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.2015年2月19日;57(4):662-673.
doi:10.1016/j.molcel.2014.12.023。 Epub 2015年1月15日。

WT1招募TET2调节其靶基因表达并抑制白血病细胞增殖

附属公司

WT1招募TET2调节其靶基因表达并抑制白血病细胞增殖

王一平等。 分子电池. .

摘要

TET2 DNA双加氧酶通过调节DNA甲基化和大量基因的表达来调节细胞特性并抑制肿瘤发生。与大多数其他染色质修饰酶一样,TET2如何被招募到特定的基因组位点尚不清楚。在这里,我们报道了WT1,一种序列特异性转录因子,在急性髓细胞白血病(AML)中与TET2、IDH1和IDH2以互斥方式发生突变。WT1与TET2相互作用,并将其招募到目标基因以激活其表达。多个AML衍生的TET2突变破坏了WT1和TET2之间的相互作用。TET2以依赖于WT1的方式抑制白血病细胞增殖和集落形成。这些结果提供了将TET2靶向基因组中特定DNA序列的机制。我们的结果还解释了急性髓性白血病中WT1和TET2突变的互斥性,并提示IDH1/2-TET2-WT1通路在抑制急性髓性淋巴瘤中的作用。

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数字

图1
图1。TET2激活WT1靶基因
(A)体细胞变异IDH1/2,TET2工作任务1共有1057例AML病例,其中303例至少携带一种突变。数据收集自六项不同的研究(2013年;Fernandez-Mercado等人,2012年;Liang等人,2013年;Patel等人,2012;Rocquain等人,2010;Welch等人,2012)(B)的重叠IDH1/2,TET2工作任务1303例AML突变病例的突变。(C)标记的全长TET2在HEK293T细胞中过度表达,通过qRT-PCR测定WT1靶基因的mRNA表达。(D)TET2在有或无稳定HL-60细胞中的过度表达工作任务1击倒。用表达不同shRNAs的逆转录病毒转导HL-60细胞工作任务1和表达Flag标记的全长TET2的逆转录病毒。western blot检测WT1和TET2蛋白的表达。(E)如(D)所述产生稳定的HL-60细胞,并通过qRT-PCR测定WT1靶基因的mRNA表达。(F)将过表达TET2 Flag的稳定HL-60细胞或空载体对照用指定浓度的细胞可渗透的D-2-HG处理12小时。通过qRT-PCR测定WT1靶基因的mRNA表达。所示为标准偏差(S.D.)下三倍结果的平均值。另请参见图S1。
图2
图2。TET2直接绑定到WT1
(A)从两个人类AML细胞系(即KG-1和HL-60)中免疫沉淀内源性WT1蛋白,然后通过western blot检测TET2。正常兔IgG作为阴性对照。(B)从小鼠ES细胞或骨髓(BM)细胞免疫沉淀内源性Wt1蛋白,然后通过western blot检测Tet2。正常兔IgG作为阴性对照。(C)用表达指示基因的质粒瞬时转染HCT116细胞。使用指示的抗体通过IP-western检测蛋白质相互作用。(D)如示意图所示,野生型WT1及其缺失突变体与Flag-TET2在HEK293T细胞中共同表达。使用指示的抗体通过IP-western检测蛋白质相互作用。(E)如示意图所示,野生型TET2及其缺失突变体与WT1-HA在HEK293T细胞中共同表达。使用指示的抗体通过IP-western检测蛋白质相互作用。(F–G)重组标记-6xHis-TET2光盘将从感染杆状病毒的Sf9细胞纯化的(200 ng)和Flag-WT1(400 ng)蛋白一起培养。然后添加镍珠,用咪唑洗脱结合蛋白并通过SDS-PAGE进行拆分。WT1-TET2型光盘结合用western blot(F)或SYPRO Ruby染色(G)检测。另请参见图S2。
图3
图3。TET2被WT1招募到其靶基因
