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.1993年8月15日;268(23):16938-48.

预测蛋白质中HIV蛋白酶裂解位点的矢量化序列耦合模型

附属机构
  • PMID: 8349584
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预测蛋白质中HIV蛋白酶裂解位点的矢量化序列耦合模型

K C周. 生物化学杂志. .
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摘要

什么样的肽序列可以被HIV蛋白酶切割,什么样的不能?这是设计有效的HIV蛋白酶抑制剂作为艾滋病治疗潜在药物的关键问题。为了解决这个问题,提出了一个序列耦合和矢量化模型,用于预测具有多个和扩展特异性亚基的蛋白酶对寡肽的裂解性。与现有方法相比,新方法在模型的准确性和统计处理的合理性方面都有所提高。同时,本文介绍的蒙特卡罗抽样程序也被证明在处理实验数据采样不足以进行完全统计时非常有用。由于预测准确率很高,预计新方法可以成为一种有用的技术,帮助寻找有效的HIV蛋白酶抑制剂,而HIV蛋白酶是设计潜在艾滋病药物的目标之一。新方法的原理也可用于分析任何多亚基酶的特异性。

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