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审查
.1998年2月;72(2):891-9.
doi:10.128/JVI.72.2.891-899.1998。

副粘病毒RNA合成与六聚体基因组长度的要求:六重规则

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副粘病毒RNA合成与六聚体基因组长度的要求:六重规则

D科拉科夫斯基等。 J维罗尔. 1998年2月.
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图1
图1
单个子单元组件。如果单个蛋白质亚基与自身反复相互作用,则可以形成大分子组装体。如果结合位点与其自身表面的不包括结合位点本身的区域互补,则这是可能的。改编自Alberts等人(1)。
图2
图2
副粘病毒基因组复制和六聚体基因组长度要求。基因组和抗原组核衣壳显示为N个亚基的线性阵列(开放矩形),每个亚基具有六个结合核苷酸的位点(在抗原组上编号为1至6,5′至3′)。仅显示了6个5′(ppp)和3′(OH)保守碱基的序列。核衣壳组装与合成同时发生,建议与5′齐平购买力平价ACCAA己核苷酸。非6n+0长的链条会改变3′的位置UGGUU启动子元件与末端N亚单位相关,因此启动无效。
图3
图3
顺式-作用启动子序列和六法则。N-RNA核衣壳模板如上图所示,是N个亚单位的螺旋组合,每个亚单位包含6-nt结合位点(暗卵形)。第9、第10和第11亚单位内的SeV序列,包含第56位的N mRNA起始位点,如下所示;第55至66页的YARRGT重音以粗体大写突出显示。右侧显示了在nt 47和67处添加总计6 nt对这些重复的六聚体相的影响,左侧显示了在没有C蛋白表达的情况下它们对DI基因组扩增活性的影响(27)。当这些ARRG重复序列完全包含在第9和第10或第10和第11亚单位中时,假设聚合酶可以同样很好地识别这些重复序列,但当这些重复序列相对于N亚单位的相位发生改变时,识别效果较差。根据参考改编。
图4
图4
mRNA起始位点亚单位相的分布。表1中列出的56个mRNA起始位点的起始腺苷根据其N亚单位位置(六聚体相)绘制在该柱状图中。这些阶段对亚科每个属的聚类通过阴影表示。
图5
图5
副粘病毒科和六法则。N亚单位显示为开放的灰色矩形,其六个核苷酸显示为深椭圆形。聚合酶结合位点显示为一个小的暗方形,它位于两个亚家族中每个亚家族相对于RNA的不同位置。聚合酶由N亚单位结合位点(开放厚线矩形)和RNA相互作用位点(水平厚线)组成,假设这两个亚家族相似。聚合酶的P和L组分未显示。聚合酶N蛋白和RNA结合位点与其靶点的同时相互作用会取代肺炎病毒N亚单位中的RNA,但不会干扰副粘病毒的RNA-N相互作用。
图6
图6
副粘病毒基因组长度校正。病毒RNA显示为水平线;末端的填充符号表示3′端。RNA合成的方向由箭头指示。通过T7 RNA聚合酶表达载体,可以将不自然的非六聚体长度基因组(例如6n+5)导入细胞。虽然它们的复制能力很差,但噬菌体聚合酶不断产生它们,确保了一些抗原合成的发生。嘌呤插入发生在抗原合成和mRNA合成过程中,现在六聚体长度的嘌呤更有效地复制和积累,导致基因组长度的修正。

类似文章

引用人

工具书类

    1. Alberts B等人,《细胞的分子生物学》。第三版,纽约,N.Y:加兰出版社;1994
    1. Baudin,F.(EMBL,法国格勒诺布尔)。个人沟通。
    1. 水疱性口炎病毒的Blumberg B M、Giorgi C、Kolakofsky D.N蛋白在体外选择性包封先导RNA。单元格。1983;32:559–567.-公共医学
    1. Calain P,Curran J,Kolakofsky D,Roux L.天然副粘病毒复制支持缺陷干扰RNA的分子克隆及其在DNA中的表达。病毒学。1992;191:62–71.-公共医学
    1. Calain P,Roux L.六条规则,仙台病毒缺陷干扰RNA有效复制的基本特征。病毒学杂志。1993;67:4822–4830.-项目管理咨询公司-公共医学

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