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.1998年9月15日；26(18):4291-300.
doi:10.1093/nar/26.18.4291。

MutS蛋白家族的系统发育研究

J A艾森 1
附属公司

MutS蛋白家族的系统发育研究

J A艾森. 核酸研究. .

摘要

大肠杆菌的MutS蛋白在识别和修复DNA复制过程中的错误中起着关键作用。在包括真核生物、古生菌和其他细菌在内的许多物种中都发现了MutS同源基因，这些蛋白质一起被归入MutS家族。尽管这些蛋白质中的许多具有与大肠杆菌MutS相似的活性，但MutS家族成员的功能存在显著的多样性。这种多样性甚至可以在物种内看到；许多物种编码具有不同功能的多个MutS同源物。为了更好地描述MutS蛋白家族，我结合了系统发育重建和全基因组序列分析。该系统发育分析用于推断MutS家族成员之间的进化关系，并将该家族划分为直系亚科。分析这些直系祖先在特定物种中的分布，并检查亚科内部和亚科之间的关系，以确定MutS家族历史中可能的进化事件（例如基因复制、横向转移和基因丢失）。特别是，有证据表明，生命进化早期的基因复制导致了两个主要的MutS谱系，一个包括已知的在错配修复中起作用的蛋白质，另一个包括未知的在染色体分离和交叉中发挥作用的蛋白质。推断出的MutS家族进化史用于预测分析中包含的一些无特征基因和物种。例如，由于功能在亚家族和谱系中通常是保守的，因此有人提出，可以通过其在MutS家族树中的位置来预测未特征化蛋白质的功能。讨论了系统发育学方法在基因和基因组研究中的应用。

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    1. 年度版次Genet。1991;25:229-53-公共医学
    1. 美国国家科学院院刊1992年3月1日；89(5):1730-4-公共医学
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