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.1996年3月1日;24(5):898-906.
doi:10.1093/nar/24.5898。

Hox同源域蛋白与Pbx和DNA表现出选择性复合稳定性

附属公司

Hox同源域蛋白与Pbx和DNA表现出选择性复合稳定性

W F沈等。 核酸研究. .

摘要

Hoxb基因座的九个同源盒基因中有八个编码蛋白质,这些蛋白质包含同源域上游的保守六肽基序。所有八种蛋白质(Hoxb-1-Hoxb-8)在Pbx1a存在的情况下与靶寡核苷酸结合,条件是仅检测到Hox或Pbx1b蛋白质的最小或无结合。Hox-Pbx1a-DNA复合物的稳定性变化大于100倍,来自位点中间的蛋白质(Hoxb-5和Hoxb-6)形成非常稳定的复合物,而Hoxb-4、Hoxb-7和Hoxb-8形成中等稳定性的复合物并且位于位点3'-侧的蛋白质(Hoxb-1-Hoxb-3)形成非常不稳定的复合体。虽然Hox-b蛋白在六肽和同源结构域之间含有较长的连接子序列,形成了不稳定的复合物,但缩短连接子并不能赋予复合物稳定性。同源密码子交换实验表明,这个基序并不能独立决定复杂的稳定性。特定Hox蛋白六肽内自然发生的变异也不能解释复杂的稳定性差异。然而,在六肽结构域内绝对保守的两个核心氨基酸(色氨酸和蛋氨酸)似乎是复合物形成所必需的。去除N端和C端侧翼区域不会影响复合物的稳定性,paralog组4(Hoxa-4、b-4、C-4和d-4)的成员共享高度保守的六肽、连接子和同源结构域,但侧翼区域不同,形成具有类似稳定性的复合物。这些数据表明,决定Hox-Pbx1a-DNA复合物稳定性的Hox蛋白的结构特征位于同源结构域、六肽和连接子区域之间的精确结构关系中。

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