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.1985年10月5日;260(22):12136-41.

人血浆纤维连接蛋白中DNA和肝素结合域(域III)的一级结构

  • PMID: 3900070
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人血浆纤维连接蛋白中DNA和肝素结合域(域III)的一级结构

J Calaycay出版社等。 生物化学杂志. .
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摘要

通过对人血浆纤维连接蛋白的有限嗜热蛋白酶消化,获得了DNA和肝素结合域的完整氨基酸序列。该结构域包含90个氨基酸,计算分子量为10225。当通过十二烷基硫酸钠凝胶电泳分析时,该结构域的表观分子量为14kDa。异常高的分子尺寸估计可能是由于该方法在低范围内的不准确。结构是通过对糜蛋白酶肽、胰蛋白酶肽和金黄色葡萄球菌蛋白酶肽的微序列分析确定的。通过快速原子轰击质谱法获得了每种糜色肽的分子离子。该结构域具有在中性pH下净电荷为+5的碱基残基的优势。该结构域的基本性质可以解释其对多阴离子、DNA和肝素的亲和力。预测的二级结构为β-片状结构,与迄今为止获得的纤维连接蛋白的所有III型内部序列同源结构相同。通过有限的嗜热蛋白酶消化和片段鉴定,以及14-kDa片段的序列与牛血浆纤维连接蛋白的部分结构的比较,可以在纤维连连接蛋白中定位该结构域。该结构域包含残基585-675,并定义紧邻胶原蛋白结合结构域的区域。从氨基末端开始的编号域是域III,位于纤维蛋白/肝素/肌动蛋白/金黄色葡萄球菌结合域I和胶原蛋白结合域II之后。该结构域是从结合肝素、DNA和明胶的较大前体(56kDa)获得的。对56-kDa片段的进一步消化产生了仅结合明胶的40kDa片断和仅结合肝素或DNA的14kDa片。14-kDa片段(结构域III)标志着纤维连接蛋白中III型同源区域的开始,因为可能有多达15个90个氨基酸的重复序列。该结构域的大小对应于90个氨基酸的一个重复序列,并且与迄今为止在纤维连接蛋白中发现的其他III型序列有一些同源性。

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