(A)标记-TET2在HEK293T细胞中以单一或WT1-HA的形式瞬时表达。用ChIP-qPCR(上部)测定WT1靶基因启动子区Flag-TET2的占有率,用hMeDIP-qPCR(下部)测定Flag-TET2结合位点5hmC的富集率。小鼠IgG和兔IgG分别作为ChIP-qPCR和hMeDIP-qPCR的阴性对照。(B)在HEK293T细胞中,TET2的标记野生型(WT)TET2或其催化非活性突变体(CM)暂时单一或与HA-WT1过度表达。使用GluMS-qPCR测定位点特异性5hmC和5mC水平。a、 b表示每个目标基因的MspI/HapII识别位点。箭头表示启动子方向。(C)稳定的HL-60细胞,内源性基因敲除TET2测试如图S3C所示,生成标记的TET2的put-back。通过ChIP-qPCR测定TET2 Flag和内源性WT1在所指示的WT1靶基因的启动子区域上的占有率。包括小鼠IgG和兔IgG作为阴性对照。箭头表示启动子方向,CGI(绿线)表示CpG岛,红色虚线表示WT1结合基序。(D)用表达不同shRNAs的逆转录病毒转导(C)中稳定的HL-60细胞工作任务1通过ChIP-qPCR确定TET2-Flag在所示WT1靶基因启动子区域的占有率。小鼠IgG作为阴性对照。(E)用表达不同shRNAs的逆转录病毒转导HL-60细胞工作任务1和/或TET2测试如图S3F所示。使用GluMS-qPCR测定5hmC和5mC的位点特异性水平。(F)通过qRT-PCR检测(E)中稳定的HL-60细胞的指示WT1靶基因的mRNA表达。所示为标准偏差(S.D.)下三倍结果的平均值。*表示所示比较的P<0.05;**对于指示的比较,表示P<0.01;n.s.=不重要。另请参见图S3。
图4
图4。TET2以WT1依赖性方式抑制白血病细胞增殖
(A–B)稳定HL-60细胞过度表达全长TET2的细胞增殖(A)和集落形成(B)工作任务1分别通过细胞计数和克隆形成试验检测敲除。(C–D)稳定HL-60细胞的细胞增殖(C)和集落形成(D)工作任务1和/或TET2测试分别用细胞计数法和克隆形成法测定。(E)稳定KG-1细胞的细胞增殖工作任务1和/或TET2测试通过细胞计数测定。所示为标准偏差(S.D.)下三倍结果的平均值*表示p<0.05,**表示p<0.01,***表示所示比较的p<0.001。n.s.=不重要。另请参见图S4。
图5
图5。TET2中AML衍生突变破坏WT1结合
(A)用编码HA标记野生型TET2的载体瞬时转染HL-60细胞光盘或AML衍生的WT1-binding缺陷的TET2突变体,并且体外表达的TEM2蛋白被免疫沉淀,然后通过western blot检测内源性WT1。(B) 体外TET2催化活性测定。从人类单核细胞衍生巨噬细胞(MDM)细胞中分离出基因组DNA,用免疫纯化的HA标记野生型和突变体人类TET2在37°C下进行超声处理并孵育2小时。反应终止后,使用5mC、5hmC、,5fC和5caC。有关更多详细信息,请参阅实验程序。用亚甲蓝染色法检测每个反应中的DNA含量。CM是指TET2的一个催化突变,含有两个破坏与铁结合的突变2+ (C)用编码HA标记野生型TET2的慢病毒载体转导HL-60细胞光盘,或AML衍生的WT1结合缺陷TET2光盘突变体和异位TET2的表达光盘蛋白质测定采用westernblot。(D–F)如上文(C)所述,生成稳定的HL-60细胞。用hMeDIP-qPCR(D)检测所示WT1靶基因启动子区TET2结合位点的5hmC富集,将兔IgG作为阴性对照。此外,用GluMS-qPCR(E)测定5hmC和5mC的位点特异性水平,用qRT-PCR(F)测定WT1靶基因的mRNA表达。所示为标准偏差(S.D.)下三倍结果的平均值*表示p<0.05,**表示所示比较的p<0.01。n.s.=不重要。另请参见图S5。
图6
图6。AML衍生的WT1结合缺陷的TET2突变体不能抑制白血病细胞增殖
(A–B)表达HA-TET2野生型或WT1结合缺陷突变体的稳定HL-60细胞的细胞增殖(A)和集落形成(B)光盘分别用细胞计数法和克隆形成法测定。(C)AML抑制中IDH1/2-TET2-WT1通路的示意图。另见表S2。

中的注释

  • WIT治疗白血病的新途径。
    Sardina JL、Graf T。 Sardina JL等人。 分子细胞。2015年2月19日;57(4):573-574. doi:10.1016/j.molcel.2015.02.005。 分子细胞。2015. PMID:25699704

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