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.2013年3月;9(3):361-73.
doi:10.4161/auto.23066。 Epub 2013年1月4日。

非协调51样激酶1和2对营养素敏感自噬的调节

附属公司

非协调51样激酶1和2对营养素敏感性自噬的调节

菲奥娜·麦克阿尔宾等。 自噬. 2013年3月.

摘要

大自噬,通常被称为自噬(autophagy),是一种蛋白质降解途径,在细胞中组成性发生,但也可能由营养缺乏或蛋白质聚集等应激因素诱导。自噬与多种疾病机制有关,包括神经变性和癌症,具有抑癌和致癌作用。非协调51样激酶1(Uncoordinated 51 like kinase 1,ULK1)是一种重要的自噬蛋白,位于层级调控通路的顶点附近,接收来自主营养传感器MTOR和AMP-activated protein kinase(AMPK)的信号。在哺乳动物中,ULK1有一个密切的同源物ULK2,尽管它们的功能区别尚不清楚。在这里,我们表明ULK1和ULK2都支持营养素饥饿后的自噬激活。只有在小鼠胚胎成纤维细胞中ULK1和ULK2的联合缺失时,氨基酸或葡萄糖饥饿后增加的自噬才会被破坏。联合Ulk1/2双敲除阻断了氨基酸饥饿后PtdIns3P的生成和WIPI2或ZFYVE1/DFCP1向吞噬细胞的招募。葡萄糖饥饿后的自噬激活并不涉及WIPI1或WIPI2的募集以形成自噬体。与PtdIns3P非依赖性机制一致,葡萄糖依赖性自噬对沃特曼宁具有耐药性。我们的研究结果支持ULK1和ULK2在营养依赖性自噬激活方面的功能冗余,并进一步强调了对氨基酸和葡萄糖缺乏反应的差异途径。

