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2013;8(4):e60020。
doi:10.1371/journal.pone.0060020。 Epub 2013年4月3日。

Utx是胚胎干细胞分化过程中外胚层和中胚层正确诱导所必需的

附属公司

Utx是胚胎干细胞分化过程中正确诱导外胚层和中胚层所必需的

克里斯蒂娜·莫拉莱斯·托雷斯等。 公共科学图书馆一号 2013

摘要

胚胎发育需要染色质重塑来动态调节基因表达模式,以确保多功能转录因子沉默和发育调节因子激活。组蛋白去甲基化酶Utx和Jmjd3对H3K27me3的去甲基化对于谱系选择基因响应发育信号的激活是重要的。为了进一步了解Utx在多能性和分化中的功能,我们生成了Utx敲除胚胎干细胞(ESCs)。在这里,我们表明Utx对ESCs的增殖不是必需的,然而,Utx有助于体外建立外胚层和中胚层。有趣的是,这种贡献与Utx的催化活性无关。此外,我们提供的数据表明,缺乏可检测的去甲基化酶活性的Utx同源物Uty和Jmjd3部分补偿了Utx的损失。综上所述,我们的结果表明,体外正确形成外胚层和中胚层需要Utx,并且Utx与其同源线虫相似,具有脱甲基酶依赖性和独立功能。

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数字

图1
图1。产生Utx敲除ESCs,敲除ESC与野生型和催化突变型Utx互补。
(A) Utx基因座的功能域概述Utx公司以及外显子3的条件靶向盒。(B) 已预测Utx公司用Flp重组酶处理靶向Utx克隆后显示靶向盒的漂浮等位基因。(C) 已预测Utx公司Cre重组酶处理后的位点和缺失等位基因。(D) 的基因分型Utx公司Flp和Cre重组后ESCs中的位点:琼脂糖凝胶显示野生型非靶向等位基因(R1∶1030 bp)、漂浮等位基因的PCR扩增(D02,D05∶1113 bp)和缺失等位基因ESCs(KO克隆1–4∶361 bp)。(E)Utx公司通过定量RT-PCR分析确定的表达水平(归一化为卢比0以及R1 ESC线中表示的水平)。(F) Western blot分析WT、floxed、KO1和KO2 ESCs中表达的Utx。文丘林起到了装载控制作用。(G) 用Ty1肽的两个拷贝、Venus荧光蛋白、生物素标记、Blastidin/Kanamycin抗性基因编码区周围的两个rox位点和三个标记拷贝标记的野生型和催化非活性突变BAC蛋白的示意图。(H) 免疫印迹显示floxed(D02)、敲除克隆(KO2)、野生型Utx BAC(+WT)和催化突变型Utx BAC(+Mut)中内源性和标记的Utx水平以及Ty1表达。
图2
图2。电子稳定控制系统扩散不需要Utx。
(A) Oct4、Nanog和Sox2的mRNA表达水平。Rplp0和R1的RT-qPCR标准化。(B–C)显示Oct4和Nanog水平的免疫印迹。使用文丘林作为负荷控制。(D) 对照组(R1,D02)、KO(KO1,KO2)和补充组(+WT,+Mut)ESC的形态。(E) 在指定日期测量的指定ESC的细胞增殖分析。(F) WT(D02)和KO1细胞的DNA/BrdU流式细胞术分析。控件表示没有BrdU脉冲的电池。PI是碘化丙啶。(G) 通过流式细胞仪对WT和KO1进行细胞周期分析。
图3
图3。Utx调节分化过程中发育调节因子的及时激活。
(A) ESC差异化方案。在RA治疗后24、48和72小时采集样本,并进行RT-qPCR分析。RA治疗72小时后,所有RT-qPCR在T0(B)ESC形态下归一化为Rplp0和D02水平。(C) Utx mRNA在时间进程中的表达(D,E)多能性标记Oct4 mRNA和分化过程中的蛋白表达水平。使用文丘林作为负荷控制。(F–N)分化过程中指示基因的表达分析。外胚层标记:Msi1、Sox1、Otx2、Pax6、Nes、Gfap、Tubb3;中胚层标记:Flk1,T。误差条代表SD,n=3个独立分析(***p<0.0005,双尾Student检验)。
图4
图4。Utx对正常ESC分化很重要。
(A–F)内胚层标记物FoxA2、Sox17、Sall4、Gata4、Afp和同源盒基因Hoxb1的表达分析。误差条代表SD,n=3个独立分析(***p<0.0005,双尾Student检验)。分化过程中(G-H)H3K27me3蛋白水平。微管蛋白和H3被用作负荷控制。
图5
图5。正确区分ESC需要Utx。
(A) 以所示ESCs为起始材料,在胚状体形成9天后对其进行形态观察。白色箭头表示一些内部气穴。(B) 分化后第10天采集的EB的H&E染色。(C) 分化6天和9天后,多能性标记物Oct4和Nanog的表达。(D) EB分化3、6和9天前后的Utx表达水平。(E) ESCs EB形成过程中Utx、Ezh2和H3K27me3的Western blot。使用Vinculin、H3和ß-微管蛋白作为负荷对照。(F,G,I)EB分化9天后外胚层(Msi1,Sox1)、中胚层(Flk1)和内胚层(FoxA2,Pax3)标记的基因激活。(H) 分化6天后中胚层标志物Brachyury的表达水平。所有RT-qPCR均归一化为T0和Rplp0时D02的表达。(J) EB形成和心脏谱系分化后,R1、D02、KO2、+Wt和+Mut搏动EB的百分比。误差条代表SD,n=3个独立分析(***p<0.0005,双尾Student检验)
图6
图6。Utx与发育基因的启动子区域结合。
(A) Utx的ChIP分析和显示的组蛋白修饰霍克斯b1在分化过程中的指定时间启动子。(B–F)Utx与外胚层启动子区的结合(Msi1型,Sox1系列); 中胚层(法兰1,T型)和内胚层(福克斯A2)ChIP检测的发育调节因子。“%input”表示(装订/输入材料x 100)。误差条代表SD,n=3个独立分析。(*p<0.05;***p<0.0005,双尾学生测验)。
图7
图7。Jmjd3和Uty在分化过程中参与发育基因的调控。
(A) 通过RT-qPCR测量ESCs中Kdm6家族的表达水平,并将其归一化为Rplp0和D02。(B) Jmjd3在D02、KO1和KO2 ESCs中的表达水平。使用文丘林作为负荷控制。(C–D)蛋白质印迹显示所示细胞系中的H3K27me3和H3K4me3水平。微管蛋白和H3被用作负荷控制。(E) 通过RT-qPCR测量并归一化为Rplp0的指示细胞系中Jmjd3-shRNA1和Uty-shRNA2敲除的效率。(F) 所示细胞系的细胞增殖分析。(G) Western blot显示RA分化72h前后所示细胞系中H3K27m3的水平,Utx敲除(KO2)细胞中Utx靶基因的mRNA表达水平,包括和不包括敲除Jmjd3或Uty敲除细胞。所有RT-qPCR均归一化为Rplp0,D02 Scr在T0的表达水平。误差条代表SD,n=3个独立分析(**p<0.005;***p<0.0005,双尾Student检验)。

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