摘要
Tet蛋白氧化5-甲基胞嘧啶（mC）生成5-羟甲基（hmC）、5-甲酰基（fC）和5-羧基胞嘧啶（caC）。这些氧化胞嘧啶碱基的确切功能尚不清楚。我们应用基于质谱的定量蛋白质组学来识别小鼠胚胎干细胞（mESC）、神经祖细胞（NPC）和成年小鼠脑组织中mC和hmC的读取器。这些修饰的读者只是部分重叠，一些读者，如Rfx蛋白，表现出很强的特异性。分化过程中相互作用是动态的，例如Klf4与mC的mESC特异性结合和Uhrf2与hmC的NPC特异性结合就证明了这一点，这表明mC和hmC具有特定的生物学作用。mC的氧化衍生物在小鼠ES细胞中招募不同的转录调节剂以及大量DNA修复蛋白，这意味着DNA损伤反应是活性DNA去甲基化的主要参与者。
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