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1985年7月;28(7):849-57.
doi:10.1021/jm00145a002。

确定生物重要大分子上能量有利结合位点的计算程序

确定重要生物大分子上能量有利结合位点的计算程序

P J古德福德 化学 1985年7月

摘要

探针基团与结构已知的蛋白质的相互作用是在整个大分子及其周围的样品位置计算的,给出了一系列能量值。探针包括水、甲基、胺氮、羧基氧和羟基。计算每个探针在适当能量水平下的轮廓表面,并通过计算机图形和蛋白质结构显示。负能量水平的轮廓描绘了轮廓,也使探针和蛋白质之间的其他吸引区域成为可能,特别是在已知的配体结合裂缝处。这些轮廓还使其他吸引区域能够被识别,并有助于蛋白质配体能量学的解释。因此,它们可能对药物设计有价值。

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