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.2013年10月24日;4(10):e877。
doi:10.1038/cddis.2013.393。

丝氨酸、叶酸和甘氨酸代谢对癌细胞ATP、NADPH和嘌呤需求的贡献

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丝氨酸、叶酸和甘氨酸代谢对癌细胞ATP、NADPH和嘌呤需求的贡献

P M特德斯基等。 细胞死亡病. .

摘要

最近对癌细胞代谢的观察表明,葡萄糖丝氨酸合成增加是预后不良的标志。我们预测,合成丝氨酸的一部分被路由到ATP生成途径。该途径由丝氨酸合成、一碳(叶酸)代谢和甘氨酸裂解系统(SOG途径)的反应组成。在这里,我们表明SOG途径在人类肿瘤子集的基因表达水平上上调,其表达水平与细胞增殖和Myc靶点激活的基因特征相关。我们还利用先前报道的交换通量和个性化的细胞代谢模型,估算了NCI60肿瘤衍生细胞系中SOG途径的代谢通量。我们发现SOG途径中的估计反应速率与这些细胞系的增殖速率高度相关。我们还观察到,SOG途径对生物合成的能量需求、脂肪酸合成的NADPH需求以及嘌呤的合成都有重要贡献。最后,当PC-3前列腺癌细胞系用抗叶酸甲氨蝶呤处理时,我们观察到ATP水平、AMP激酶活性降低,并且由[1,2-(13)C2]-D-葡萄糖作为单一示踪剂合成的核糖核苷酸和脂肪酸减少。综上所述,我们的结果表明,SOG途径活性随着细胞增殖速度的增加而增加,并有助于癌细胞对嘌呤、ATP和NADPH的生物合成需求。

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图1
图1
丝氨酸、单碳循环、甘氨酸合成(SOG)途径。SOG途径中涉及的反应示意图,包括丝氨酸合成(绿色)、单碳循环(红色)和GC(蓝色)以及与其他途径的串扰。反应方向是根据NCI60肿瘤衍生细胞系面板中推断的通量推断出来的(详见正文)
图2
图2
人类癌症、分化细胞和胚胎干细胞中SOG途径酶编码基因的表达。编码SOG途径中酶的基因的表达(行)()乳房和(b条)前列腺癌患者(列),分别基于和的数据。顶行显示GSEA量化的SOG途径、Myc靶点激活和增殖基因特征上调分数,以及Myc基因表达。蓝色表示表达不足,红色表示过度表达。上横线表示肿瘤的子集,其中SOG通路信号显著下调(P(P)<0.05,下降),中度或显著上调(P(P)<0.05,向上)。(c(c))根据中报告的数据,人类胚胎和分化的正常细胞中SOG途径酶编码基因的表达(d日)根据中报告的数据,在小鼠R1胚胎干细胞分化过程中SOG通路中编码酶的基因的表达。样品按起始日期和使用条件进行标记:非粘附塑料皿中的胚胎体(EB)形成、明胶涂层板(GEL)和基质凝胶涂层板(MAT)。白色方块代表缺失的表达式数据
图3
图3
代谢通量与增殖率的关系。()SOG途径中反应的估计代谢通量显示为细胞系增殖率的函数。每个点/错误条代表NCI60面板中的一条单元格线。该点表示所探索模型动力学参数范围内的中位数,误差条表示90%的置信区间。虚线是线性拟合。面板(b条e(电子))报告中测量的交换通量。这些通量在个性化模型中是固定的,因此,由于模型动力学参数的变化,它们不会显示误差条
图4
图4
与其他路径的串扰。()作为细胞系增殖率的函数,与SOG途径部分或相互干扰的选定反应的估计速率。每个点/错误条代表NCI60面板中的一条单元格线。该点表示所探索的动力学参数范围内的中值,误差条表示90%的置信区间
图5
图5
甲氨蝶呤治疗对代谢参数的影响。()未经治疗和使用10和100 nM甲氨蝶呤治疗的细胞培养中PC-3细胞计数随时间的变化。(b条(f))中的更改(b条)ATP、(c(c))ADP和(d日)AMP水平和英寸(e(电子))ADP/ATP和((f))用100nM甲氨蝶呤处理后的AMP/ATP比率。()100 nM甲氨蝶呤治疗后AMPK、pAMPK,ACC和pACC的蛋白印迹。(小时)pAMPK/AMPK和pACC/ACC比值相对于对照的量化(时间零点数据)。()EZ公司Topolome(heatmap)总结了在未经处理(对照)和用100 nM甲氨蝶呤(MTX)处理的细胞培养物中三次测量的标记代谢物的变化。红色/蓝色表示高于/低于样本平均值的表达式。顶行指示表达式级别更改的颜色代码

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