ALKBHs-facilitated RNA modifications and de-modifications

doi:10.1016/j.dnarep.2016.05.026

审查

.2016年8月：44:87-91。

doi:10.1016/j.dnarep.2016.05.026。 Epub 2016年5月17日。

ALKBHs促进的RNA修饰和去修饰

Endalchew A阿勒姆¹, 川河², 阿恩·克伦格兰^三

附属公司

¹挪威奥斯陆NO-0027，Rikshospitalet，奥斯陆大学医院临床医学研究所，诊断和干预科，微生物学系；挪威奥斯陆NO-0027奥斯陆大学基础医学研究所医学院分子医学系。
²美国伊利诺伊州芝加哥市东57街929号芝加哥大学霍华德·休斯医学院化学系、生物化学和分子生物学系以及生物物理动力学研究所。电子地址：chuanhe@uchicago.edu。
^三挪威奥斯陆NO-0027，Rikshospitalet，奥斯陆大学医院临床医学研究所，诊断和干预科，微生物学系；挪威奥斯陆NO-0027奥斯陆大学基础医学研究所医学院分子医学系。电子地址：arne.klungland@medisin.uio.no。

PMID： 27237585
预防性维修识别码：第512页第542页
内政部： 2016年10月10日/j.dnarep.2016.05.026

审查

ALKBHs促进的RNA修饰和去修饰

Endalkachew阿仑木等。 DNA修复（Amst）. 2016年8月.

.2016年8月：44:87-91。

doi:10.1016/j.dnarep.2016.05.026。 Epub 2016年5月17日。

作者

Endalchew A阿勒姆¹, 川河², 阿恩·克伦格兰^三

附属公司

¹挪威奥斯陆NO-0027，Rikshospitalet，奥斯陆大学医院临床医学研究所，诊断和干预科，微生物学系；挪威奥斯陆NO-0027奥斯陆大学基础医学研究所医学院分子医学系。
²美国伊利诺伊州芝加哥市东57街929号芝加哥大学霍华德·休斯医学院化学系、生物化学和分子生物学系以及生物物理动力学研究所。电子地址：chuanhe@uchicago.edu。
^三挪威奥斯陆NO-0027，Rikshospitalet，奥斯陆大学医院临床医学研究所，诊断和干预科，微生物学系；挪威奥斯陆NO-0027奥斯陆大学基础医学研究所医学院分子医学系。电子地址：arne.klungland@medisin.uio.no。

PMID： 27237585
预防性维修识别码：项目经理5120542
内政部： 2016年10月10日/j.dnarep.2016.05.026

摘要

保护大肠杆菌免受DNA甲基化损伤的AlkB基因是在30多年前发现的。20年后，发现AlkB蛋白通过氧化去甲基化来催化甲基化DNA碱基损伤的修复。两个人类AlkB同源物具有相似的DNA修复活性，并根据序列同源性鉴定了另外七个人类Alk B同源物。所有这些加氧酶，ALKBH1-8和FTO，都含有一个保守的α-酮戊二酸/铁依赖结构域，用于甲基修饰和脱修饰。过去10年精心设计的研究已经确定了AlkB同源物不可预见的底物异质性，包括RNA中新的可逆甲基修饰。AlkB家族酶催化的RNA去甲基化的发现开创了基因表达调控的新领域，尽管对这些RNA去甲基化酶的确切内源性活性和作用的理解仍不成熟。值得一提的是，AlkB机制和α-酮戊二酸的使用对许多酶的表观遗传重编程至关重要，这些酶修饰和去修饰DNA中的甲基化碱和组蛋白中的甲基氨基酸。

关键词：AlkB同系物；DNA修复；氧化脱甲基；RNA代谢；YTH结构域蛋白。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者声明没有利益冲突。

数字

图1
的域体系结构*大肠杆菌*(*大肠杆菌*)AlkB和九种哺乳动物的AlkB同源物。的UniProtKB登录号*大肠杆菌*碱性磷酸酶（P05050）；以及人类ALKBH1（Q5XKL0）、ALKBH2（Q6NS38）、ALKB H3（Q96Q83）、ALK BH4（Q9NXW9）、ALB H5（Q6P6C2）、AL KBH6（Q3KRA9）、AlK BH7（Q9BT30）、ALk BH8（Q96BT7）和FTO（Q9C0B1）。铁₂OG双加氧酶（Fe（II）和α-酮戊二酸依赖的双加氧酶域）；CC（卷曲线圈）、MTS（线粒体靶向信号）、Ala-rich（Ala伸展区）；RRM（RNA识别基序）、SAM-MT（S-腺苷甲硫氨酸依赖甲基转移酶结构域）和CTD（C-末端结构域）。

图2
1-甲基腺嘌呤（m¹A）和6-甲基腺嘌呤（m⁶A）哺乳动物mRNA的动力学¹最近对mRNA进行了A in，因此甲基化动力学的结果表明是mRNA的甲基化⁶A.正文中的所有其他细节。

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[9] Falnes PO、Johansen RF、Seeberg E.AlkB介导的氧化脱甲基逆转大肠杆菌中的DNA损伤。自然。2002年9月；419(6903):178–182.-公共医学

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