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.1993年6月;7(6):1047-58.
doi:10.1101/gad.7.6.1047。

亮氨酸拉链bZIP基序对DNA结合的二聚体特异性:预测和合理设计

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亮氨酸拉链bZIP基序对DNA结合的二聚体特异性:预测和合理设计

C R文森等。 基因开发. 1993年6月.
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摘要

我们提出了一个螺旋间盐桥规则来解释亮氨酸拉链结构中两个两亲性α螺旋之间的二聚化特异性。我们以DNA结合蛋白的bZIP类为模型系统,预测并设计了新的二聚体伴侣。我们预测ATF4是ATF/CREB转录因子家族的成员,它将优先与C/EBP超家族成员IGEBP1形成异二聚体。这些预测通过凝胶流动性转移试验进行了验证。为了进一步测试这种螺旋间盐桥规则的价值,我们修改了bZIP蛋白C/EBP,试图设计与C/EBP优先形成异二聚体的分子或与C/EBP不相互作用的分子。这些设计的分子的行为与预测相符。因此,我们得出结论,这种螺旋间盐桥规则有助于理解bZIP蛋白的二聚化特异性。此外,我们建议利用这一规则设计新的“显性-阴性”分子,以在体内特异性抑制靶亮氨酸拉链蛋白的功能。

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