Solution structure of the DNA-binding domain of the heat shock transcription factor determined by multidimensional heteronuclear magnetic resonance spectroscopy

doi:10.1002/pro.5560031020

.1994年10月；3(10):1806-21.

doi:10.1002/pro.5560031020。

多维异核磁共振波谱法测定热休克转录因子DNA结合域的溶液结构

F F Damberger公司¹, J G Pelton公司, C J哈里森, H C纳尔逊, D E Wemmer公司

附属公司

PMID： 7849597
预防性维修识别码： PMC2142621型
内政部： 10.1002/pro.5560031020

多维异核核磁共振波谱测定热休克转录因子DNA结合域的溶液结构

F F Damberger公司等。蛋白质科学. 1994年10月.

.1994年10月；3(10):1806-21.

doi:10.1002/pro.5560031020。

作者

F F丹伯格¹, J G Pelton公司, C J哈里森, H C纳尔逊, D E Wemmer公司

附属

¹加州大学伯克利分校生物物理学研究生组，94720。

PMID： 7849597
预防性维修识别码： PMC2142621型
内政部： 10.1002/pro.5560031020

摘要

采用多维核磁共振方法测定了乳克鲁维酵母热休克转录因子92位DNA结合域的溶液结构。使用三维（3D）三重共振、1H-13C-13C-1H全相关光谱和15N分离全相关光谱-异核多量子关联实验以及各种2D光谱，对主链和侧链1H、15N和13C共振进行几乎完整的分配。三维13C-和15N-分离NOE光谱（NOESY）-异核多量子关联光谱和四维13C/13C-编辑NOESY光谱中确定的五个八十三个NOE约束，以及35 phi、9 chi 1和30个氢键约束，通过混合距离几何/模拟退火协议计算了30个结构，其中24个用于结构比较。计算表明，3螺旋束与小的4股反平行β-片相互包裹。相对于平均结构，结构家族的主干RMS偏差（RMSD）为1.03+/-0.19 A。拓扑结构类似于分解代谢基因激活蛋白的C末端结构域，似乎属于DNA-结合蛋白的螺旋-螺旋家族。核磁共振数据确定的总折叠与该领域的最新晶体学工作一致（Harrison CJ，Bohm AA，Nelson HCM，1994，Science 263:224），核磁共振和X射线结构1.77+/-0.20 A中主链原子之间的RMSD证明了这一点。我们发现了一些差异，其中一些可能是由于晶体中的蛋白质相互作用。

PubMed免责声明

类似文章

番茄热应激转录因子HSF24的DNA结合域的溶液结构。
Schultheiss J、Kunert O、Gase U、Scharf KD、Nover L、Rüterjans H。 Schultheiss J等人。欧洲生物化学杂志。1996年3月15日；236（3）：911-21。doi:10.1111/j.1432-1033.1996.00911.x。欧洲生物化学杂志。1996 PMID：8665913
通过多维异核核磁共振对较大蛋白质、蛋白质-甘氨酸和蛋白质-DNA复合物的结构进行研究。
Clore GM，Gronenborn AM。 Clore GM等人。生物物理分子生物学进展。1994;62(2):153-84. doi:10.1016/0079-6107（94）90010-8。生物物理分子生物学进展。1994 PMID：7938541 审查。没有可用的摘要。
蛋白质核磁共振谱分析的共振分配策略。
利奥波德MF、Urbauer JL、Wand AJ。 Leopold MF等人。分子生物技术。1994年8月；2(1):61-93. doi:10.1007/BF02789290。分子生物技术。1994 PMID：7866869 审查。
大肠杆菌DnaJ（1-78）的1H和15N磁共振分配、二级结构和三级折叠。
Hill RB、Flanagan JM、Prestegard JH。 Hill RB等人。生物化学。1995年4月25日；34(16):5587-96. doi:10.1021/bi00016a033。生物化学。1995 PMID：7727420
乳酸克鲁维酵母热休克因子DNA结合域的精细溶液结构和动力学。
Damberger FF、Pelton JG、Liu C、Cho H、Harrison CJ、Nelson HC、Wemmer DE。 Damberger FF等人。分子生物学杂志。1995年12月8日；254(4):704-19. doi:10.1006/jmbi.1995.0649。分子生物学杂志。1995 PMID：7500344