关键词:MEF;ULK1;ULK2;WIPI1;WIPI2;淘汰赛;营养缺乏。

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数字

无
图1。在氨基酸饥饿后,ULK1和ULK2的缺失会抑制自噬。(A类)野生型(WT),乌尔克1敲除(ULK1KO),Ulk2公司击倒(ULK2KO)和两个独立推导的乌尔克1/Ulk2公司用含50nM巴非霉素A的全营养培养基(F)、EBSS(-AA)或EBSS处理双敲除(DKO)MEF株系1(Baf)2 h。用针对ULK1、肌动蛋白和LC3(纳米工具5F10单克隆)的抗体对溶解的细胞裂解物进行免疫印迹。“*”表示ULK1免疫印迹上的非特异性带。用SV40 T抗原永生化MEF株。下图:LC3-II/LC3-I信号用2种不同的y轴标度绘制为平均值±SEM(n=4)。在相同条件下,对WT MEF值进行双尾配对t检验:*p<0.04**p<0.005;p=0.14;b条p=0.056;c(c)p=0.12。(B类)从MEF株系中提取总RNA,如(A类)并分析了乌尔克1Ulk2公司转录水平使用定量RT-PCR。绘图显示乌尔克1Ulk2公司标准化为的级别肌动蛋白转录水平(平均±SEM,(n=3),与WT细胞相关的值)。(C类)WT和DKO MEF线被视为(A类)用磷酸化-(Ser79)乙酰辅酶A羧化酶(P-ACC)、磷酸化-核糖体蛋白S6(P-RPS6)抗体对溶解的细胞裂解物进行免疫印迹;肌动蛋白和LC3(5F10单克隆抗体)。(D类)在裂解和免疫印迹分析之前,将MEF系置于全营养培养基(F)或葡萄糖饥饿(−Glc)中16 h,如(C类). (E类)用C14缬氨酸稳态标记MEF系过夜,追踪24小时,并分析氨基酸饥饿2小时内的蛋白质降解情况。图中显示了平均±SEM(n=3)。对WT MEF进行双尾配对t检验:*p<0.02**p<0.01。(F类)WT和乌尔克DKO#1 MEF被视为(A类)固定2h,进行LC3免疫染色。所示为−AA和−AA+Baf条件的典型共焦图像。比例尺:10μm。图中显示了平均点/细胞±SEM(每列:两个实验中每种条件下的n=22至39个细胞)。在相同条件下与WT MEF比较时的双尾配对t检验:***p<0.0003*p<0.02。(G公司)初级WT和DKO MEF处于饥饿状态,如(A类)并裂解用于SQSTM1和肌动蛋白的免疫印迹分析。右:绘图密度测定法[SQSTM1水平归一化为肌动蛋白,显示为平均值±SEM(n=4)]。在相同条件下与WT MEFs比较时的双尾配对t检验:*p<0.04,**p<0.01。
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图2。ULK1和ULK2都是在氨基酸饥饿后形成WIPI2斑点所必需的。(A类)WT、ULK1KO、ULK2KO和DKO原发性MEF在固定前用全营养培养基(F)或EBSS(−AA)处理2 h。然后用WIPI2抗体对细胞进行染色。(B类)在每种情况下的10个字段中(两个独立实验),对Hoechst染色的细胞核(细胞数)和WIPI2点进行量化(WIPI2点状/细胞±SEM)(n=20个字段)。F和−AA之间的差异通过使用Bonferroni事后检验的单向ANOVA表示为*****p<0.0001,无显著性差异。(C类)主要MEF系按(A类). 对细胞裂解物进行ULK1、WIPI1、WIPI2和肌动蛋白的免疫印迹。(D类)将稳定表达GFP-ZFYVE1的WT和DKO#1永生化细胞置于全营养培养基(F)或EBSS(−AA)中培养2h,然后固定。(A和D)比例尺:10μm。图中显示了点状/细胞(两个实验中每个条件下n=29到37个细胞的平均±SEM)。在相同条件下,与WT MEF相比的双尾配对t检验:***p<0.0001。
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图3。ATG13击倒现象乌尔克1/Ulk2公司氨基酸饥饿后LC3脂质代谢途径的双重敲除。(A类)用RISC-Free对照或小鼠转染WT和DKO原代MEF附件13-靶向siRNA。敲除后,用全营养培养基(F)、EBSS(−AA)或含有巴非霉素A的EBSS处理细胞1(−AA+Baf)(100 nM)2 h。用针对ULK1、ATG13、肌动蛋白和LC3(Abcam多克隆)的抗体对溶解的细胞裂解物进行免疫印迹。(B类)平均LC3-II/肌动蛋白密度测定±SEM(n=4)。在相同条件下,相对于WT RISC游离siRNA MEFs进行双尾配对t检验:p=0.067;b条p=0.068;c(c)p=0.089。
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图4。ATG13击倒现象乌尔克1/Ulk2公司氨基酸饥饿后WIPI2-阳性自噬体膜形成的双重敲除。WT、ULK1KO、ULK2KO和DKO主要MEF通过RISC-Free对照或小鼠转染附件13-靶向siRNA。敲除后,细胞在固定前用全营养培养基(F)或EBSS(−AA)处理2小时。用针对WIPI2的抗体对细胞进行染色。比例尺:10μm。
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图5。组合乌尔克1Ulk2公司敲除降低LC3对葡萄糖饥饿的脂质代谢反应。(A类)将WT或DKO初级MEF处理为全营养培养基(F)、无葡萄糖条件(−Glc)或无葡萄糖培养基+巴非霉素A1(−Glc+Baf)(100 nM)持续24 h。用ULK1、肌动蛋白和LC3(Abcam多克隆)抗体对溶解的细胞裂解物进行免疫印迹。“*”表示非特异性带。(B类)用密度计定量LC3-II和肌动蛋白信号。结果显示为平均值±SEM(n=4)。在相同治疗下,对WT MEF进行双尾配对t检验:*p<0.02。
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图6。葡萄糖饥饿不会刺激含有WIPI2的膜的生成。WT、ULK1KO、ULK2KO和DKO初级MEF用全营养培养基(Fed)或无葡萄糖培养基(葡萄糖饥饿)处理24 h,然后固定。用WIPI2抗体对细胞进行染色。比例尺:10μm。
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图7。葡萄糖饥饿后LC3脂质化和自噬体形成是PtdIns3P非依赖性的。(A类)将WT初级MEF用含有100 nM沃特曼(−AA+Wm)的全营养培养基(F)、EBSS(−AA)或EBSS处理2 h。或者,将细胞在无葡萄糖培养基(−Glc)或含有100 nM沃特曼的无葡萄糖培养液中培养24 h。用LC3(Abcam多克隆)和肌动蛋白抗体对溶解的细胞裂解物进行免疫印迹。结果显示为平均LC3-II/actin±SEM(n=4)。在不含沃特曼的等效治疗条件下进行双尾配对t检验:*p<0.04。(B类)用全营养培养基(F)或EBSS(−AA)处理WT(永生化)MEF 2 h。或者,将细胞在无葡萄糖培养基(−Glc)中培养16 h。如有指示,培养包括100 nM沃特曼(+Wm)。细胞经LC3免疫染色处理后固定。所示为−AA和−Glc条件±沃特曼的典型共焦图像。比例尺:10μm。图中显示了每个条件的点状/单元分布。每列代表一个细胞的定量(40-60个细胞/条件取自两个实验)。所示为每组中包含15个(或更多)点/单元格的单元格百分比。
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图8。葡萄糖饥饿后无WIPI1-和WIPI2-阳性自噬体膜。WT初级MEF在全营养培养基(Fed)、EBSS(−AA)或含有100 nM沃特曼(−AA+Wm)的EBSS中培养2小时。或者,在固定之前,细胞在没有或含有100 nM沃特曼宁(−Glc,−Glc+Wm。用WIPI2(红色)和WIPI1(绿色)抗体对细胞进行染色。比例尺:10μm。放大的插图显示了氨基酸饥饿后的WIPI2和WIPI1共定位(箭头:强共定位;箭头:部分)。

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