通过时间与温度的关系来检查折叠动力学。与非溶剂化模型中的序列相比,该溶剂化模型的序列具有更多独特的基态,折叠速度更快,折叠具有更多的协同性。

结论:我们发现,添加溶剂化的多体描述可以改善双味格模型的较差性能,并为更多合作折叠提供了额外的来源。我们的研究结果表明,对溶剂化的更好描述将对未来的蛋白质折叠理论研究具有重要意义。

PubMed免责声明

类似文章

引用人

出版物类型

LinkOut-更多资源