查看所有类似文章

引用人

大蒜（Allium sativum L.）热休克转录因子家族的全基因组鉴定、分类和表达分析。
郝X、何S。 Hao X等人。 BMC植物生物学。2024年5月18日；24（1）:421。doi:10.1186/s12870-024-05018-3。 BMC植物生物学。2024 PMID：38760734 免费PMC文章。
PbHsfC1a-协调ABA生物合成和H₂O（运行）₂提高杜梨耐旱性的信号途径。
张福、王C、姚JL、邢C、徐克、张Z、陈Q、乔Q、董H、韩C、林L、张S、黄X。张飞等。《植物生物技术杂志》2024年5月；22(5):1177-1197. doi:10.1111/pbi.14255。Epub 2023年12月2日。《植物生物技术杂志》2024。 PMID：38041554 免费PMC文章。
C4籽粒苋组织和发育鳞片热应激和恢复过程中热休克因子的功能分化(千穗谷).
Goel K、Kundu P、Gahlaut V、Sharma P、Kumar A、Thakur S、Verma V、Bhargava B、Chandora R、Zinta G。 Goel K等人。前植物科学。2023年4月11日；14:1151057. doi:10.3389/fpls.2023.1151057。eCollection 2023年。前植物科学。2023 PMID：37123843 免费PMC文章。
HSF1在病毒感染中有作用吗？
Reyes A、Navarro AJ、Diethelm Varela B、Kalergis AM、González PA。 Reyes A等人。 FEBS Open Bio.2022年6月；12(6):1112-1124. doi:10.1002/2211-5463.13419。Epub 2022年5月10日。 FEBS开放生物。2022。 PMID：35485710 免费PMC文章。审查。
HSF1在病理生理学中的多方面作用：关注其与TG2的相互作用。
Occhigrossi L、D’Eletto M、Barlev N、Rossin F。 Occhigrossi L等人。国际分子科学杂志。2021年6月14日；22(12):6366. doi:10.3390/ijms22126366。国际分子科学杂志。2021 PMID：34198675 免费PMC文章。审查。

查看所有“被引用”文章

工具书类

1. 生物化学。1990年9月4日；29(35):8172-84-公共医学
1. 分子生物学杂志。1983年10月5日；169(4):949-61-公共医学
1. 细胞。1993年7月16日；74（1）:1-4-公共医学
1. 科学。1988年3月4日；239(4844):1139-42-公共医学
1. 微生物学评论，1993年6月；57(2):402-14-公共医学

出版物类型

行动
行动
行动

MeSH术语

行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动

赠款和资金

GM 44086/GM/NIGMS NIH HHS/美国

LinkOut-更多资源

全文源
分子生物学数据库
- 酵母基因组数据库

[1] 生物化学。1990年9月4日；29(35):8172-84-公共医学

[2] 生物化学。1990年9月4日；29(35):8172-84-公共医学

[3] 分子生物学杂志。1983年10月5日；169(4):949-61-公共医学

[4] 分子生物学杂志。1983年10月5日；169(4):949-61-公共医学

[5] 细胞。1993年7月16日；74（1）:1-4-公共医学

[6] 细胞。1993年7月16日；74（1）:1-4-公共医学

[7] 科学。1988年3月4日；239(4844):1139-42-公共医学

[8] 科学。1988年3月4日；239(4844):1139-42-公共医学

[9] 微生物学评论，1993年6月；57(2):402-14-公共医学

[10] 微生物学评论，1993年6月；57(2):402-14-公共医学

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

您的RSS源

多维异核磁共振波谱法测定热休克转录因子DNA结合域的溶液结构

附属

多维异核核磁共振波谱测定热休克转录因子DNA结合域的溶液结构

作者

附属

摘要

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

分子生物学数据库

摘要

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

相关信息

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

分子生物学数据库